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2016 Fiscal Year Research-status Report

歯周病細菌特異的病原性LPSのO抗原鎖の組成と生合成機構の完全解明

Research Project

Project/Area Number 16K11451
Research InstitutionNagasaki University

Principal Investigator

庄子 幹郎  長崎大学, 医歯薬学総合研究科(歯学系), 助教 (10336175)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 橋本 雅仁  鹿児島大学, 理工学域工学系, 教授 (30333537)
Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Keywords歯周病細菌 / リポ多糖
Outline of Annual Research Achievements

歯周病関連細菌Porphyromonas gingivalisは、強力なタンパク質分解酵素であるジンジパインを分泌する。ジンジパインを含めた約30個の外膜タンパク質のC末端側には共通のC-terminal domain(CTD)を有しており、それは外膜への分泌シグナルとなっている。CTD含有タンパク質はIX型分泌機構(T9SS)によって菌体表面に輸送されること、さらに菌体表面に出たこれらのタンパク質はT9SSにより分泌されるPorUプロテアーゼによりCTDが切断されるとともにA-LPS(O多糖は陰性荷電を持つ)に結合すると報告されている。しかしながら、その詳細については不明な点が多い。
これまでに、本菌には2種類の組成の異なるO多糖を持つLPSが存在すると報告されており、O-LPS、A-LPSと呼ばれている。CTD含有タンパク質は菌体表面のA-LPSに特異的に結合することから、その生合成機構の解明は重要である。これまでに、トランスポゾン変異法によりA-LPS生合成に関わる複数の遺伝子が同定されている。しかしながら、未同定の遺伝子も存在する可能性があった。そこで、本菌のゲノム情報から未だ解析をしていない14個の糖転移酵素遺伝子に着目し、変異株作製を試みた。その結果、4個の遺伝子については変異株作製ができなかった。残りの10個については変異株作製ができた。そのうち、3個がA-LPS生合成に関わる新規遺伝子であった。1個はLPSがラフ型であったことから、A-LPSおよびO-LPSの両方のO多糖生合成に関わると推測された。残り2個についてはLPSがスムース型であったことから、A-LPSのO多糖生合成に関わると推測された。これまでに得られている知見と今回の結果から、少なくともA-LPSのO多糖生合成には少なくとも6個の遺伝子の関与があると考えられた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

歯周病関連細菌Porphyromonas gingivalisは9型分泌装置を持っており、保存されたC末端ドメインを有するタンパク質(CTD含有タンパク質)を分泌する。分泌されたタンパク質は、菌体表面のPorUプロテアーゼ(これも9型分泌装置で菌体表面に分泌されている)により、CTD領域が切断されるとともにA-LPSへ結合される。A-LPSはCTD含有タンパク質を菌体表面にアンカーすることから、その生合成機構の解明は重要である。
A-LPSのO多糖の合成については、最初の糖転移酵素としてWbaP、後期の糖転移酵素としてGtfBが関わることを見出していた。しかしながら、それ以外の糖転移酵素については不明であった。そこで、本菌のゲノム情報から、未解析の14個の糖転移酵素遺伝子に着目し、変異株作製を試みた。その結果、PGN_1026、PGN_1651、 PGN_1807、 PGN_2087の変異株は作製できなかった。残りの10個は変異株が作製できた。これらのうち、PGN_0361、 PGN_1240、 PGN_1668変異株は血液寒天培地上で黒色コロニー形成が減弱していた。また、これらの変異株はA-LPSを認識する抗体に全く反応しなかった。したがって、これらはA-LPS生合成に関わることを強く示唆している。PGN_1240変異株のLPSはラフ型を示し、その分子量からGtfBの直前の糖転移酵素であることが示唆された。一方、PGN_0361およびPGN_1668変異株のLPSはスムース型を示した。PGN_0361はPGN_1239のパラログであり、両者を変異するとLPSはラフ型を示した。これらのことから、PGN_0361はWbaPの次に働く糖転移酵素であると考えている。PGN_1668については、A-LPSのO多糖のどこに作用しているかは不明である。

Strategy for Future Research Activity

歯周病関連細菌Porphyromonas gingivalisの病原性に関わるA-LPSの構造の詳細を明らかにする為に、A-LPSのO多糖合成に関わる遺伝子の同定を行った。これまでの知見と今回の結果から、A-LPSのO多糖は細胞質内で、WbaP, PGN_0361, PGN_1240, GtfBにより主鎖の構造が構成され、VimFとPGN_1668により側鎖の構造が構成されるのではないかと考えている。次の目的は、A-LPSのO多糖の組成を明らかにすることである。A-LPSを抽出する為に温水フェノール法を使用するのであるが、A-LPSはCTD含有タンパク質と結合しているのでフェノール層に行く為、回収量のロスになっている可能性がある。それを回避する為に、9型分泌機構の欠損株を親株として、LPSを回収する。これまでのところ、O-LPSに特異的な遺伝子は同定されていない。したがって、porK(A-LPS+ O-LPS+), porK PGN_1239 (A-LPS+ O-LPS+), porK wbaP((A-LPS- O-LPS+), porK PGN_0361 (A-LPS- O-LPS+)株を嫌気下で大量培養して集菌しLPSを回収した後、O多糖の組成解析を行う予定である。

