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2016 Fiscal Year Research-status Report

サーマルプログラミングによる蛋白質ナノブロックの逐次的自己組織化基盤技術の開発

Research Project

Project/Area Number 16K05841
Research InstitutionShinshu University

Principal Investigator

新井 亮一  信州大学, 学術研究院繊維学系, 准教授 (50344023)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Keywords人工蛋白質設計 / タンパク質ナノブロック PN-Block / 蛋白質工学 / 蛋白質安定性 / X線結晶構造解析 / ナノバイオテクノロジー / 超分子化学 / 自己組織化
Outline of Annual Research Achievements

近年、私達は、独自のヌンチャク型二量体人工蛋白質を利用した蛋白質ナノブロックを開発し、樽型6量体及び正四面体型12量体の超分子ナノ構造複合体の構築に成功した(JACS 2015)。さらに、複雑な構造を構築するためには、段階的に秩序だって自己組織化する技術の開発が必要である。そこで、本研究では、複数の温度で可逆的に熱変性・再生する蛋白質ナノブロックを開発し、サーマルサイクラーによる温度変化プログラミングにより逐次的に自己組織化させる基盤的技術を開発することを目的としている。これにより、蛋白質ナノブロックを利用して、より複雑で高度なナノ構造複合体を作製する独自の分子技術開発の可能性が広がり、ナノテクノロジーの発展への貢献が大いに期待できる。
そこで、まず、蛋白質ナノブロックによるナノ構造構築技術の高度化を図るために、異なる変性温度で可逆的熱変性するヌンチャク型二量体人工蛋白質の開発及び安定化機構解析を行った。特に平成28年度は、Tmが75℃と120℃の間のヌンチャク型二量体人工蛋白質を開発するために、以前の予備実験で同時に変異させた5つのアミノ酸のうち、1~2アミノ酸を個別に置換した変異体をそれぞれ作成し、発現精製後、CD測定により変性温度の測定を行った。その結果、変性温度が83℃、84℃、85℃、101℃の人工蛋白質変異体が得られ、WA20の75℃やSUWA (Super WA20)の約120℃とも変性温度が異なり、かつ可逆的熱変性が可能なヌンチャク型二量体人工蛋白質のラインナップの充実に成功した。また、今後、これらの変性温度の異なる変異体を合理的に設計開発するために、SUWA人工蛋白質のX線結晶構造解析に成功し、立体構造に基づいて熱安定化機構の理解が大きく進展した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

研究実施計画において平成28年度に予定していた、異なる変性温度で可逆的熱変性するヌンチャク型二量体人工蛋白質の開発及び安定化機構解析の実験はおおむね実施することができた。ここまでの研究成果を現在取りまとめ中で、これから論文を執筆するところである。また、いくつか予想以上の興味深い実験結果も得られているため、これらの結果については、今後、さらなる検討も必要と考えられる。

Strategy for Future Research Activity

異なる変性温度で可逆的熱変性・再生する蛋白質ナノブロックを開発し、サーマルプログラミングにより逐次的に自己組織化する基盤技術を開発する蛋白質ナノブロックによるナノ構造構築技術の高度化の目的を達成するため、今後さらに、異なる変性温度で可逆的に熱変性・再構成する自己組織化蛋白質ナノブロックの開発や、サーマルプログラミングによる蛋白質ナノブロックの逐次的自己組織化ナノ構造構築及び構造解析を進めて、研究を推進する予定である。

Causes of Carryover

平成28年度は、現有や共有の設備や余剰の消耗品等を最大限に活用して研究を進めて、研究費の効率的な使用や節約に努めた結果、非常に費用対効果の高い成果を上げることができた。これは、基金制度の趣旨やメリットを活かして、限られた研究費を、研究期間全体を考えながら、メリハリを利かせて効果的に使用することを意識して努力した結果である。また、いくつか予想外の興味深い実験結果も見られたため、それらの結果をさらに追究して理解を深めることが必要であると考えられたので、28年度の本研究経費での学会参加発表や論文発表等を意図的に控えたが、今後、積極的に多くの学会参加発表や論文発表を予定しているため、その経費分を次年度に繰り越した。

