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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Development of tools to support clinical decision-making using integrated database of clinical information and basic research in patients with breast cancer

Research Project

Project/Area Number 16K10455
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

高田 正泰  京都大学, 医学研究科, 助教 (50452363)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 杉本 昌弘  慶應義塾大学, 政策・メディア研究科(藤沢), 特任教授 (30458963)
Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Keywords乳癌 / データベース / バイオバンク / 予測モデル / 遺伝子変異
Outline of Annual Research Achievements

19施設から10540例の乳癌患者の診療データを集積し、診療データと紐付された血液・組織サンプルを4021例分収集した。予後情報の迅速・容易なアップデートを実現すべくWebを介し診療データを集積するシステムを構築した。現在、京都大学医学部附属病院と天理よろづ相談所病院にて試験運用中で、本年中に実運用へ移行する。
診療データと紐付けされた血液サンプルから抽出したDNAを用い2004例の乳癌患者の生殖細胞系列の遺伝子変異につき標的遺伝子シークエンスを行った。病的胚細胞変異は105例(5.2%)で認め、最多はBRCA2 62例であり、BRCA1 15例、PALB2 9例、CHEK2 4例、TP53 4例、PTEN 4例と続いた。臨床情報との統合解析の結果、年齢と遺伝子変異に有意な相関を認めた。今後は臨床情報、遺伝子変異情報および健常者データを統合し、日本人女性での病的変異保有リスクや乳癌発症リスクを予測するモデルの構築に取り組む。
診療データを用いてHER2陽性乳癌の術前化学療法後の再発リスクを予測するモデルを開発し、論文発表を行った。同データと紐付けされた組織サンプを用いBasalマーカー(EGFR, CK14, CK5/6)発現と予後の相関を示し、論文発表を行った。Webシステムを用いてモデルの予測能を検証する研究を計画している。
患者由来ゼノグラフト(PDX)用いて、同一患者由来の乳癌細胞と免疫細胞を有するヒト化PDXモデルを作成し、HER3陽性乳癌に対する抗HER3抗体の抗腫瘍効果を示した。また、腫瘍と脾臓組織中の腫瘍浸潤T細胞におけるCD137発現増強を認め、抗HER3抗体による抗原特異的T細胞活性化が示唆された。
本研究により基礎研究データと臨床情報の統合解析が容易となり、個々の症例レベルでの病態・治療効果予測が実現し、治療の適正化や予後改善につながる事が期待される。

  • Research Products

    (17 results)

All 2019 2018

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 10 results) Presentation (7 results)

  • [Journal Article] Elastic net-based prediction of IFN-β treatment response of patients with multiple sclerosis using time series microarray gene expression profiles2019

    • Author(s)
      Fukushima Arika、Sugimoto Masahiro、Hiwa Satoru、Hiroyasu Tomoyuki
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 9 Pages: 1~11

    • DOI

      10.1038/s41598-018-38441-2

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effects of inter-day and intra-day variation on salivary metabolomic profiles2019

    • Author(s)
      Kawanishi Norishige、Hoshi Noriyuki、Masahiro Sugimoto、Enomoto Ayame、Ota Sana、Kaneko Miku、Soga Tomoyoshi、Tomita Masaru、Kimoto Katsuhiko
    • Journal Title

      Clinica Chimica Acta

      Volume: 489 Pages: 41~48

    • DOI

      10.1016/j.cca.2018.11.030

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Prediction of postoperative disease-free survival and brain metastasis for HER2-positive breast cancer patients treated with neoadjuvant chemotherapy plus trastuzumab using a machine learning algorithm2018

    • Author(s)
      Takada Masahiro、Sugimoto Masahiro、Masuda Norikazu、Iwata Hiroji、Kuroi Katsumasa、Yamashiro Hiroyasu、Ohno Shinji、Ishiguro Hiroshi、Inamoto Takashi、Toi Masakazu
    • Journal Title

      Breast Cancer Research and Treatment

      Volume: 172 Pages: 611~618

    • DOI

      10.1007/s10549-018-4958-9

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effectiveness of neo-adjuvant systemic therapy with trastuzumab for basal HER2 type breast cancer: results from retrospective cohort study of Japan Breast Cancer Research Group (JBCRG)-C032018

    • Author(s)
      Sagara Yasuaki、Takada Masahiro、Ohi Yasuyo、Ohtani Shoichiro、Kurozumi Sasagu、Inoue Kenichi、Kosaka Yoshimasa、Hattori Masaya、Yamashita Toshinari、Takao Shintaro、Sato Nobuaki、Iwata Hiroji、Kurosumi Masafumi、Toi Masakazu
    • Journal Title

      Breast Cancer Research and Treatment

      Volume: 171 Pages: 675~683

    • DOI

      10.1007/s10549-018-4873-0

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Visualising peripheral arterioles and venules through high-resolution and large-area photoacoustic imaging2018

    • Author(s)
      Matsumoto Yoshiaki、Asao Yasufumi、Sekiguchi Hiroyuki、Yoshikawa Aya、Ishii Tomoko、Nagae Ken-ichi、Kobayashi Shuichi、Tsuge Itaru、Saito Susumu、Takada Masahiro、Ishida Yoshihiro、Kataoka Masako、Sakurai Takaki、Yagi Takayuki、Kabashima Kenji、Suzuki Shigehiko、Togashi Kaori、Shiina Tsuyoshi、Toi Masakazu
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 8 Pages: 1~11

    • DOI

      10.1038/s41598-018-33255-8

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Vascular branching point counts using photoacoustic imaging in the superficial layer of the breast: A potential biomarker for breast cancer2018

