2019 Fiscal Year Annual Research Report
Analysis of the profile in DNA methylation alterations to predict susceptibility to cancer development
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16K10548
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| Research Institution | Jichi Medical University |
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Principal Investigator |
力山 敏樹 自治医科大学, 医学部, 教授 (80343060)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
鈴木 浩一 自治医科大学, 医学部, 准教授 (70332369)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | DNAメチル化異常 / MS-AFLP / 発癌リスク |
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| Outline of Annual Research Achievements |
【研究目的】本研究は、正常組織で観察される遺伝子修飾異常（DNAメチル化異常）の情報をもとに、癌のかかりやすさを予測しようとするものです。DNAメチル化異常は癌組織のみならず、非癌部組織でも認められるため、その情報を癌発症の予測や早期診断に利用します。具体的には、癌組織で異常メチル化のため遺伝子発現が低下している遺伝子を同定し、それらの遺伝子の異常メチル化の程度を背景粘膜でも検出します。背景粘膜の異常メチル化の程度と遺伝子発現の相関を解析し、異常メチル化の進行に伴い遺伝子の発現が低下していく過程を捉えられれば、それは発癌過程の段階的変化を表現していると考えられます。我々が独自に開発したDNAメチル化マイクロアレイ、発現アレイを用いる事により、網羅的に遺伝子異常、遺伝子修飾異常を捉えることが可能となり、分子生物学的な発癌プロファイルの作成が可能となります。それは発癌リスクのバイオマーカーとして有用性が期待されます。
【研究実績】
発現アレイで遺伝子発現の程度を評価し、Pyro Markでメチル化シトシン定量し、アレイの結果の検証を行います。そしてクラスター解析、DAVID解析で関連遺伝子を同定し、メチル化プロファイルを作成します。そしてDNAメチル化異常とその遺伝子の発現の情報を統合させ、分子生物学的な発癌リスクのプロファイルの作成を目標とします。
我々が独自に開発したDNAメチル化マイクロアレイ、MS-AFLP法を用いて癌部と非癌部で同じ変化を示す遺伝子断片を同網羅的に検索し、クラスター解析、DAVID解析を行ったところ、WNTsignal、AXON guidanceおよびHomeoboxに関わる遺伝子群を同定しました。MS-AFLP法の詳細は論文発表しました。今後は発現アレイで遺伝子発現の程度を評価し、Pyro Markでメチル化シトシン定量し、アレイの結果の検証を行うためデータを集積しています。
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Research Products
(25 results)
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[Journal Article] Longitudinal monitoring of KRAS-mutated circulating tumor DNA enables the prediction of prognosis and therapeutic responses in patients with pancreatic cancer.2019
Author(s)
Fumiaki Watanabe, Koichi Suzuki*, Sawako Tamaki, Iku Abe, Yuhei Endo, Yuji Takayama, Hideki Ishikawa, Nao Kakizawa, Masaaki Saito, Kazushige Futsuhara, Hiroshi Noda, Fumio Konishi, Toshiki Rikiyama
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Journal Title
PLOS ONE
Volume: 14
Pages: -
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Temporary loss of consciousness during cetuximab treatment of a patient with metastatic colon cancer: a case report.2019
Author(s)
Taro Fukui,Koichi Suzuki,Sawako Tamaki,Iku Abe,Yuhei Endo,Hideki Ishikawa,Nao Kakizawa,Fumiaki Watanabe,Masaaki Saito,Shingo Tsujinaka,Kazushige Futsuhara,Yasuyuki Miyakura,Hiroshi Noda,Toshiki Rikiyama
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Journal Title
Surgical case reports
Volume: 5
Pages: 145～145
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] High relative levels of satellite alpha transcripts predict increased risk of bilateral breast cancer and multiple primary cancer in patients with breast cancer and lacking BRCA_related clinical features.2019
Author(s)
Nao Kakizawa,Koichi Suzuki,Iku Abe,Yuhei Endo,Sawako Tamaki,Hideki Ishikawa,Fumiaki Watanabe,Kosuke Ichida,Masaaki Saito,Kazusige Futsuhara,Fumio Konishi,Toshiki Rikiyama
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Journal Title
Oncology reports
Volume: 42
Pages: 857～865
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Multiple primary malignancies of six organs in a Japanese male patient: A case report.2019
Author(s)
Yuta Muto,Koichi Suzuki,Takaharu Kato,Kosuke Ichida,Yuji Takayama,Taro Fukui,Nao Kakizawa,Fumiaki Watanabe,Yuji Kaneda,Hiroshi Noda,Toshiki Rikiyama
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Journal Title
Molecular and clinical oncology
Volume: 10
Pages: 511～515
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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