Expenditure Plan for Carryover Budget

次年度使用額はH29年度請求額と合わせて、機器や試薬等の物品や学会参加に伴う参加費・旅費、論文の英文校閲や掲載料等に使用する予定である。

  • Research Products

    (34 results)

All 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (3 results) (of which Open Access: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results,  Peer Reviewed: 1 results) Presentation (25 results) (of which Int'l Joint Research: 8 results,  Invited: 13 results) Remarks (4 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Princeton University(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Princeton University
  • [Journal Article] Design and construction of self-assembling supramolecular protein complexes using artificial and fusion proteins as nanoscale building blocks2017

    • Author(s)
      Naoya Kobayashi, Ryoichi Arai
    • Journal Title

      Current Opinion in Biotechnology

      Volume: 46 Pages: 57-65

    • DOI

      10.1016/j.copbio.2017.01.001

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] 人工蛋白質で「かたち」をつくろう―ブロック遊びしようよ!―2016

    • Author(s)
      小林直也,新井亮一
    • Journal Title

      生物工学会誌

      Volume: 94 Pages: 270

    • Open Access
  • [Journal Article] バイナリーパターン配列デザインによるデノボ蛋白質の創出と蛋白質ナノブロックによる超分子複合体の創生2016

    • Author(s)
      小林直也,木村尚弥,新井亮一
    • Journal Title

      生物工学会誌

      Volume: 94 Pages: 485-488

    • Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Self-assembling supramolecular nanostructures created from de novo protein nanobuilding blocks2017

    • Author(s)
      Naoya Kimura, Naoya Kobayashi, Ryoichi Arai
    • Organizer
      Okazaki Conference 2017 on Grand Challenges in Small-angle Scattering
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県岡崎市)
    • Year and Date
      2017-03-20
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] pH-dependent structural transition of self-assembling nanostructures constructed from protein nanobuilding blocks using a dimeric de novo protein2017

    • Author(s)
      Naoya Kobayashi, Takuya Sengoku, Takaaki Sato, Ryoichi Arai
    • Organizer
      Okazaki Conference 2017 on Grand Challenges in Small-angle Scattering
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県岡崎市)
    • Year and Date
      2017-03-19
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] タンパク質ナノブロックによる動的秩序構造形成2017

    • Author(s)
      木村尚弥、小林直也、新井亮一
    • Organizer
      日本化学会第97春季年会
    • Place of Presentation
      慶応大学(横浜市)
    • Year and Date
      2017-03-16
    • Invited
  • [Presentation] Self-assembling supramolecular nanostructures created from de novo protein nanobuilding blocks2017

    • Author(s)
      Ryoichi Arai
    • Organizer
      11th Annual Symposium on Nanobiotechnology 2017
    • Place of Presentation
      川崎市産業振興会館(川崎市)
    • Year and Date
      2017-02-28
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 人工タンパク質ナノブロック(PN-Block)による自己組織化超分子ナノ構造複合体の創製:“ネオバイオ分子”創出へ向けて2017

    • Author(s)
      新井亮一
    • Organizer
      平成28年度第3回富山大学テニュアトラックセミナー
    • Place of Presentation
      富山大学(富山市)
    • Year and Date
      2017-02-03
    • Invited
  • [Presentation] Dynamical Ordering Nanostructures Constructed from Protein Nanobuilding Blocks2017

    • Author(s)
      Naoya Kimura, Naoya Kobayashi, Ryoichi Arai
    • Organizer
      The 5th International Symposium of Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都目黒区)
    • Year and Date
      2017-01-22
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 人工蛋白質ナノブロックによる多様な自己組織化超分子ナノ構造複合体:ネオバイオ超分子の創生を目指して2016

