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2017 Fiscal Year Research-status Report

悪性神経膠腫の術中迅速診断支援システム開発と有用性の検証

Research Project

Project/Area Number 16K08964
Research InstitutionUniversity of Yamanashi

Principal Investigator

吉村 健太郎  山梨大学, 大学院総合研究部, 助教 (70516921)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Keywords質量分析 / アンビエント / リアルタイム
Outline of Annual Research Achievements

(1) 脳腫瘍マススペクトルデータベースの構築:摘出された腫瘍切片を質量分析して得られたマススペクトルと患者情報を合わせ、関係データベースを構築した。グレードII、III、IVそれぞれの腫瘍組織37、26、50切片を分析し、計876マススペクトルを得た。また正常脳組織コントロールとして腫瘍周辺の非病変部を収集し、10切片より163スペクトルを得た。グレードIの腫瘍組織は入手数が非常に少なかったため、今回の解析対象からは除外した。
(2) 判別精度の検証:得られたマススペクトルを学習機械であるロジスティック回帰で学習した後、判別性能を一個抜き公差検証で確認した。非腫瘍部対各グレードの2群判別における正答率はグレードIIが96.3%、グレードIIIが99.7%、グレードIVが99.0%と、非常に高い判別精度が得られた。また非腫瘍部対全グレードの4群判別における正答率は82.4%であった。腫瘍グレード間の判別においてはグレードIIとIIIまたはIVの判別が最も重要であるが、グレードII対IIIが80.8%、グレードII対IVが85.2%、グレードII対III+IVが79.7%であった。これらの結果は非腫瘍-腫瘍の判別において、術中迅速診断の手法として実用レベルであることを示唆している。いずれも2群以上の判別においては判別性能がやや低くなるが、これは今後データベースを拡充することで改善される見込みである。
(3) 術中迅速診断プローブの構築:検体を患者体外へ取り出すことなく、in situでの診断を可能とするために、質量分析装置からイオン化部を遠隔化する機構の構築を試みた。本システムではイオン化部として短針エレクトロスプレー法を用いているが、これを小型化し、さらにフレキシブルチューブによって、生成されたイオンを質量分析装置に輸送する機構を検討する。なお当該機構に関して特許出願を行った。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

脳腫瘍検体の収集および、マススペクトルデータベースの構築がおおよそ完了し、非腫瘍-腫瘍またはグレードの判別いずれにおいても、目標の正答率を得ることができた。グレード判別では計画当初IからIVの全てを含むことを計画していたが、グレードIの検体は入手自体が困難であることが分かったため、本研究における解析対象からは除外した。しかし術中迅速診断においてはグレードII、III、IVが判別可能であれば、脳内留置剤の要否判断が可能であるなど、臨床的有用性を十分に発揮するため、診断システムとしての性能は損なわれないと判断する。加えてin situ検査プローブの試作機の完成および、その知的財産権の獲得も達成し、全体としての進捗はおおむね順調である。

Strategy for Future Research Activity

・ 各腫瘍グレードの判別精度をさらに向上させるために、引き続き検体の収集とデータベース拡充を進める。特に正常組織コントロールとしての腫瘍周辺非病変部検体のデータが少ないため、重点的に追加する。
・ 術中迅速診断プローブの構築に向けて、短針エレクトロスプレー法の小型化、遠隔化を開始する。また新たなリアルタイム/オンライン検体採取法として、ライン式検体採取-イオン化プローブの検討を開始しており、これも並行して構築を進める。
・ 術中迅速診断プローブの性能検証のために、マウス脳腫瘍モデルの準備を開始する。リアルタイムで検体の採取あるいはマススペクトルの取得が可能なことを確認することに加えて、多点観察を行った際にメモリー効果がどの程度発生するのか、メンテナンスなくどの程度継続した分析が可能か等の検証を合わせて行う。

Causes of Carryover

年度末に発注した試薬が値引きされたために生じた残金である。

  • Research Products

    (11 results)

All 2018 2017 Other

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 5 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (2 results)

  • [Journal Article] Ambient mass spectrometry-based detection system for tumor cells in human b2018

