2019 Fiscal Year Annual Research Report
Development of highly sensitive genotyping method by blood circulating tumor DNA enrichment using PIP polyamide
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16K09333
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| Research Institution | Chiba Cancer Center (Research Institute) |
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Principal Investigator |
傳田 忠道 千葉県がんセンター(研究所), 消化器内科, 部長 (90466053)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
渡部 隆義 千葉県がんセンター(研究所), がん研究開発グループ, 研究員 (60526060)
奥村 和弘 千葉県がんセンター(研究所), がんゲノムセンター 実験動物研究部, 研究員 (80584680)
永瀬 浩喜 千葉県がんセンター(研究所), がん遺伝創薬研究室, 研究所長 (90322073)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | リッキドバイオプシー / ctDNA / PIポリアミド |
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| Outline of Annual Research Achievements |
血液中には細胞が崩壊した際に放出される遊離DNA（cell-free DNA：cfDNA）が存在し、がん患者ではcfDNA以外にも腫瘍細胞由来の循環DNA（circulating tumor DNA：ctDNA）が含まれる。近年、これらリキッドバイオプシーを用いた研究が盛んにおこなわれており、特にがん遺伝子の体細胞変異を高感度にキャプチャーすることによって、低侵襲かつ新たながん診断法の開発が進められている。KRAS遺伝子変異は大腸がんの約40%に認められる。そのため、ctDNAを用いてKRAS遺伝子変異を同定することは、がん診断の新たなバイオマーカーとして期待されている。そこで本研究ではKRAS遺伝子の変異配列に特異的に結合するピロールイミダゾール含有ポリアミド（PIポリアミド）にビオチンを付加した複合体を用いることで、cfDNA中の標的遺伝子を含む微量ctDNAを濃縮する技術を開発し、その臨床的有用性について検討した。患者血清サンプルはがん組織からKRAS 遺伝子変異型が同定されている大腸がん患者21例を用いた。これら保存血清からctDNAを抽出し、PIポリアミドにより変異アレルを濃縮した後にddPCRにより検出し、その感度をPIポリアミド濃縮前・後で比較した。患者背景およびがん組織KRAS変異型の比率は、それぞれステージⅠ/Ⅱ/Ⅲ/Ⅳ：2/2/6/11およびG12C/G12S/ G12D/G12V：3/1/11/6であった。それぞれのKRAS変異に対応するそれぞれのPIポリアミドを使用し解析した結果、KRAS変異アレルの検出感度はステージⅣ症例では濃縮前・後ともに81.8%であった。一方、ステージⅠ/Ⅱ/Ⅲの早期の症例では濃縮前の検出感度は10%であったが、濃縮後では80%であり、有意に検出感度が向上した。これらのことから新たなctDNAの濃縮法の開発に成功した。
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[Journal Article] Enrichment technique to allow early detection and monitor emergence of KRAS mutation in response to treatment.2019
Author(s)
Kitagawa Y, Okumura K, Watanabe T, Tsukamoto K, Kitano S, Nankinzan R, Suzuki T, Hara T, Soda H, Denda T, Yamaguchi T, Nagase H.
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Journal Title
Sci Rep.
Volume: 9(1)
Pages: 982-986
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] A multicentre, prospective study of plasma circulating tumour DNA test for detecting RAS mutation in patients with metastatic colorectal cancer.2019
Author(s)
Bando H, Kagawa Y, Kato T, Akagi K, Denda T, Nishina T, Komatsu Y, Oki E, Kudo T, Kumamoto H, Yamanaka T, Yoshino T.
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Journal Title
Br J Cancer.
Volume: 120(10)
Pages: 982-986
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Exploration of potential prognostic biomarkers in aflibercept plus FOLFIRI in Japanese patients with metastatic colorectal cancer.2019
Author(s)
Hamaguchi T, Denda T, Kudo T, Sugimoto N, Ura T, Yamazaki K, Fujii H, Kajiwara T, Nakajima TE, Takahashi S, Otsu S, Komatsu Y, Nagashima F, Moriwaki T, Esaki T, Sato T, Itabashi M, Oki E, Sasaki T, Chiron M, Yoshino T.
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Journal Title
Cancer Sci.
Volume: 110(11)
Pages: 3565-3572
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Presentation] Whole-exome sequencing in metastatic or locally advanced pancreatic cancer patients with long-term survival2019
Author(s)
須藤研太郎,横井左奈,小原收,中村和貴,辻本彰子,喜多絵美里,長谷川嘉則,中山学,石井浩,傳田忠道,山口武人
Organizer
第17回日本臨床腫瘍学会学術集会
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[Presentation] ESD 治療により診断、治療し得たDysplasiaを伴う尖圭コンジローマの一例2019
Author(s)
橋本佳恵,石垣飛鳥,喜多絵美里,辻本彰子,天沼祐介,須藤研太郎,中村和貴,三梨桂子,傳田忠道,山口武人,鈴木拓人,南金山理乃,北川善康,荒木章伸,伊丹真紀子
Organizer
日本消化器病学会関東支部第356回例会
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[Presentation] TRICOLORE試験（大腸癌第3相試験: mFOLFOX6/CapeOX+Bev vs S-1/CPT-11+Bev）のQOL解析2019
Author(s)
佐藤温,高島淳生,傳田忠道,蒲生真紀夫,高畑武功,天貝賢二,倉持英和,近藤仁,的場周一郎,有岡仁,小松嘉人,山口達郎,嶋田顕,森田智視,石岡千加史
Organizer
第57回日本癌治療学会学術集会
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[Presentation] TRICOLORE試験に基づいた転移を有する大腸癌に対する一次治療の費用効果分析2019
Author(s)
後藤励,高島淳生,傳田忠道,蒲生真紀夫,倉持英和,天貝賢二,近藤仁,杉山克郎,中村路夫,畑中一映,石岡千加史,小松嘉人,山口達郎,嶋田顕,森田智視
Organizer
第57回日本癌治療学会学術集会
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[Presentation] 結腸直腸癌の原発部位別遺伝子プロファイル解析 GI-Screen 2013-01-CRC 付随研究2019
Author(s)
水上拓郎,高橋政樹,砂川優,結城敏志,賀川義規,高島淳生,舛石俊樹,原浩樹,傳田忠道,森脇俊和,塩澤学,沖英次,岡本渉,吉野孝之,中島貴子
Organizer
第57回日本癌治療学会学術集会
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[Presentation] 微小陥凹形態を呈した十二指腸Neuroendocrine tumor の一例2019
Author(s)
橋本佳恵,石垣飛鳥,辻本彰子,喜多絵美里,天沼裕介,須藤研太郎,中村和貴,三梨桂子,傳田忠道,石井浩,山口武人,鈴木拓人,南金山理乃,北川善康,川名秀忠,荒木彰伸,伊丹真紀子
Organizer
日本消化器病学会関東支部第357回例会
