2018 Fiscal Year Annual Research Report
The elucidation of biliary and pancreatic tumor's pathobiology through the functional analysis of novel Warburg effect-associated gene PTBP1
| Project/Area Number |
16K10615
|
|---|
| Research Institution | Osaka Medical College |
|---|
Principal Investigator |
朝隈 光弘 大阪医科大学, 医学部, 講師 (40559390)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
赤尾 幸博 岐阜大学, 大学院連合創薬医療情報研究科, 特任教授 (00222505)
廣川 文鋭 大阪医科大学, 医学部, 准教授 (20322373)
内山 和久 大阪医科大学, 医学部, 教授 (80232867)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
|
| Keywords | PTBP1 / 膵癌 / ワールブルグ効果 / スプライサー |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
膵癌細胞株2種（MIA PaCa-2、PANC-1)でPTBP1をノックダウンし、RNAシーケンスを施行した。解析結果より、PTBP1ノックダウンにより共通の挙動を示すmRNAを網羅的に解析した。同定した標的遺伝子に関して蛋白発現をウェスタンブロッティングで解析した。また、バイオインフォマティクスを用いて、PTBP1及び、標的遺伝子の正常組織における発現プロファイルや全がん種における発現変化を解析した。また、CRISPR―Cas9でノックアウトした際の致死率などを解析した。
|
| Remarks |
本年度随時更新予定である。
|
