2016 Fiscal Year Research-status Report
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16K08720
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| Research Institution | Keio University |
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Principal Investigator |
新井 恵吏 慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 専任講師 (40446547)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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| Keywords | DNA methylation / cancer / development / kidney / liver / lung / stomach / breast |
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| Outline of Annual Research Achievements |
淡明細胞型腎細胞がん104例・肺腺がん168例・胃腺がん105例・肝細胞がん37例・浸潤性乳管がん99例のがん部(T)と非がん部(N)のIllumina社Infiniumアレイを用いたメチロームデータをバイオインフォマティクス解析した。有効なプローブ全てを用いた主成分分析において、各検体のDNAメチル化プロファイルは、異なる臓器のT同士よりも、同一臓器のNとTの方がより似ていることがわかった。がんでは起源臓器固有のDNAメチル化プロファイルの多くが保たれている、あるいはその臓器の発がん因子により前がん状態Nに形成されたDNAメチル化プロファイルを保っていると考えられた。NとTで有意にDNAメチル化状態が異なるプローブは、腎1915個、肺2651個、胃2209個、肝5665個、乳腺2875個であり、5臓器で共通して異常を示すプローブは108個、4臓器以上では588個であった。これらのDNAメチル化異常がmRNA発現と逆相関することをReal time RT-PCR法で確認した。エンリッチメント解析において、4臓器以上で共通してTで高メチル化状態を示す231遺伝子のコードする分子は、転写因子に有意に集積を示した。これら分子をコードする遺伝子の多くはES細胞でbivalentな修飾を示し、発生・分化を制御する遺伝子と報告されるものである。複数臓器がんで共通してDNAメチル化亢進を示す遺伝子は、エピジェネティックに制御され細胞分化に寄与する遺伝子であり、これらが共通して発がんにおけるエピゲノム異常の標的になっていると考えられた。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
研究は申請時の計画通り進展しており、科学的に有意な結果を得、その成果を原著論文として刊行した。
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| Strategy for Future Research Activity |
申請時の計画通り、横断的解析を通じた臓器特異的マーカーの探索を進める。
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| Causes of Carryover |
年度内に受理された論文の刊行費用を計上していたが、雑誌の刊行日程の都合で年度内に決済できなかったため。
3月に予定していた一部の実験が実施者の都合で次年度に延期になったため。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
論文の刊行に係る費用と延期された実験に係る消耗品に使用する予定。
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Research Products
(16 results)
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[Journal Article] Genes involved in development and differentiation are commonly methylated in cancers derived from multiple organs: A single-institutional methylome analysis using 1007 tissue specimens.2017
Author(s)
Ohara K, Arai E*, Takahashi Y, Ito N, Shibuya A, Tsuta K, Kushima R, Tsuda H, Ojima H, Fujimoto H, Watanabe S, Katai H, Kinoshita T, Shibata T, Kohno T, Kanai Y.
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Journal Title
Carcinogenesis
Volume: 38
Pages: 241-251
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Genome-wide DNA methylation analysis during non-alcoholic steatohepatitis-related multistage hepatocarcinogenesis: Comparison with hepatitis virus-related carcinogenesis.2017
Author(s)
Kuramoto J, Arai E, Tian Y, Funahashi N, Hiramoto M, Nammo T, Nozaki Y, Takahashi Y, Ito N, Shibuya A, Ojima H, Sukeda A, Seki Y, Kasama K, Yasuda K, Kanai Y.
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Journal Title
Carcinogenesis
Volume: 38
Pages: 261-270
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Anti-SRPα antibodies as a potential new tool for cancer immunotherapy.2016
Author(s)
Yanagita T, Murata Y, Tanaka D, Motegi S, Arai E, Daniwijaya EW, Hazama D, Washio K, Saito Y, Kotani T, Ohnishi H, Oldenborg PA, Garcia NV, Miyasaka M, Ishikawa O, Kanai Y, Komori T, Matozaki T.
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Journal Title
JCI insight
Volume: 2
Pages: e89140
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Presentation] Epigenome landscape of human normal purified hepatocytes: analysis by the International Human Epigenome Consortium (IHEC).2016
Author(s)
Arai E, Miura F, Totoki Y, Yamashita S, Tian Y, Gotoh M, Ojima H, Nakagawa H, Takahashi Y, Nakamura H, Hama N, Kato M, Kimura H, Suzuki Y, Ito T, Shibata T, Kanai Y.
Organizer
American Association of Cancer Reserach Annual Meeting 2016
Place of Presentation
New Orleans (USA)
Year and Date
2016-04-16 – 2016-04-20
Int'l Joint Research
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