    • Author(s)
      小林直也、木村尚弥、新井亮一
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2016-12-02
    • Invited
  • [Presentation] 蛋白質ナノブロック用超安定化人工蛋白質SUWA (Super WA20)の特性解析及び構造解析2016

    • Author(s)
      木村尚弥、小林直也、新井亮一
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2016-12-01
  • [Presentation] 人工タンパク質をブロックに見立てた超分子ナノ構造複合体の設計構築2016

    • Author(s)
      小林直也、木村尚弥、新井亮一
    • Organizer
      第54回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場(つくば市)
    • Year and Date
      2016-11-25
    • Invited
  • [Presentation] De Novo Protein Nano-Building Block Approach for “Synthetic Structural Biology” to Create Artificial Supramolecular Protein Complexes2016

    • Author(s)
      Ryoichi Arai, Naoya Kimura, Naoya Kobayashi, Michael H. Hecht
    • Organizer
      THE 42nd NAITO CONFERENCE ON In the Vanguard of Structural Biology: Revolutionizing Life Sciences
    • Place of Presentation
      CHATERAISE Gateaux Kingdom SAPPORO, Sapporo, Japan
    • Year and Date
      2016-10-06
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 蛋白質ナノブロック用超安定化人工蛋白質SUWA (Super WA20)の特性解析及び構造解析2016

    • Author(s)
      木村尚弥、小林直也、新井亮一
    • Organizer
      第68回日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      富山国際会議場(富山市)
    • Year and Date
      2016-09-29
  • [Presentation] Self-assembling supramolecular nano-architectures created from de novo protein nano-building blocks2016

    • Author(s)
      Naoya Kimura, Naoya Kobayashi, Ryoichi Arai
    • Organizer
      第68回日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      富山国際会議場(富山市)
    • Year and Date
      2016-09-29
    • Invited
  • [Presentation] Selfassembling supramolecular nanostructures created by de novo extender protein nanobuilding blocks2016

    • Author(s)
      Naoya Kobayashi, Kouichi Inano, Takaaki Sato, Keisuke Miyazawa, Takeshi Fukuma, Michael H. Hecht, Ryoichi Arai
    • Organizer
      第68回日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      富山国際会議場(富山市)
    • Year and Date
      2016-09-29
  • [Presentation] 人工蛋白質ナノブロック(PN-Block)による自己組織化超分子ナノ構造の創製:“合成構造生物学”を目指して2016

    • Author(s)
      小林直也、木村尚弥、新井亮一
    • Organizer
      第28回高遠・分子細胞生物学シンポジウム
    • Place of Presentation
      高遠さくらホテル(長野県伊那市)
    • Year and Date
      2016-08-25
  • [Presentation] 人工蛋白質ナノブロックの設計開発による自己組織化超分子ナノ構造複合体の創出2016

    • Author(s)
      小林直也、新井亮一
    • Organizer
      2016年度日本生物工学会中部支部例会
    • Place of Presentation
      名古屋大学(名古屋市)
    • Year and Date
      2016-08-05
    • Invited
  • [Presentation] タンパク質ナノブロックによる自己組織化超分子複合体の創製2016

    • Author(s)
      新井亮一
    • Organizer
      第48回若手ペプチド夏の勉強会
    • Place of Presentation
      大学セミナーハウス(東京都八王子市)
    • Year and Date
      2016-08-01
    • Invited
  • [Presentation] 超安定化二量体デノボ蛋白質SUWAの創製と蛋白質ナノブロック複合体構築2016

    • Author(s)
      木村尚弥、新井亮一
    • Organizer
      第48回若手ペプチド夏の勉強会
    • Place of Presentation
      大学セミナーハウス(東京都八王子市)
    • Year and Date
      2016-08-01
  • [Presentation] Self-assembling supramolecular nanostructures created by de novo extender protein nano-building blocks2016

