2017 Fiscal Year Research-status Report
次世代シーケンサーを活用した過剰マーカー染色体の発生メカニズムの解明
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16K08981
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| Research Institution | Fujita Health University |
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Principal Investigator |
大江 瑞恵 藤田保健衛生大学, 保健学研究科, 准教授 (10247661)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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| Keywords | 過剰マーカー染色体 / 染色体粉砕現象 / 染色体構造異常 / 次世代シーケンサー |
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| Outline of Annual Research Achievements |
小型の過剰染色体である過剰マーカー染色体は、比較的発生頻度が高い染色体異常である。病態の原因となる場合があり、その由来を知る事は臨床的に重要であるが、実際には、発生メカニズムはもとより、正確なゲノム領域やその構造もよく解らないままに診断されている。昨年度の研究により、生殖細胞で生じる過剰マーカー染色体は単純ではなく、複雑な構造を形成する可能性が示された。本年度は、その一部のマーカー染色体の発生機序の解析を行うことを計画した。発生機序の理解を深めることにより、詳細な解析が臨床検査に発展することを目指している。
本年度は、重複領域と欠失領域を複雑に有するマーカー染色体を中心に、分子遺伝学的解析をおこなった。その結果、DNA複製過程で繰り返し配列を介したメカニズムにより発生したことが推定された。しかし、単なるDNA複製のエラー以外のメカニズムの関与も想定され、より複雑な過程を関していることが考えられた。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
マーカー染色体は複雑な構造を示唆させる様々なものがあり、メカニズムも複数想定される。本年度は分子遺伝学的解析により、一部のマーカー染色体の発生メカニズムの想定をおこなった。
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| Strategy for Future Research Activity |
引き続き、新しいマーカー染色体を収集し過剰マーカー染色体の構成領域の確定を進めていく予定である。様々なパターンを示す複雑なマーカー染色体について、その発生機構を推定するために、現在得られているマーカー染色体の再編成された各断片間の結合部の相同配列の有無、マイクロホモロージーの数や挿入配列などは、修復機構を推定するのに有益な情報となる。次世代シーケンス解析をマイクロアレイ染色体検査の結果と対比しながら、DNA塩基レベルの再編成結合部位の同定をおこなう予定である。また、想定されたメカニズムを実証するために、マーカー染色体誘発モデル系の作成も試みる。
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| Causes of Carryover |
（理由）新規マーカー染色体検体の収集が少なかったため、物品費を翌年度に使用する。
（使用計画）新たに収集した過剰マーカー染色体をマイクロアレイ染色体検査や次世代シーケンサーを用いた再編成結合部位のDNA塩基レベルの同定を進める。また、新しい遺伝子改変技術を用いて、モデル系作成を進める予定である。
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