Causes of Carryover

物品費として想定していた金額の支出を抑えることができたため。

Expenditure Plan for Carryover Budget

平成29年度の物品費に未使用額を上乗せした金額で支出を予定している。

  • Research Products

    (13 results)

All 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (6 results) Remarks (3 results)

  • [Int'l Joint Research] The Scripps Research Institute/SLAC National Accelerator Laboratory(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      The Scripps Research Institute/SLAC National Accelerator Laboratory
  • [Journal Article] A Distinct Type of Pilus from the Human Microbiome2016

    • Author(s)
      Xu Q, Shoji M, Shibata S, Naito M, Sato K, Elsliger MA, Grant JC, Axelrod HL, Chiu HJ, Farr CL, Jaroszewski L, Knuth MW, Deacon AM, Godzik A, Lesley SA, Curtis MA, Nakayama K, Wilson IA.
    • Journal Title

      Cell

      Volume: 165(3) Pages: 690-703

    • DOI

      http://doi.org/10.1016/j.cell.2016.03.016

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Glycobiology of the oral pathogen Porphyromonas gingivalis and related species2016

    • Author(s)
      Shoji M, Nakayama K.
    • Journal Title

      Microbial Pathogenesis

      Volume: 94 Pages: 35-41

    • DOI

      http://doi.org/10.1016/j.micpath.2015.09.012

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Bacteroidia綱細菌群に存在するV型線毛の形成機構2016

    • Author(s)
      庄子幹郎, 中山浩次.
    • Journal Title

      臨床免疫・アレルギー科

      Volume: 66(6) Pages: 641-646

  • [Presentation] The type V pili in the Bacteroidia class bacteria: novel assembly mechanism2017

    • Author(s)
      庄子幹郎, Xu Q, 柴田敏史, 内藤真理子, 佐藤啓子, Wilson IA, 中山浩次.
    • Organizer
      第90回日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター (宮城県・仙台市)
    • Year and Date
      2017-03-19 – 2017-03-21
  • [Presentation] Porphyromonas ginigvalisのV型線毛の試験管内再構成による構造解析2017

    • Author(s)
      柴田敏史, 庄子幹郎, 中山浩次.
    • Organizer
      第90回日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター (宮城県・仙台市)
    • Year and Date
      2017-03-19 – 2017-03-21
  • [Presentation] Porphyromonas gingivalisのIX型分泌機構の調節メカニズムに関与する分子の解析2017

    • Author(s)
      雪竹英治,門脇知子,内藤真理子,佐藤啓子, 庄子幹郎,菊池有一郎,中山浩次.
    • Organizer
      第90回日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター (宮城県・仙台市)
    • Year and Date
      2017-03-19 – 2017-03-21
  • [Presentation] Bacteroidia綱細菌に存在する線毛の新たな形成機構2016

    • Author(s)
      庄子幹郎, Xu Q, 柴田敏史, 内藤真理子,佐藤啓子, Wilson IA, 中山浩次.
    • Organizer
      第69回日本細菌学会九州支部総会・第53回日本ウイルス学会九州支部総会
    • Place of Presentation
      宮崎市民プラザ (宮崎県・宮崎市)
    • Year and Date
      2016-09-01 – 2016-09-02
  • [Presentation] Structural and mechanistic into a distinct type of pilus2016

    • Author(s)
      庄子幹郎, Xu Q, 柴田敏史, 内藤真理子, 佐藤啓子, Wilson IA,中山浩次.
    • Organizer
      第58回歯科基礎医学会学術大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター (北海道・札幌市)
    • Year and Date
      2016-08-24 – 2016-08-26
  • [Presentation] Biogenesis mechanism of the Type V pili present in the Bacteroidia class2016

    • Author(s)
      庄子幹郎, Xu Q, 柴田敏史, 内藤真理子, 佐藤啓子, Wilson IA, 中山浩次
    • Organizer
      新学術領域研究「運動超分子が織りなす調和と多様性」第4回領域全体会議
    • Place of Presentation
      長崎大学 (長崎県・長崎市)
    • Year and Date
      2016-06-08 – 2016-06-10
  • [Remarks] 腸内の優勢細菌群の線毛形成機構の解明

    • URL

      http://www.nagasaki-u.ac.jp/ja/about/info/science/science104.html

  • [Remarks] ヒトの腸において優勢なBacteroidetes門細菌に見い出された線毛の新しい形成機構

    • URL

      http://first.lifesciencedb.jp/archives/12343

  • [Remarks] 長崎大学歯学部 歯周病基盤研究センター

    • URL

      http://www.de.nagasaki-u.ac.jp/perio/

URL: 

Published: 2018-01-16   Modified: 2022-02-16  

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