2019 Fiscal Year Research-status Report
複数遺伝子座の分析に基づくサケ科魚類5種の比較系統地理
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16K07884
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| Research Institution | Fisheries Research and Education Agency |
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Principal Investigator |
山本 祥一郎 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 中央水産研究所, グループ長 (20392897)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
佐藤 俊平 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 北海道区水産研究所, グループ長 (70425461)
森田 健太郎 国立研究開発法人水産研究・教育機構, 北海道区水産研究所, 主任研究員 (30373468)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | サケ科魚類 / 系統地理 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
今年度はアジアから北米にいたる環太平洋一帯に広く分布するサケについて、比較系統地理的分析の一助とするため、保存してある北米系サケ8集団（南東アラスカ6集団、ブリティッシュコロンビア（BC）2集団）についてSNP分析を行い、既存の北米系サケ集団のデータとあわせて集団遺伝学的な再解析を行い、日本系およびロシア系サケ集団と比較した。その結果、分析した8集団のヘテロ接合度の期待値（He）とアレリックリッチネス（AR）の平均は、いずれも北米系サケ集団全体の値よりは小さかったが、既存の南東アラスカ集団およびBC集団とは同程度の値を示した。近隣結合法による集団系統樹を作成したところ、分析集団は基本的に既存の南東アラスカ集団およびBC集団と同じ位置にそれぞれクラスタリングされた。また、既存の日本系およびロシア系サケ集団のデータと比較したところ、分析集団のHeとARはともに日本系サケ集団の平均より高かったものの、ロシア系サケよりは低い傾向を示した。サクラマスでは、一部の集団についてミトコンドリアDNA(mtDNA)塩基配列分析およびマイクロサテライトDNA(msDNA)分析を実施し、これまでに収集したロシア、日本、台湾からの合計55集団1520個体の遺伝データについて再解析を行った。msDNAによるSTRUCTURE解析の結果、主に太平洋岸河川に生息するアマゴ（亜種）と分布の北方に生息するサクラマス（亜種）は異なるクラスターを形成することが示された。また、サクラマス（亜種）では距離による隔離(isolation by distance)の集団構造が確認されたが、アマゴ（亜種）では認められなかった。台湾に生息するサラマオマス（亜種）では、mtDNA、msDNAともに日本に生息するサクラマスとの間に明瞭な遺伝的分化は確認されなかった。ベイジアン・スカイラインプロット解析の結果、サクラマスは約１０万年前以降に分布を急速に拡大させたことが示された。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
サケ科魚類各種の標本採集調査、遺伝子分析は計画に従い順調に進捗している。
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| Strategy for Future Research Activity |
次年度は、サケ科魚類のうち主にイワナを対象として、標本の収集調査とミトコンドリアDNAおよび核DNA分析を進める。
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| Causes of Carryover |
本年度実施した遺伝子実験において、これまでの助成事業等で用いた試薬や消耗品が一部使用可能となったため、消耗品等の購入を抑えることができた。次年度も引き続きサケ科魚類複数種を対象として各種遺伝子実験を実施する。したがって、遺伝子実験にかかる多くの試薬や消耗品等が必要となる。
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Research Products
(6 results)
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[Journal Article] Phylogeography of a salmonid fish, masu salmon Oncorhynchus masou subspecies‐complex, with disjunct distributions across the temperate northern Pacific2020
Author(s)
Yamamoto, S., Morita, K., Kikko, T., Kawamura, K., Sato, S. & Gwo, J.C.
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Journal Title
Freshwater Biology
Volume: 65
Pages: 698-715
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Presentation] Phylogeography and population genetic structure of masu salmon Oncorhynchus masou subspecies-complex inferred from mitochondrial and microsatellite DNA markers2019
Author(s)
Yamamoto, S., Morita, K., Kikko, T., Kawamura, K., Sato, S. & Gwo, J.C.
Organizer
Advances in the Population Ecology of Stream Salmonids V
Int'l Joint Research
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