    • Author(s)
      Kaname Sakamoto、Yuichiro Fujita、Kazuaki Chikamatsu、Shota Tanaka、Sen Takeda、Keisuke Masuyama、Kentaro Yoshimura、Hiroki Ishii
    • Journal Title

      Transl Cancer Res

      Volume: In press Pages: In press

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Detection of potential new biomarkers of atherosclerosis by probe electrospray ionization mass spectrometry2018

    • Author(s)
      Johno Hisashi、Yoshimura Kentaro、Mori Yuki、Kimura Tokuhide、Niimi Manabu、Yamada Masaki、Tanigawa Tetsuo、Fan Jianglin、Takeda Sen
    • Journal Title

      Metabolomics

      Volume: 14 Pages: 1-6

    • DOI

      doi.org/10.1007/s11306-018-1334-z

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Construction of mass spectra database and diagnosis algorithm for head and neck squamous cell carcinoma2017

    • Author(s)
      Ashizawa Kei、Yoshimura Kentaro、Johno Hisashi、Inoue Tomohiro、Katoh Ryohei、Funayama Satoshi、Sakamoto Kaname、Takeda Sen、Masuyama Keisuke、Matsuoka Tomokazu、Ishii Hiroki
    • Journal Title

      Oral Oncology

      Volume: 75 Pages: 111~119

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.oraloncology.2017.11.008

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] In vivo endoscopic mass spectrometry using a moving string sampling probe2017

    • Author(s)
      Chen Lee Chuin、Naito Tsubasa、Tsutsui Satoru、Yamada Yuki、Ninomiya Satoshi、Yoshimura Kentaro、Takeda Sen、Hiraoka Kenzo
    • Journal Title

      The Analyst

      Volume: 142 Pages: 2735~2740

    • DOI

      10.1039/C7AN00650K

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Hepatitis B virus prevents excessive viral production via reduction of cell death-inducing DFF45-like effectors2017

    • Author(s)
      Yasumoto Jun、Kasai Hirotake、Yoshimura Kentaro、Otoguro Teruhime、Watashi Koichi、Wakita Takaji、Yamashita Atsuya、Tanaka Tomohisa、Takeda Sen、Moriishi Kohji
    • Journal Title

      Journal of General Virology

      Volume: 98 Pages: 1762~1773

    • DOI

      10.1099/jgv.0.000813

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Towards Practical Endscopic Mass Spectrometry2017

    • Author(s)
      Lee Chuin Chen、Kentaro Yoshimura、Satoshi Ninomiya、Sen Takeda、Kenzo Hiraoka
    • Journal Title

      Mass Spectrometry

      Volume: 6 Pages: 1-8

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Desorption in Mass Spectrometry2017

    • Author(s)
      Dilshadbek Tursunbayevich Usmanov、Satoshi Ninomiya、Lee Chuin Chen、Subhrakanti Saha、Mridul Kanti Mandal、Yuji Sakai、Rio Takaishi、Ahsan Habib、Kenzo Hiraoka、Kentaro Yoshimura、Sen Takeda、Hiroshi Wada、Hiroshi Nonami
    • Journal Title

      Mass Spectrometry

      Volume: 6 Pages: 1-16

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Secondary Ion Mass Spectrometry Analysis of Renal Cell Carcinoma with Electrospray Droplet Ion Beams2017

    • Author(s)
      Satoshi Ninomiya、Kentaro Yoshimura、Lee Chuin Chen、Sen Takeda、Kenzo Hiraoka
    • Journal Title

      Mass Spectrometry

      Volume: 6 Pages: 1-6

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Remarks] 量分析、メタボロミクス、データ解析

    • URL

      http://hh-bd.link/

  • [Patent(Industrial Property Rights)] 質量分析装置、質量分析方法、質量分析システム、及び質量分析解析プログラム2018

    • Inventor(s)
      吉村 健太郎、石井 裕貴、チェン リー チュイン
    • Industrial Property Rights Holder
      山梨大学
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2018-004860
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 質量分析装置及び質量分析方法、並びに解析装置及び解析方法2017

    • Inventor(s)
      吉村 健太郎、チェン リー チュイン、二宮 啓
    • Industrial Property Rights Holder
      山梨大学
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2017-079391

URL: 

Published: 2018-12-17  

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