進行性肺腺がんに対する治療応答性に影響を与える遺伝要因の同定

2017 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 16K07217
• Research Institution: National Cancer Center Japan
• Principal Investigator: 白石 航也 国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, ユニット長 (80609719)
• Project Period (FY): 2016-04-01 – 2019-03-31
• Keywords: 体細胞遺伝子変異 / 治療応答性

Outline of Annual Research Achievements

進行性肺がんや術後に再発を来たした患者の一部は、分子標的薬による劇的な効果が期待されるが、多くの症例は再発し、白金製剤を含む2剤併用療法を受ける。その際、治療前に治療効果を予測できれば、高齢者や病状が思わしくない患者に対する治療方針の一考になると考えられる。そこで2000年から2008年に国立がん研究センター中央病院にて進行肺腺がん症例と診断され、白金製剤を含む2剤併用療法を受けた530例を選別した。症例は、外科的手術を受けた後に再発を来した91例と初診で進行肺腺がんと診断された439例からなり、本研究では初診で進行肺腺がんと診断された症例を解析対象とした。439例の内、病理診断のために採取されかつ余剰生検試料が得られた183例を選択し、FFPEからのDNA抽出を行った。そのうち、Cancer Panelを行うために必要なDNA量 1.5ng/ul 8ulに満たなかった91例を解析から除外し、92例を Cancer Panelの解析対象とした。昨年度に引き続きCancer Panelを用いて50遺伝子のホットスポット変異を検出するため、全例のシークエンスを行った。Quality Controlをパスした症例は最終的には51例となった。解析対象外になった理由としては、DNAが断片化してしまったため、精度の高いシークエンスデータが得られなかったためである。現在解析が可能だった症例を用いて、検出された遺伝子変異と治療応答性や無再発生存期間との関連解析を実施している。必要に応じて公開データベースや手術後に再発した症例なども参照し、さらなる検証研究の設定が可能かどうかを検討する。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

解析対象となる症例選択が終了し、全例に対してCancer Panelによるシークエンスが完了している。現在、治療応答性と体細胞変異との関連を検討していることから、本研究は概ね順調に推移している。

Strategy for Future Research Activity

今回得られたゲノム情報を基に治療応答性との関連を検討すると共に、公開データベースの活用も検討する。また今回の検討の中で、生検検体から良好なDNA抽出がうまくいかなかった症例があり、約半数の症例についてゲノム解析を実施することができなかった。
状況に応じて症例数をさらに確保するために、術後再発後に化学療法を受けた症例を検証研究に用いることが可能かどうか検討する。

Causes of Carryover

今回次年度使用額が少額であるため、翌年度の使用には計上していない。
また次年度に計上した助成金については、研究計画に従い追加のゲノム解析費用として計上する。

Research Products

• [Journal Article] Common TDP1 Polymorphisms in Relation to Survival among Small Cell Lung Cancer Patients: A Multicenter Study from the International Lung Cancer Consortium. (2017)
  • Author(s): Lohavanichbutr P, Sakoda LC, Amos CI, Arnold SM, Christiani DC, Davies MPA, Field JK, Haura EB, Hung RJ, Kohno T, Landi MT, Liu G, Liu Y, Marcus MW, O'Kane GM, Schabath MB, Shiraishi K, Slone SA, Yang P, Yoshida K, Zhang R, Zong X, Goodman GE, Weiss NS, Chen C.
  • Journal Title: Clin Cancer Res. Volume: 23 Pages: 7550-7557
  • DOI: 10.1158/1078-0432.CCR-17-1401.
  • Peer Reviewed / Int'l Joint Research