2018 Fiscal Year Final Research Report
Establishment of proteomics analysis methods using RNA-seq in the personal genomic era
| Project/Area Number |
16K00416
|
|---|
| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
|
| Allocation Type | Multi-year Fund |
|---|
| Section | 一般 |
|---|
| Research Field |
Life / Health / Medical informatics
|
|---|
| Research Institution | 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等) |
|---|
Principal Investigator |
Kawano Shin 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等), データサイエンス共同利用基盤施設, 客員准教授 (40470075)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
|
| Keywords | プロテオーム / パーソナルゲノム |
|---|
| Outline of Final Research Achievements |
In this research project, I examined effective analysis methods of proteome data including mutations, such as human personal proteome and cancer proteome obtained using a mass spectrometer. By analyzing proteome data using a protein sequence database considering mutations, which was created by detecting mutations from DNA / RNA sequences using a next-generation sequencer, it became possible to detect peptides containing sample-specific mutations which has not been possible to detect using conventional methods.
|
| Free Research Field |
バイオインフォマティクス
|
| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
さまざまなゲノムの変異が病気に関係しているが、実際に生体内で作用して機能を担っているのは発現しているタンパク質である。変異を含むタンパク質を検出可能にすることは、病気に関係するバイオマーカーの発見や創薬につながる。今後、次世代シーケンサーならびに質量分析計の測定精度がますます向上していくと予想され、“個人”のマルチオミクス情報を組み合わせた解析は、precision medicineを実現する上で必要不可欠なものになると期待される。
|
