2017 Fiscal Year Research-status Report
複数遺伝子座の分析に基づくサケ科魚類5種の比較系統地理
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16K07884
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| Research Institution | Fisheries Research and Education Agency |
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Principal Investigator |
山本 祥一郎 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 中央水産研究所, グループ長 (20392897)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
佐藤 俊平 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 北海道区水産研究所, グループ長 (70425461)
森田 健太郎 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 北海道区水産研究所, 主任研究員 (30373468)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | カラフトマス / 系統地理 / ミトコンドリアDNA |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本課題では、サケ科魚類複数種を対象とした標本採集調査、mtDNA塩基配列データを蓄積していくとともに、サケおよびカラフトマスではSNP分析、サクラマスとイワナ類ではmsDNA分析を指標とした遺伝子分析を実施する。複数遺伝子座のデータをもとに、距離による隔離構造の有無、放流河川における遺伝的構造の変化、種内系統群間の分化年代等を検討するとともに、最終的にはデータを統合しサケ科魚類5種を対象とした比較系統地理研究を展開する。今年度はカラフトマスを対象としてミトコンドリアDNA塩基配列分析による集団構造解析を行った。連続する2年間（偶数年と奇数年）に北海道東部の9河川に回帰したカラフトマス親魚について、mtDNA調節領域前半部分約500bpの塩基配列を解析し、各個体のハプロタイプを決定した。その結果、合計67種類のハプロタイプが確認され、このうち25種類が偶数年級群にのみ、30種類が奇数年級群にのみそれぞれ出現し、12種類が両年級群に共通するものであった。また、偶数年級群固有のハプロタイプのうち5タイプ、奇数年級群固有のハプロタイプのうち3タイプが、通常のハプロタイプとは塩基配列数が異なっていた。ハプロタイプ多様度および塩基多様度は偶数年級群が奇数年級群よりも大きく、遺伝的変異性は偶数年級群で高いことが示された。年級間および集団間の遺伝的分化の程度をAMOVAおよびペアワイズFstにより推定したところ、偶数年級群と奇数年級群の間では明瞭な遺伝的分化が見られたが、同一年級内の集団間では遺伝的分化は確認されなかった。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
サケ科魚類各種の遺伝子標本採集調査、遺伝子分析ともに、計画に従い順調に進捗している。
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| Strategy for Future Research Activity |
次年度は、サケ科魚類のうち主にオショロコマを対象として、標本の収集調査とmtDNAおよびマイクロサテライトDNAでの遺伝分析を進める。また、カラフトマスについては同じ標本を用いて、SNP(一塩基多型）マーカー10遺伝子座による遺伝分析を実施する。
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| Causes of Carryover |
本年度実施した遺伝子実験において、これまでの助成事業等で用いた試薬や消耗品が一部使用可能であったため、消耗品等の購入を抑えることができた。次年度も引き続きサケ科魚類複数種を対象として各種遺伝子実験を実施する。したがって、遺伝子実験にかかる多くの試薬や消耗品が必要となる。
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