NGSを用いた褐色細胞腫の遺伝的背景の解明-精密医療・先制医療を目指して

2016 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 16K08961
• Research Institution: University of Tsukuba
• Principal Investigator: 川上 康 筑波大学, 医学医療系, 教授 (70234028)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 竹越 一博 筑波大学, 医学医療系, 教授 (40261804)
• Project Period (FY): 2016-04-01 – 2019-03-31
• Keywords: 褐色細胞腫

Outline of Annual Research Achievements

今世紀に入り、褐色細胞腫の遺伝的なバックグランドが急速に解明され、遺伝性（germline遺伝子変異）は30-40％とされる。事実、最近の米国内分泌学会の褐色細胞腫のガイドラインで200例以上の症例を集めた論文のメタ解析を行い、遺伝性の頻度は33.8％（1250/3694）と報告された（J C E M. 2014;99:1915-42）。すなわち、遺伝性の頻度に関して既にこの有名で古典的な10％ルールは現在の実情に沿わない。一方、日本での現状は不明である。
申請者らが筑波大学で解析を施行した2007年から2017までの過去10年の結果は以下の通りである。現時点で総数で277例解析済みである．発端者227例中変異陽性は81例で，変異陽性率は35.7％(81/227）とほぼ欧米並みの高率であった。本邦においても遺伝性はやはり10％を遥かに上回っている。以上より遺伝的なバックグランドを持つ褐色細胞腫・パラガングリオ－マは本邦でも決して稀な疾患ではない。申請者らの検討でもSDHB変異陽性患者は高率に腹部パラガングリオ－マが初発で、悪性化した例を認めた。この結果は、日本においても遺伝子診断の重要性を示しており、特にはSDHB変異陽性の場合は腹部パラガングリオ－マが初発で悪性化しやすいことを示す。
以上の結果は、日本においても遺伝子診断の重要性を示しており、今後ＮＧＳを用いた短時間・安価な解析法の確立が待たれる所以である。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

申請者らが筑波大学で解析を施行した2007年から2017までの過去10年の結果は以下の通りである。現時点で277例解析済みである．発端者227例中変異陽性は81例で，変異陽性率は35.7％(81/227)（内訳:SDHB.39例，SDHD.11例，SDHA 1例,VHL.16例，RET.4例，TMEM127.5例，MAX.5例；SDHAは新型シークエンサーで同定）。本邦においても遺伝性はやはり10％を遥かに上回っている。以上より遺伝的なバックグランドを持つ褐色細胞腫・パラガングリオ－マは決して稀な疾患ではない。
SDHB変異陽性患者34例中39例が腹部パラガングリオ－マが初発（87.2％）で、悪性化した例が14例（14/39＝35.9％）であった。悪性例46 例中14例がSDHB変異陽性であった（30.4％）。この結果は、日本においても悪性褐色細胞腫はSDHB変異と密接に関連しており、SDHB変異陽性の場合は腹部パラガングリオ－マが初発で悪性化しやすいことを示す。

Strategy for Future Research Activity

既に、主要既知関連9遺伝子計52エクソンをカバーするNGS変異パネル（イルミナ社のMiSeq）をファルコバイオシステムズとの産学連帯により構築済みである。申請者らの保有する遺伝子変異の既知の検体を用いた従来法(Sanger法)との相関は100％一致している。今後、ＮＧＳを用いた解析をさらに増やして、有効性を検証する。

Causes of Carryover

7556円と1万円以下で適当な試薬が見つからなかったため。

Expenditure Plan for Carryover Budget

ＤＮＡシークエンスに合算して用いる