• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2016 Fiscal Year Research-status Report

酸素感受性tRNA修飾酵素の反応メカニズム

Research Project

Project/Area Number 16K07311
Research InstitutionNational Institute of Advanced Industrial Science and Technology

Principal Investigator

鴫 直樹  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 創薬基盤研究部門, 主任研究員 (20392623)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
KeywordstRNA / 硫黄 / 鉄硫黄クラスター / 酵素 / タンパク質合成
Outline of Annual Research Achievements

tRNAはタンパク質合成においてコドンとアミノ酸を結び付ける要であり、転写後に化学修飾を受け機能を発揮する。tRNAの硫黄修飾塩基はコドン認識や構造安定化などに必須である。本研究ではその生合成を担う硫黄修飾塩基の生合成機構の解明を目的としている。
これまでに、細胞内の硫黄化合物の生合成には、さまざまな活性化硫黄運搬タンパク質が関与し、反応性の高い硫黄原子を安全かつ確実に硫黄化酵素に伝達していくという概念を提唱している。今回新たに、好熱菌tRNAのs2T54硫黄修飾塩基の生合成に関与する新規タンパク質TtuDを逆遺伝学手法により同定した。試験管内で組換えタンパク質を用いて硫黄転移機構を生化学的に解析し、ペアスルフィド結合タンパク質TtuDの硫黄修飾塩基の生合成における役割をあきらかにした (FEBS Letters, 2016)。生合成の最初の段階ではシステイン脱硫酵素がペアスルフィドを生成する。TtuDはこの硫黄原子を受け取り、効率的にTtuBに伝達する。最終的にTtuBに結合した硫黄原子が硫黄化酵素TtuAによりRNAに導入される。
また共同研究により、tRNA-s2T54硫黄修飾塩基の生合成に関与するRNA硫黄化酵素複合体TtuA-TtuBの構造解析に成功した (Acta Crystallographica Section F, 2016)。TtuA-TtuBの立体構造情報に基づいて、酸素感受性という特徴をもつ新規硫黄化反応について解析を行った。無酸素下で生化学的に解析し、酸素感受性の鉄硫黄クラスターが硫黄化反応に必須であることをあきらかにした。また共同研究により、EPR分光法・補酵素を含む構造解析を行い、TtuAによる新規の硫黄転移機構を提唱した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

新規硫黄運搬タンパク質TtuDを同定し、その機能をあきらかにすることにより、細胞内硫黄化合物の生合成機構に共通する概念を提唱できた。またRNA硫黄化反応についても、とても難易度の高い無酸素条件下での解析法を確立することに成功し、立体構造に基づいて新規の反応機構を提唱することができた。

Strategy for Future Research Activity

基本的には研究実施計画に沿って研究を遂行する。それに加えて、新規の反応機構の一般性についても解析を進めたい。また真核生物の硫黄化反応系についての研究実施も予定している。タンパク質の不安定性等により実施が困難な場合には、進化的に類似していると考えられる古細菌のタンパク質を用いて解析することも考えている。

Causes of Carryover

予定より安価に試薬等を購入できたため。

Expenditure Plan for Carryover Budget

今後の研究の推進方策欄に記した研究内容に必要な研究費(実験試薬および消耗品)として使用する。

  • Research Products

    (9 results)

All 2017 2016 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Crystallographic study of the 2-thioribothymidine-synthetic complex TtuA-TtuB from Thermus thermophilus2016

    • Author(s)
      陳 明皓、奈良井 峻、大村 直毅、鴫 直樹、チムナロン サリン、田中 良和、姚 閔
    • Journal Title

      Acta Crystallographica Section F-Structural Biology Communication

      Volume: F72 Pages: 771-781

    • DOI

      10.1107/S2053230X16014242

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification of a rhodanese-like protein involved in thiouridine biosynthesis in Thermus thermophilus tRNA2016

    • Author(s)
      鴫 直樹、朝井真一、渡辺 公綱
    • Journal Title

      FEBS letters

      Volume: 590(24) Pages: 4628-4637

    • DOI

      10.1002/1873-3468.12499

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] tRNA硫黄修飾酵素の解析およびその応用2017

    • Author(s)
      姫野 美沙緒、鴫 直樹
    • Organizer
      SAT テクノロジー・ショーケース2017
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場 (茨城県・つくば市)
    • Year and Date
      2017-01-31 – 2017-01-31
  • [Presentation] 生命の中枢をささえるRNA硫黄化のしくみ2016

    • Author(s)
      鴫 直樹
    • Organizer
      第7回 連合農学研究科セミナー
    • Place of Presentation
      岐阜大学 (岐阜県・岐阜市)
    • Year and Date
      2016-11-22 – 2016-11-22
    • Invited
  • [Presentation] 好熱菌tRNA硫黄修飾塩基の生合成機構2016

    • Author(s)
      朝井真一 、渡辺 公綱、鴫 直樹
    • Organizer
      第89回 日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      東北大学 (宮城県・仙台市)
    • Year and Date
      2016-09-27 – 2016-09-27
  • [Presentation] Biosynthesis of Sulfur-modification of tRNA in a Thermophilic Bacterium, Thermus thermophilus2016

    • Author(s)
      朝井真一 、渡辺 公綱、鴫 直樹
    • Organizer
      11th International Congress on Extremophile
    • Place of Presentation
      京都大学 (京都府・京都市)
    • Year and Date
      2016-09-13 – 2016-09-13
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] バクテリアにおける二機能性ユビキチン様タンパク質の機能調節の構造基盤2016

    • Author(s)
      陳 明皓、奈 良井 峻、大村 直毅、鴫 直樹、田中 良和、姚 閔
    • Organizer
      第16回 日本蛋白質科学会 年回
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場 (福岡県・博多市)
    • Year and Date
      2016-06-08 – 2016-06-08
  • [Book] RNA Technologies: Modified Nucleic Acids in Biology and Medicine2016

    • Author(s)
      鴫 直樹
    • Total Pages
      453 (55-71)
    • Publisher
      Springer
  • [Remarks] 産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門 研究グループ紹介 最先端バイオ技術探究グループ

    • URL

      https://unit.aist.go.jp/brd/jp/groups/lbrg/lbrg.html

URL: 

Published: 2018-01-16  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi