2019 Fiscal Year Annual Research Report
The analysis of non-coding RNA induced by cancer-associtated transcriptional factors in gastrointestinal cancers
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16K09285
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| Research Institution | Sapporo Medical University |
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Principal Investigator |
井戸川 雅史 札幌医科大学, 医学部, 講師 (00404749)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | p53 / lncRNA / 癌 / 非コードRNA / NEAT1 / ChIP-seq / long non-coding RNA |
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| Outline of Annual Research Achievements |
癌の約半数で変異が認められる癌抑制遺伝子，p53の転写標的となる長鎖非コードRNA（long non-coding RNA, lncRNA）を探索し，その中でNEAT1というlncRNAに着目して解析を進めた．
ChIP-seqではNEAT1遺伝子の転写開始点上流約1500bpにp53結合が認められ，レポーターアッセイではp53による転写活性の上昇が引き起こされた．Nutlin-3a処理を行い内因性p53を活性化したところNEAT1の発現が強く誘導され，また，p53活性化時にNEAT1をノックダウンしたところ，p53によって引き起こされる増殖抑制が減弱した．その際，NEAT1のノックダウンにより特定の遺伝子群の発現変化がRNA-seqにより確認された．NEAT1の発現と予後の関係についてTCGA(The Cancer Genome Atlas)のデータセットを用いて解析を行ったところ，胃癌のほか乳癌，卵巣癌，肉腫においてp53正常の場合にはNEAT1の低発現が予後不良と相関していた一方で，p53変異の場合には逆にNEAT1高発現が予後不良となった．以上の結果から，p53によるNEAT1の発現誘導がp53の腫瘍抑制に寄与すると共に，NEAT1はp53依存的に腫瘍抑制に寄与することが示唆された．以上の研究結果について学会発表を行うとともに，論文にまとめ雑誌に受理された．
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