Mutational analysis of the CHCHD2 gene in neurodegenerative diseases

2018 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 16K09700
• Research Institution: Juntendo University
• Principal Investigator: 李 元哲 順天堂大学, 医学(系)研究科(研究院), 特任助教 (40549292)
• Project Period (FY): 2016-04-01 – 2019-03-31
• Keywords: CHCHD2

Outline of Annual Research Achievements

パーキンソン病(Parkinson’s disease, PD)は静止時振戦・筋固縮・無動症・姿勢反射障害などを呈する、アルツハイマー病に次いで罹患率の高い神経変性疾患である。現在日本には約16万人の患者が存在する。PDの第1の発症リスクは加齢であり、60歳以上の100人に1人がPDを発症すると推定されており、超高齢化社会へ突入しつつある日本では早急に克服しなければならない疾病の1つである。PDはほとんどが孤発性だが全患者の5-10%には家族歴がある。このような遺伝性PDを対象に分子遺伝学研究を行った結果、PD発症に関わるさまざまな遺伝子が単離されている。新規優性遺伝性PDの原因遺伝子CHCHD2は家族性パーキンソン病の原因であるだけでなく、孤発性PDの発症感受性遺伝子でもある。本研究ではCHCHD2と神経変性疾患のゲノム的関連を明らかにする目的で大規模ゲノム解析を実施した。
本年度は独自でカスタム作成したPD関連遺伝子を網羅的に解析出来るパネルを用いて次世代シークエンサー（Ion Torrent）システムを使用し新たにパーキンソン病300症例及び健常者200人についてCHCHD2遺伝子解析を行った。検出されたバリアントについて公共データベースに登録されているか否か、Polyphen2などを用いてバリアントによるCHCHD2タンパク質の病的影響が予測されるか否かを検討した。結果、新たの病的変異は認められなかった。
Ion Chef, Ion GeneStudio S5, Ion Reporter の連携運用によりライブラリ作成からテンプレート作成、データ解析まで全自動で行うシステムを構築し、効率的かつ低コストで高精度の遺伝情報を取得することが出来た。

Research Products

• [Journal Article] Clinical heterogeneity of FTDP-17 caused by MAPT N279K mutation in relation to tau PET features. (2019)
  • Author(s): Ikeda A, Shimada H, Nishioka K, Takanashi M, Hayashida A, Li Y, Yoshino H, Funayama M, Ueno Y, Hatano T, Sahara N, Suhara T, Higuchi M, Hattori N.
  • Journal Title: Movement Disorders. Volume: 34 Pages: 568-574
  • DOI: DOI: 10.1002/mds.27623.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Isolated nigral degeneration without pathological protein aggregation in autopsied brains with LRRK2 p.R1441H homozygous and heterozygous mutations. (2018)
  • Author(s): Takanashi M, Funayama M (Joint first authors), Matsuura E, Yoshino H, Li Y, Tsuyama S, Takashima H, Nishioka K, Hattori N.
  • Journal Title: Acta Neuropathologica Communications. Volume: 6 Pages: 105
  • DOI: DOI: 10.1186/s40478-018-0617-y.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] GCH1 mutations in dopa-responsive dystonia and Parkinson’s disease. (2018)
  • Author(s): Yoshino H, Nishioka K, Li Y, Oji Y, Oyama G, Hatano T, Machida Y, Shimo Y, Hayashida A, Ikeda A, Mogushi K, Shibagaki Y, Hosaka A, Iwanaga H, Fujitake J, Ohi T, Miyazaki D, Sekijima Y, Oki M, Kusaka H, Fujimoto KI, Ugawa Y, Funayama M, Hattori N.
  • Journal Title: J Neurol. Volume: 268 Pages: 1860-1870
  • DOI: DOI: 10.1007/s00415-018-8930-8.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Genetic analysis of TMEM230 in Japanese patients with familial Parkinson’s disease. (2018)
  • Author(s): Conedera SA, Li Y, Funayama M, Yoshino H, Nishioka K, Hattori N.
  • Journal Title: Parkinsonism & Related Disorders. Volume: 48 Pages: 107-108
  • DOI: DOI: 10.1016/j.parkreldis.2017.12.020.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Serum caffeine and metabolites are reliable biomarkers of early Parkinson's disease. (2018)
  • Author(s): Fujimaki M, Saiki S, Li Y, Kaga N, Taka H, Hatano T, Ishikawa KI, Oji Y, Mori A, Okuzumi A, Koinuma T, Ueno SI, Imamichi Y, Ueno T, Miura Y, Funayama M, Hattori N.
  • Journal Title: Neurology. Volume: 90 Pages: e404-e411
  • DOI: DOI: 10.1212/WNL.0000000000004888.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] COQ2 variants in Parkinson's disease and multiple system atrophy. (2018)
  • Author(s): Mikasa M, Kanai K, Li Y, Yoshino H, Mogushi K, Hayashida A, Ikeda A, Kawajiri S, Okuma Y, Kashihara K, Sato T, Kondo H, Funayama M, Nishioka K, Hattori N.
  • Journal Title: Journal of Neural Transmission Volume: 125 Pages: 937-944
  • DOI: DOI: 10.1007/s00702-018-1885-1.
  • Peer Reviewed