2016 Fiscal Year Research-status Report
肝細胞癌におけるクロマチンリモデリング因子ARID遺伝子群の機能喪失の意義
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16K09340
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| Research Institution | Chiba University |
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Principal Investigator |
千葉 哲博 千葉大学, 大学院医学研究院, 講師 (00381583)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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| Keywords | エピジェネティクス |
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| Outline of Annual Research Achievements |
エピジェネティクスとは、DNA塩基配列の変化を伴わない遺伝子発現・情報の厳密な調節機構であり、多くの癌において高頻度にエピジェネティックな制御機構の異常が観察されることが報告されている。クロマチンリモデリング複合体はヒストン修飾酵素と協調して、クロマチンのダイナミックな構造変換に関与する。中でもSWI/SNF複合体の構成サブユニットの1つであるARID遺伝子群は、肝細胞癌で変異・欠損が報告されており、その機能喪失が肝発癌および癌の進行に密接に関与する可能性がある。
ARID遺伝子群(ARID1A, ARID1B, ARID2)の欠損による肝発癌機構への関与をin vivoで検証するために、hydrodynamic tail vein injection法を用いることとした。そこで、本アプローチで使用する、ARID遺伝子群(ARID1A, ARID1B, ARID2)に対するsh-RNAを発現するトランスポゾンベクターを構築した。また、ARID遺伝子群の標的遺伝子や遺伝子発現制御機構を検討するために、これらの遺伝子に対するSh-RNAを発現するレンチウイルスベクターを作成した。
これらの遺伝子群の変異・欠損に基づいた病態・予後解析を行うために、肝癌培養細胞株および肝癌手術検体からのDNA抽出作業を開始した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
ベクター構築やマウスの維持・交配などのために、比較的時間を要した。
本研究を遂行する上での環境は整いつつあり、今後研究を加速する予定である。
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| Strategy for Future Research Activity |
野生型あるいはInk4a/Arfノックアウトマウスに対して、ARID遺伝子群(ARID1A, ARID1B, ARID2)に対するsh-RNAを発現するトランスポゾンベクターをhydrodynamic tail vein injection法を用いて投与し、肝発癌機序をprospectiveに検証する。
正常肝細胞およびARID遺伝子群の機能喪失を伴う肝癌培養細胞を用いて、抗BRG1/BRM抗体を用いたクロマチン免疫沈降シークエンス(ChIP-sequence) およびマイクロアレイ解析を行い、ARID遺伝子群の標的分子候補を抽出する。
ARID遺伝子群の変異・欠損に着目し、予後予測などのバイオマーカーとしての有用性を検証する。
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Research Products
(5 results)
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[Journal Article] Histone lysine methyltransferase G9a is a novel epigenetic target for the treatment of hepatocellular carcinoma2017
Author(s)
Yokoyama M, Chiba T, Zen Y, Oshima M, Kusakabe Y, Noguchi Y, Yuki K, Koide S, Tara S, Saraya A, Aoyama K, Mimura N, Miyagi S, et al.
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Journal Title
Oncotarget
Volume: 8
Pages: 21315-21326
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Setdb1 maintains hematopoietic stem and progenitor cells by restricting the ectopic activation of nonhematopoietic genes.2016
Author(s)
Koide S, Oshima M, Takubo K, Yamazaki S, Nitta E, Saraya A, Aoyama K, Kato Y, Miyagi S, Nakajima-Takagi Y, Chiba T, Matsui H, Arai F, Suzuki Y, Kimura H, Nakauchi H, Suda T, Shinkai Y, Iwama A.
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Journal Title
Blood
Volume: 128
Pages: 638-649
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Prognostic Significance of Concurrent Hypovascular and Hypervascular Nodules in Patients with Hepatocellular Carcinoma.2016
Author(s)
Ogasawara S, Chiba T, Motoyama T, Kanogawa N, Saito T, Shinozaki Y, Suzuki E, Ooka Y, Tawada A, Kato H, Okabe S, Kanai F, Yoshikawa M, Yokosuka O.
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Journal Title
PLoS One
Volume: 11
Pages: e0163119
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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