口腔粘膜における超低頻度の突然変異頻度解析による口腔・食道発がんの総合リスク評価

2016 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 16K07155
• Research Institution: National Cancer Center Japan
• Principal Investigator: 山下 聡 国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, ユニット長 (80321876)
• Project Period (FY): 2016-04-01 – 2019-03-31
• Keywords: 突然変異 / 食道 / 口腔粘膜

Outline of Annual Research Achievements

初年度であるH28年度は、まず、申請者が新規に開発した超低頻度の点突然変異頻度解析法（特願2015-199342）の改良を行った。シークエンシングエラーの少ない領域として解析に用いる領域ををこれまでの合計15,724塩基から15,552塩基に修正した。
続いて口腔、食道がん因子曝露歴のある健常人１例の舌背部、右側口腔、左側口腔の各粘膜から抽出したゲノムDNAについて点突然変異頻度を解析した。その結果、点突然変異頻度はそれぞれ2.5, 2.4, 2.1 (x10-5/bp) を示した。これらは食道がん患者の食道がん非がん部の突然変異頻度である2.4 x10-5/bpと同等の高値であった。また、口腔粘膜の塩基置換のプロファイルについて解析したところ、90%以上がTransition変異であり、食道粘膜の塩基置換のプロファイルとよく類似していた。口腔粘膜は外界や食物などによるストレスに食道の前に晒されることから、点突然変異は食道粘膜より高レベルで同様のプロファイルを示すと予想されたが、その予想を支持する結果が示された。
今後より多くのサンプルについて解析し、食道発がんリスクと口腔粘膜の点突然変異頻度との関係を明らかにする。

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

口腔粘膜の突然変異頻度の解析を開始しているが、サンプルの収集が遅れている。

Strategy for Future Research Activity

食道および口腔粘膜のサンプルの収集が遅れているので、一部解析した結果を示すことにより促進する。
収集したサンプルについて、突然変異頻度の測定を進める。

Research Products

• [Presentation] Contribution of genetic and epigenetic alteration to cancer risk is different in different tissues (2016)
  • Author(s): Satoshi Yamashita, Takayoshi Kishino, Taichi Shimazu, Hadrien Charvat, Takeshi Nakajima, Yi-Chia Lee, Masahiro Maeda, Naoko Iida, Reiko Nagano, Shoichiro Tsugane, Ming-Shiang Wu and Toshikazu Ushijima
  • Organizer: The 39th Annual Meeting of The Molecular Biology Society of Japan
  • Place of Presentation: 神奈川県横浜市
  • Year and Date: 2016-11-30 – 2016-12-02
• [Presentation] Normal tissue burden by mutation and methylation provides precision cancer risk diagnosis (2016)
  • Author(s): Satoshi Yamashita, Takayoshi Kishino, Taichi Shimazu, Hadrien Charvat, Takeshi Nakajima, Yi-Chia Lee, Masahiro Maeda, Naoko Iida, Reiko Nagano, Shoichiro Tsugane, Ming-Shiang Wu and Toshikazu Ushijima
  • Organizer: The 75th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
  • Place of Presentation: 神奈川県横浜市
  • Year and Date: 2016-10-06 – 2016-10-08