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2016 Fiscal Year Research-status Report

トランスサイレチンの単量体補足を基盤とする革新的抗アミロイドーシス薬の開発

Research Project

Project/Area Number 16K08193
Research InstitutionUniversity of Toyama

Principal Investigator

横山 武司  富山大学, 大学院医学薬学研究部(薬学), 助教 (50524162)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Keywordsアミロイドーシス / トランスサイレチン / PPI創薬
Outline of Annual Research Achievements

本研究はトランスサイレチン(TTR)単量体に結合することで、四量体会合を阻害する化合物の開発を目的としている。TTRの四量体形成を阻害する化合物は、TTRを小胞体関連分解へ導き、TTRのアミロイド線維形成を阻害すると期待している。
初年度の目標は、(i)水銀化合物ラベル導入のための変異体TTRの作成、(ii)TTR単量体のX線結晶構造解析、(iii)仮想スクリーニング(ドッキングシミュレーション)の開始、である。
まず、水銀化合物ラベル導入のためのS112C変異体TTRを大腸菌発現システムを利用して作成した。遺伝子組み換え大腸菌の大量培養および精製の結果、高純度のS112C変異体TTRを得た。S112C-TTR四量体のX線結晶構造解析を行い、変異導入部位のオミット差フーリエ図のピークの高さからS112C変異が正しく導入されていることを確認した。
一方で、2016年に他のグループがTTR単量体の立体構造がNMRによって決定した(PDB ID: 2NBO)。研究の目的はあくまで阻害剤の開発であることを鑑み、研究を先に進めることを優先させ、この立体構造データを用いてインシリコスクリーニングを開始することにした。使用する仮想化合物ライブラリはカリフォルニア・サンフランシスコ大学が運営するZINCから約200万の立体構造データを取得した。現在、これらの化合物に対してAutoDock VINAを用いたドッキング計算を行っている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

ドッキングシミュレーションに用いるTTR単量体の立体構造データはProtein Data Bankに登録されているものを使用するなど、多少の実験方法に変更はあったが、本年度の計画である仮想化合物スクリーニングを実行することができた。したがって、研究の進捗はおおむね順調としている。

Strategy for Future Research Activity

研究は予定通りに進展しているため、次年度も計画書通りに実施する。

Causes of Carryover

試薬や旅費等の申請書作成時の見積もりと実際の費用の誤差によるものである。

Expenditure Plan for Carryover Budget

インシリコスクリーニングで得た候補化合物の中で、実際に購入する化合物を増やすために使用する。

  • Research Products

    (5 results)

All 2016

All Presentation (5 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Presentation] トランスサイレチンのアミロイド線維形成におけるアントラキノン類の阻害機構2016

    • Author(s)
      北上龍太、横山武司、水口峰之
    • Organizer
      日本薬学会北陸支部第128回例会
    • Place of Presentation
      金沢
    • Year and Date
      2016-11-27 – 2016-11-27
  • [Presentation] Novel BRD4 bromodomain binders with different binding modes revealed by crystallographic limited screening.2016

    • Author(s)
      Matsumoto, K., Yokoyama, T., and Mizuguchi, M.
    • Organizer
      The first international symposium on Toyama-Asia-Africa Pharmaceutical Network
    • Place of Presentation
      Toyama
    • Year and Date
      2016-09-12 – 2016-09-13
  • [Presentation] Analysis of the stability of transthyretins from different primates.2016

    • Author(s)
      Inose, M., Obita, T., Yokoyama, T., and Mizuguchi, M.
    • Organizer
      The first international symposium on Toyama-Asia-Africa Pharmaceutical Network
    • Place of Presentation
      Toyama
    • Year and Date
      2016-09-12 – 2016-09-13
  • [Presentation] FPPS-ビスホスホネート複合体におけるプロトン化状態の変化と水和構造2016

    • Author(s)
      横山武司
    • Organizer
      平成28 年度J-PARC/MLF 産業利用報告会
    • Place of Presentation
      秋葉原コンベンションホール
    • Year and Date
      2016-07-21 – 2016-07-22
    • Invited
  • [Presentation] 抗アミロイドーシス薬としてのクラウンエーテルの有用性:クラウンエーテル-トランスサイレチン複合体の安定性と結晶構造2016

    • Author(s)
      横山武司、水口峰之
    • Organizer
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場
    • Year and Date
      2016-06-07 – 2016-06-09

URL: 

Published: 2018-01-16  

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