    • Author(s)
      Naoya Kobayashi, Kouichi Inano, Takaaki Sato, Keisuke Miyazawa, Takeshi Fukuma, Michael H. Hecht, Ryoichi Arai
    • Organizer
      The 30th Anniversary Symposium of the Protein Society
    • Place of Presentation
      Hyatt Regency Baltimore, Baltimore, MD, USA
    • Year and Date
      2016-07-17
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Super WA20 (SUWA), an ultra-stabilized dimeric de novo protein for self-assembling protein nano-building blocks2016

    • Author(s)
      Naoya Kimura, Naoya Kobayashi, Ryoichi Arai
    • Organizer
      The 30th Anniversary Symposium of the Protein Society
    • Place of Presentation
      Hyatt Regency Baltimore, Baltimore, MD, USA
    • Year and Date
      2016-07-17
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Self-assembling nano-architectures created from a protein nano-building block using an intermolecularly folded dimeric de novo protein2016

    • Author(s)
      Naoya Kobayashi, Keiichi Yanase, Takaaki Sato, Satoru Unzai, Michael H. Hecht, Ryoichi Arai
    • Organizer
      The 30th Anniversary Symposium of the Protein Society
    • Place of Presentation
      Hyatt Regency Baltimore, Baltimore, MD, USA
    • Year and Date
      2016-07-16
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Self-assembling supramolecular nanostructures created from de novo protein nanobuilding blocks2016

    • Author(s)
      小林直也、木村尚弥、新井亮一
    • Organizer
      分子研研究会 超機能分子の創成
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県岡崎市)
    • Year and Date
      2016-06-28
    • Invited
  • [Presentation] ネオバイオ分子の構造機能解析及び設計基盤技術(X線結晶構造解析、タンパク質工学 編)2016

    • Author(s)
      新井亮一
    • Organizer
      第5回ネオバイオ分子研究会
    • Place of Presentation
      鹿児島大学(鹿児島市)
    • Year and Date
      2016-06-10
    • Invited
  • [Presentation] 人工蛋白質ナノブロック(PN-Block)による自己組織化ナノ構造創製:“ネオバイオ分子”創出へ向けて2016

    • Author(s)
      小林直也、木村尚弥、新井亮一
    • Organizer
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡市)
    • Year and Date
      2016-06-09
    • Invited
  • [Presentation] 人工蛋白質ナノブロックの設計開発による自己組織化超分子ナノ構造複合体の創出2016

    • Author(s)
      小林直也、新井亮一
    • Organizer
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡市)
    • Year and Date
      2016-06-08
    • Invited
  • [Presentation] 超安定化二量体人工蛋白質Super WA20 (SUWA)の安定化機構解析と蛋白質ナノブロックへの応用2016

    • Author(s)
      木村尚弥、小林直也、新井亮一
    • Organizer
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡市)
    • Year and Date
      2016-06-08
  • [Remarks] 新井研究室ホームページ

    • URL

      http://fiber.shinshu-u.ac.jp/arai/index.html

  • [Remarks] 小林直也研究員が日本蛋白質科学会で若手奨励賞を受賞

    • URL

      http://www.shinshu-u.ac.jp/institution/iccer/topics/iccer/post-29.html

  • [Remarks] 木村尚弥さん (M2) が分子生物学会で優秀ポスター賞

    • URL

      http://www.shinshu-u.ac.jp/faculty/textiles/news/2016/12/76140.html

  • [Remarks] 繊維学部 新井亮一准教授らがまとめた、人工タンパク質超分子複合体構築に関する総説が掲載

    • URL

      http://www.shinshu-u.ac.jp/topics/2017/02/-current-opinion-in-biotechnology.html

  • [Patent(Industrial Property Rights)] ドメインスワップ二量体人工タンパク質2017

    • Inventor(s)
      新井亮一,木村尚弥,小林直也
    • Industrial Property Rights Holder
      信州大学
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2016-101203
    • Filing Date
      2017-05-20

URL: 

Published: 2018-01-16   Modified: 2022-02-16  

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