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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Theoretical Study on Relation of Base sequence and Electronic Structures toward Elucidation of Mechanism of DNA Electric Conductivity.

Research Project

Project/Area Number 16K05666
Research InstitutionJosai University

Principal Investigator

寺前 裕之  城西大学, 理学部, 教授 (10383176)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Keywords結晶軌道法 / ポリディヌクレオチド / 電子状態 / 電気伝導性 / 価電子帯 / 伝導帯 / ポリモノヌクレオチド / らせん構造
Outline of Annual Research Achievements

前年度までに行ったポリモノヌクレオチドの電子状態に加えて、ポリディヌクレオチドを加えて総合的にDNAモデルとしてのポリマーの電子状態について計算を行い、これらのポリマーの電気伝導性発現機構について考察した。最も簡単なB型DNAモデルとしてのポリモノヌクレオチド、poly-(dG)poly-(dC)およびpoly-(dA)poly(dT)ポリマー、並びにポリディヌクレオチド、poly-(dG-C)poly(dG-C)、poly-(dA-G)poly(dC-T)、(dA-C)poly(dG-T)、(dA-T)poly(dA-T)、の計6種類について電子状態計算を行ってバンド構造の解析を行った。ここでGはグリシン、Cはシトシン、Aはアデニン、Tはチミン塩基から派生するユニットを示している。
バンドギャップは有機半導体として良く知られているポリアセチレンなどに比べても小さな値となっており、この結果から電気伝導性が発現する可能性が高い事が示唆される。
価電子帯の上端については、グアニン・シトシン対が多く含まれているほど大きな値を持つ。従ってホールはグアニン・シトシン対が多く含まれるほど生成しやすいと考えられる。一方、ホールの動きやすさを示す有効質量を計算してみるとアデニン・チミン対が多いほど小さな値となっており、ホールの移動度については、アデニン・チミン対が多い方が有利となる。伝導体下端については価電子帯上端のような規則性は見られないが、これについては基底関数が不十分である可能性が高いと思われる。なお伝導帯下端は非常に小さな値となっておりホールだけでなくエレクトロン伝導の可能性も考えられる。
以上のように、DNAにおける電気伝導性発現が理論的にも強く示唆される結果となった。

  • Research Products

    (11 results)

All 2018

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 3 results)

  • [Journal Article] Ab initio electronic structure calculation of polymononucleotide, a model of B-type DNA2018

    • Author(s)
      Teramae Hiroyuki、Aoki Yuriko
    • Journal Title

      AIP Conference Proceedings

      Volume: 2040 Pages: 020013

    • DOI

      https://doi.org/10.1063/1.5079055

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DNAの電子状態計算2018

    • Author(s)
      寺前 裕之, 青木 百合子
    • Journal Title

      J. Comp. Chem. Jpn.

      Volume: 16 Pages: 157-159

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] フェルラ酸のフリーラジカル消去能に関する理論的研究2018

    • Author(s)
      寺前 裕之, 玄 美燕, 山下 司, 高山 淳, 岡﨑 真理, 坂本 武史
    • Journal Title

      J. Comp. Chem. Jpn.

      Volume: 17 Pages: 150-152

  • [Journal Article] Practical Training in Simple Huckel Theory: Matrix Diagonalization for Highly Symmetric Molecules and Visualization of Molecular Orbitals2018

    • Author(s)
      Shin-ichi Nagaoka, Tatsunobu Kokubo, Hiroyuki Teramae, Umpei Nagashima
    • Journal Title

      J. Chem. Educ.

      Volume: 95 Pages: 1579-1586

  • [Presentation] Ab Initio Electronic Structure Calculation of Polymononucleotide, a Model of B-type DNA2018

    • Author(s)
      Hiroyuki Teramae, Yuriko Aoki
    • Organizer
      ICCMSE2018
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] フェルラ酸のフリーラジカル消去能に関する理論的研究2018

    • Author(s)
      寺前裕之,玄美燕, 山下司, 高山淳, 岡﨑真理, 坂本武史
    • Organizer
      日本コンピュータ化学会
  • [Presentation] Ab Initio Calculation of Polymononucleotide, a Model of B-type DNA2018

    • Author(s)
      Hiroyuki Teramae, Yuriko Aoki
    • Organizer
      French-Japanese Workshop on Computational Methods in Chemistry
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Ab Initio Study of Polymononucleotide as a Model of B-type DNA2018

    • Author(s)
      Hiroyuki Teramae, Yuriko Aoki
    • Organizer
      ICQC2018
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] モデルDNAのHartree-Fock計算(2)2018

    • Author(s)
      寺前裕之、青木百合子
    • Organizer
      分子科学討論会
  • [Presentation] フェルラ酸の抗酸化作用の置換基効果に関する理論的研究2018

    • Author(s)
      寺前裕之,玄美燕, 山下司, 高山淳, 岡﨑真理, 坂本武史
    • Organizer
      ケモインフォマティクス討論会
  • [Presentation] 結晶軌道法によるモデルDNAの電子状態計算2018

    • Author(s)
      寺前裕之
    • Organizer
      琉球大学計算科学シンポジウム
    • Invited

URL: 

Published: 2019-12-27  

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