2017 Fiscal Year Research-status Report
水とイオンが駆動するタンパク質高次構造形成の統計力学
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16K05519
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| Research Institution | Kyushu University |
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Principal Investigator |
吉田 紀生 九州大学, 理学研究院, 准教授 (10390650)
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2016-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | ドメインスワッピング / 多量体形成 / シトクロームC / ３D-RISM / MDシミュレーション |
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| Outline of Annual Research Achievements |
３D-RISM理論とMDシミュレーションを用いてシトクロームCドメインスワップ二量体の構造安定セインについての解析を行い、二量体構造における安定化の要因を、自由エネルギー成分解析によって明らかにした。自由エネルギー成分解析では、自由エネルギーを線形応答理論に基づいて各残基の寄与に分割して解析することで、ユニットを結ぶヒンジループ部位が二量体安定化に寄与していることが分かった。結果はJournal of Chemical Physics誌にて発表した。
また、実験によって示唆されている陰イオンの添加による二量体構造安定性の変化についての解析にも着手した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
シトクロームC二量体構造における安定化の要因を解明し、国際誌にて成果を発表することができた。
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| Strategy for Future Research Activity |
陰イオンの多量体形成に与える影響を明らかにするため、各種陰イオンを含めたMDシミュレーションおよび３D-RISM計算を行う。
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| Causes of Carryover |
国際学会招待講演依頼があったため、予定していた国際学会への出張を取りやめたことで予算使用額が減ったため。当該学会に類する学会での発表を次年度に行う予定である。
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