2019 Fiscal Year Annual Research Report
Identification and functional analysis of gene aberrations in hematological malignancy with complex chromosomal abnormality using RNA-seq analysis
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16K09860
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| Research Institution | Fujita Health University |
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Principal Investigator |
安部 明弘 藤田医科大学, 医学部, 客員准教授 (00432261)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
恵美 宣彦 藤田医科大学, 医学部, 教授 (30185144)
山本 幸也 藤田医科大学, 医学部, 准教授 (90410703)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | RNA-seq / TCF4 / MAML3 / ARID1B / EMID1 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
1.本年度、新たに造血器腫瘍24検体においてRNA-seq解析を行い、データのコンピューター解析を進めた。当研究課題にて、RNA-seq解析した検体数は48検体で、過去の検体を含めこれまでに74検体の造血器腫瘍を解析した。
2.TCF4-MAML3の解析: MAML family遺伝子は、様々な固形ガンで融合遺伝子を形成することが知られているが、CD4+CD56+芽球性NK細胞白血病の再発時に、t(4;18)(q31;q21)を含む複雑核型を呈した症例において、4q31に位置するMAML3と、18q21に位置するTCF4がinframeで融合するTCF4-MAML3を同定した。この症例では、TCF4、MAML3の高発現が認められた。また、一般にAMLにおいてMAML3は高発現していた。MAML3の融合遺伝子では、WNTシグナルの亢進が関与するとの報告があるが、本症例においても、GSEA発現解析にて、WNTシグナル関連遺伝子の高発現を認めた。
3.t(6;9;22)(q25;q34;q11.2)を有するBCR-ABL1陽性CMLの解析: t(9;22)(q34;q11.2)を有するCMLの5-8%に付加的染色体異常認められるが、その遺伝子異常についての解析は進んではいない。RNA-seq解析にて、6q25に位置するARID1Bのexon4と、22q12.2 に位置するEMID1 のexon12のinframeでの融合が確認された。ARID1B は、その変異がいくつかの固形癌に関与することが知られている。また、 EMID1 はBCR からテロメア方向に6Mb離れて位置するため、t(6;9;22)(q25;q34;q11.2)は、t(6;22) (q25;q12.2) と t(9;22)(q34;q11.2)という異なる二つの転座を含んでいることが明らかとなった。
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Research Products
(3 results)
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[Journal Article] Involvement of MCL1, c-myc, and cyclin D2 protein degradation in ponatinib-induced cytotoxicity against T315I(+) Ph+leukemia cells.2020
Author(s)
Inoue C, Sobue S, Kawamoto Y, Nishizawa Y, Ichihara M, Abe A, Hayakawa F, Suzuki M, Nozawa Y, Murate T.
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Journal Title
Biochem Biophys Res Commun.
Volume: 525
Pages: 1074-1080
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Truncated RUNX1 generated from the fusion of RUNX1 to antisense GRIK2 via a cryptic chromosome translocation enhances sensitivity to granulocyte colony-stimulating factor2020
Author(s)
Abe A, Yamamoto Y, Katsumi A, Yamamoto H, Okamoto A, Inaguma Y, Iriyama C, Tokuda M, Okamoto M, Emi N, Tomita A.
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Journal Title
Cytogenetic and Genome Research
Volume: -
Pages: -
DOI
Peer Reviewed
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