2018 Fiscal Year Annual Research Report
Conformation analysis and target molecule identification of PF1171 hexapeptides in vivo
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16K07707
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| Research Institution | Mie University |
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Principal Investigator |
増田 裕一 三重大学, 生物資源学研究科, 准教授 (90617755)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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| Keywords | 有機化学 / 環状ペプチド / カイコ / 立体配座 / NMR |
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| Outline of Annual Research Achievements |
環状ペプチドPF1171類は、カイコに対して経口投与で麻痺を引き起こす。環状ペプチドの立体配座は活性発現と密接に関係していることから、生体環境中ならびに標的分子結合時の立体配座の解明は、高活性類縁体の合理的設計につながる。本研究では、PF1171類を安定同位体標識して生体環境中での立体配座を核磁気共鳴（NMR）により解析するとともに、アフィニティー精製や光親和性標識法を用いてPF1171類の標的分子を同定することにより、PF1171類がどのような立体配座をとることによりカイコ体内を巡り、標的分子と結合するかを解明することを目的としている。
H29年度までに、アミド窒素を15N標識したPF1171Fを調製し、リン酸緩衝液（カイコ血液と同じpH6.8）中でのアミドプロトンの様子をNMRにより解析した。その結果、PF1171Fの水系溶媒での立体配座は、有機溶媒中のものとは全く異なることが判明した。しかしながら、その立体配座がどのようなものかを解明することは困難であった。H30年度は、水溶性を向上させたPF1171F類縁体を設計・合成することにより、水中における立体配座のNMR解析を目指した。側鎖に水酸基を導入した水溶性類縁体2種を設計・合成した。合成した類縁体2種の水溶性は、PF1171Fよりも7倍程度向上していた。重クロロホルム中の構造をNMRで解析したところ、PF1171Fと同様の立体配座を形成していることが明らかになった。
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