2018 Fiscal Year Research-status Report
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16K10548
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| Research Institution | Jichi Medical University |
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Principal Investigator |
力山 敏樹 自治医科大学, 医学部, 教授 (80343060)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
鈴木 浩一 自治医科大学, 医学部, 准教授 (70332369)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | DNAメチル化異常 / MS-AFLP / 発癌リスク |
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| Outline of Annual Research Achievements |
【研究目的】本研究は、正常組織で観察される遺伝子修飾異常（DNAメチル化異常）の情報をもとに、癌のかかりやすさを予測しようとするものです。DNAメチル化異常は癌組織のみならず、非癌部組織でも認められるため、その情報を癌発症の予測や早期診断に利用します。具体的には、癌組織で異常メチル化のため遺伝子発現が低下している遺伝子を同定し、それらの遺伝子の異常メチル化の程度を背景粘膜でも検出します。背景粘膜の異常メチル化の程度と遺伝子発現の相関を解析し、異常メチル化の進行に伴い遺伝子の発現が低下していく過程を捉えられれば、それは発癌過程の段階的変化を表現していると考えられます。我々が独自に開発したDNAメチル化マイクロアレイ、発現アレイを用いる事により、網羅的に遺伝子異常、遺伝子修飾異常を捉えることが可能となり、分子生物学的な発癌プロファイルの作成が可能となります。それは発癌リスクのバイオマーカーとして有用性が期待されます。
【研究実績】平成30年度は、
発現アレイで遺伝子発現の程度を評価し、Pyro Markでメチル化シトシン定量し、アレイの結果の検証を行います。そしてクラスター解析、DAVID解析で関連遺伝子を同定し、メチル化プロファイルを作成します。そしてDNAメチル化異常とその遺伝子の発現の情報を統合させ、分子生物学的な発癌リスクのプロファイルの作成を目標とします。
我々が独自に開発したDNAメチル化マイクロアレイ、MS-AFLP法を用いて癌部と非癌部で同じ変化を示す遺伝子断片を同網羅的に検索し、クラスター解析、DAVID解析を行ったところ、WNTsignal、AXON guidanceおよびHomeoboxに関わる遺伝子群を同定しました。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
我々が独自に開発したDNAメチル化マイクロアレイ、MS-AFLP法を用いて癌部と非癌部で同じ変化を示す遺伝子断片を同網羅的に検索し、クラスター解析、DAVID解析を行ったところ、WNTsignal、AXON guidanceおよびHomeoboxに関わる遺伝子群を同定しました。また、MS-AFLP法の詳細を論文発表しました。今後は発現アレイで遺伝子発現の程度を評価し、Pyro Markでメチル化シトシン定量し、アレイの結果の検証を行う予定でしたが、まだ十分なデータが集積されていません。
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| Strategy for Future Research Activity |
遺伝子発現の程度を発現アレイで評価し、メチル化アレイでその結果を検証します。
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| Causes of Carryover |
消耗品価格の変動のため次年度使用額が生じました。消耗品購入の繰り越しにまわします。
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[Journal Article] Monitoring circulating tumor DNA revealed dynamic changes in KRAS status in patients with metastatic colorectal2018
Author(s)
Yuji Takayama, Koichi Suzuki, Yuta Muto, Kosuke Ichida, Taro Fukui, Nao Kakizawa, Hideki Ishikawa, Fumiaki Watanabe, Fumi Hasegawa, Masaaki Saito, Shingo Tsujinaka, Kazushige Futsuhara, Yasuyuki Miyakura, Hiroshi Noda, Fumio Konishi, Toshiki Rikiyama
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Journal Title
Oncotarget
Volume: 9
Pages: 24398～24413
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Presentation] Clinical significance of monitoring KRSA in tissue and serum of pancreatic cancer patients2018
Author(s)
Watanabe F, Suzuki K, Ishikawa H, Endo Y, Ichida K, Takayama Y, Fukui T, Kakizawa N, Kasahara N, Kato T, Noda H, Rikiyama T
Organizer
Gastrointestinal Cancers Symposium
Int'l Joint Research
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[Presentation] Dynamics and characteristics of KRAS mutated circulating tumor DNA in patients with metastatic colorectal cancer during various treatments2018
Author(s)
Takayama Y, Suzuki K, Ichida K, Fukui T, Kakizawa N, Watanabe F, Kikukawa R, Hasegawa F, Tsujinaka S, Miyakura Y, Konishi F, Rikiyama T
Organizer
Gastrointestinal Cancers Symposium
Int'l Joint Research
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