2016 Fiscal Year Research-status Report
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16K07247
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| Research Institution | Niigata University |
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Principal Investigator |
矢野 真人 新潟大学, 医歯学系, 准教授 (20445414)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
矢野 佳芳 (早川佳芳) 新潟大学, 医歯学総合研究科, 日本学術振興会特別研究員 (60397320)
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| Project Period (FY) |
2016-10-21 – 2019-03-31
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| Keywords | RNA結合蛋白質 / 翻訳制御 / Ribosomeプロファイル |
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| Outline of Annual Research Achievements |
神経細胞における蛋白質合成は、様々な精神・神経疾患と関わりが強く注目を集めている。その一方で、生理学的条件下の個体レベルでの翻訳制御解析は、他の階層における遺伝子発現解析と比べ技術的に困難であった。本研究では、神経特異的に発現する翻訳制御因子として知られるRNA結合蛋白質Elavlファミリーのうち、特徴的な発現パターンを有するElavl2に着目し、Elavl2欠損マウス脳を研究材料として、Elavl2依存的な翻訳制御プログラムを明らかにする。(1)生体脳における包括的Elavl2-RNA相互作用マップ解析（HITS-CLIP法）を行う。(2)マウス脳から翻訳中mRNAのコード領域の包括的定量的解析技術(in vivoポリソームプロファイリング法)により、生体内翻訳制御解析システムを構築する。以上を組み合わせた統合的解析により、脳内におけるElavl2蛋白質依存的な翻訳制御機構を明らかにする。さらに、Elavl2欠損マウスを用いた、Elavl2標的遺伝子群を介した生物学的意義の解析を行い、翻訳制御による神経細胞機能の解明を目指す。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
平成2８年度には遺伝子改変マウスの繁殖、サンプリングも十分に進み、HITS-CLIP解析および胎児脳から翻訳中mRNAのライブラリーの作成および遺伝子解析手法の立ち上げも順調に進んでいる
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| Strategy for Future Research Activity |
平成28年度に進めた解析データをもとにバイオインフォマティクス解析を実行し、生化学的解析手法の効率を検証する。さらに野生型、Elavl2欠損マウスより得られたデータのバイオインフォマティクス解析へと進める予定である。本年度は、上記より得られたデータを、マウス欠損マウスを用いた下流標的因子の発現検証実験およびモデル化された分子メカニズムについて生化学的検証の実行までを目標としたい。
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Research Products
(8 results)
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[Journal Article] Musashi mediates translational repression of the Drosophila hypoxia inducible factor2016
Author(s)
Bertolin AP, Katz MJ, Yano M, Pozzi B, Acevedo JM, Blanco-Obregon D, Gandara L, Sorianello E, Kanda H, Okano H, Srebrow A, Wappner P
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Journal Title
Nucleic Acids Res.
Volume: 44(16)
Pages: 7555-67
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Establishment of in vitro FUS-associated Familial Amyotrophic Lateral Sclerosis Model Using Human Induced Pluripotent Stem Cells2016
Author(s)
Ichiyanagi N, Fujimori K, Yano M, Ishihara-Fujisaki C, Sone T, Akiyama T, Okada Y, Akamatsu W, Matsumoto T, Ishikawa M, Nishimoto Y, Ishihara Y, Sakuma T, Yamamoto T, Tsuiji H, Suzuki N, Warita H, Aoki M, Okano H
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Journal Title
Stem Cell Reports.
Volume: 6(4)
Pages: 496-510
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Image based identification and targeting of cancer stem cells in pancreatic adenocarcinoma2016
Author(s)
Fox RG, Lytle NK, Jaquish DV, Park FD, Ito T, Bajaj J, Koechlein CS, Yano M, Kopp J, Kritzik M, Sicklick J, Sander M, Shibata S, Valasek M, Sasik R, Scadeng M, Okano H, Kim Y, MacLeod AR, Lowy AM and Reya T
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Journal Title
Nature.
Volume: 534(7607)
Pages: 407-11
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Analysis of induced pluripotent stem cells carrying 22q11.2 deletion2016
Author(s)
Toyoshima M, Akamatsu W, Okada Y, Ohnishi T, Balan S, Hisano Y, Iwayama Y, Toyota T, Matsumoto T, Itasaka T, Sugiyama S, Tanaka M, Yano M, Dean B, Okano H and Yoshikawa T
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Journal Title
Translational Psychiatry
Volume: 6(11)
Pages: e934
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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