    • Author(s)
      Yamaga I、Kawaguchi-Sakita N、Asao Y、Matsumoto Y、Yoshikawa A、Fukui T、Takada M、Kataoka M、Kawashima M、Fakhrejahani E、Kanao S、Nakayama Y、Tokiwa M、Torii M、Yagi T、Sakurai T、Haga H、Togashi K、Shiina T、Toi M
    • Journal Title

      Photoacoustics

      Volume: 11 Pages: 6~13

    • DOI

      10.1016/j.pacs.2018.06.002

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Real-time navigation system for sentinel lymph node biopsy in breast cancer patients using projection mapping with indocyanine green fluorescence2018

    • Author(s)
      Takada Masahiro、Takeuchi Megumi、Suzuki Eiji、Sato Fumiaki、Matsumoto Yoshiaki、Torii Masae、Kawaguchi-Sakita Nobuko、Nishino Hiroto、Seo Satoru、Hatano Etsuro、Toi Masakazu
    • Journal Title

      Breast Cancer

      Volume: 25 Pages: 650~655

    • DOI

      10.1007/s12282-018-0868-2

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] MICOP: Maximal information coefficient-based oscillation prediction to detect biological rhythms in proteomics data2018

    • Author(s)
      Iuchi Hitoshi、Sugimoto Masahiro、Tomita Masaru
    • Journal Title

      BMC Bioinformatics

      Volume: 19 Pages: 1~11

    • DOI

      10.1186/s12859-018-2257-4

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Urinary Polyamine Biomarker Panels with Machine-Learning Differentiated Colorectal Cancers, Benign Disease, and Healthy Controls2018

    • Author(s)
      Nakajima Tetsushi、Katsumata Kenji、Kuwabara Hiroshi、Soya Ryoko、Enomoto Masanobu、Ishizaki Tetsuo、Tsuchida Akihiko、Mori Masayo、Hiwatari Kana、Soga Tomoyoshi、Tomita Masaru、Sugimoto Masahiro
    • Journal Title

      International Journal of Molecular Sciences

      Volume: 19 Pages: 756~756

    • DOI

      10.3390/ijms19030756

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Robust volcano plot: identification of differential metabolites in the presence of outliers2018

    • Author(s)
      Kumar Nishith、Hoque Md. Aminul、Sugimoto Masahiro
    • Journal Title

      BMC Bioinformatics

      Volume: 19 Pages: 1~11

    • DOI

      10.1186/s12859-018-2117-2

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ER2陽性原発性乳癌の治療最適化 Trastuzumabを含む術前化学療法を施行されたHER2陽性原発性乳癌の予後予測数理モデルの開発2018

    • Author(s)
      杉本昌弘, 高田正泰, 増田慎三, 岩田広治, 黒井克昌, 山城大泰, 大野真司, 石黒洋, 稲本俊, 戸井雅和
    • Organizer
      第26回日本乳癌学会総会
  • [Presentation] ER陰性HER2陽性乳癌におけるbasal markerの有用性に関する研究2018

    • Author(s)
      服部 正也、相良 安昭、高田 正泰、大井 恭代、黒住 昌史、 大谷 彰一郎、井上 賢一、高尾 信太郎、佐藤 信昭、山下 年成、 小坂 愉賢、黒住 献、森田 智視、岩田 広治、戸井 雅和
    • Organizer
      第26回日本乳癌学会総会
  • [Presentation] 散発性及び家族性乳癌における遺伝性素因2018

    • Author(s)
      Yukiko Kawata, Kenichi Yoshida, Nobuko Kawaguchi-Sakita, Masahiro Kawashima, Yusuke Shiozawa, Tomomi Nishimura, Noriko Senda, Eiji Suzuki, Yuichi Shiraishi, Kenichi Chiba, Satoru Miyano, Masakazu Toi and Seishi Ogawa
    • Organizer
      第26回日本乳癌学会総会
  • [Presentation] 日本人女性乳癌 2004 例における生殖細胞系列変異2018

    • Author(s)
      Yukiko Kawata, Kenichi Yoshida, Nobuko Kawaguchi-Sakita, Masahiro Kawashima, Yusuke Shiozawa, Tomomi Nishimura, Noriko Senda, Eiji Suzuki, Yuichi Shiraishi, Kenichi Chiba, Satoru Miyano, Masakazu Toi and Seishi Ogawa
    • Organizer
      第77回日本癌学会学術総会
  • [Presentation] ネットワークにおけるバイオバンクを基盤とした遺伝性腫瘍の診療体制の構築に向けた取り組み2018

    • Author(s)
      川口 展子, 川田 有希子, 仙田 典子, 川島 雅央, 鈴木 栄治, 鳥井 雅恵, 高田 正泰, 山城 大泰, 山神 和彦, 芳林 浩史, 岡村 隆仁, 加藤 大典, 森口 喜生, 山内 清明, 稲本 俊, 戸井 雅和
    • Organizer
      第26回日本乳癌学会総会
  • [Presentation] BRCA1/2変異予測モデルの日本人への適応について2018

    • Author(s)
      仙田 典子、川口 展子、川田 有希子、川島 雅央、村上 弘美、 山田 崇弘、戸井 雅和
    • Organizer
      第26回日本乳癌学会総会
  • [Presentation] 蛍光色素法センチネルリンパ節生検におけるプロジェクションマッピングを用いたリアルタイムナビゲーション2018

    • Author(s)
      高田 正泰、竹内 恵、鈴木 栄治、佐藤 史顕、松本 純明、 鳥井 雅恵、川口 展子、西野 裕人、瀬尾 智、波多野 悦朗、 戸井 雅和
    • Organizer
      第26回日本乳癌学会総会

URL: 

Published: 2019-12-27  

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