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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Analysis of cell membrane environments targeted by marine natural products

Research Project

Project/Area Number 16K13086
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

西村 慎一  京都大学, 薬学研究科, 助教 (30415260)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2018-03-31
Keywords海洋天然物 / 生体膜 / 膜脂質 / 酵母変異株
Outline of Annual Research Achievements

生理活性化合物の一次標的分子を同定することは、生命原理の理解においても創薬においても必須な過程であり、特にタンパク質を対象にした方法論の進展が目覚ましい。しかし生体膜を標的にする場合、タンパク質にはない特殊な膜環境が化合物の標的同定を困難にしている。すなわち、数百から数千の非常に多くの分子種が相互作用することで脂質膜の物性が制御されており、同じ脂質分子種であっても環境によって挙動が異なるため、外来分子による認識の程度が大きく変わる。本研究では酵母遺伝子変異株が示す薬剤感受性パターンを足掛かりに、抗生物質が標的にする生体膜環境の解明を目指す。
初年度には分裂酵母のステロールとスフィンゴ脂質の生合成と代謝に関連する遺伝子破壊株を用いて、膜脂質を標的にする化合物に対する薬剤感受性の測定と、それらの変異株が含有する脂質分子、特にステロールの成分分析を行った。本年度も感受性試験を継続し、膜脂質を標的とする化合物として新たに取得したものや合成化合物、共同研究先から供与された天然物について行った。脂質の解析としては、本年度はステロールエステルも対象にし、分裂酵母の主成分を合成標品との比較により明らかにした。化合物による脂質膜認識機構を明らかにするため、in vitroでの脂質親和性をSPRと溶血活性試験を用いて検討し、特にステロールについては天然型に加えて各種の合成誘導体を用いて親和性試験を行った。膜脂質の網羅的解析のためにはスフィンゴ脂質の解析が必要であるが、この分子種については各種変異株を用いて検討中であり、分子種の特定を含めて今後の課題である。

  • Research Products

    (7 results)

All 2018 2017 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Florida(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      University of Florida
  • [Int'l Joint Research] Universidad de Salamanca(スペイン)

    • Country Name
      SPAIN
    • Counterpart Institution
      Universidad de Salamanca
  • [Presentation] Aggregate formation and lipid-related activity of 5aTHQs, cryptic actinomycete metabolites2018

    • Author(s)
      Shinichi Nishimura, Ryosuke Sugiyama, Takahiro Nakatani, Taro Ozaki, Shumpei Asamizu, Hiroyasu Onaka, Hideaki Kakeya
    • Organizer
      日本化学会年会 Asian International Symposium -Medicinal Chemistry-
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] サポニンとステロールの分子間相互作用における炭化水素平面と水酸基の重要性2017

    • Author(s)
      西村慎一、伊藤愛理、高橋伸明、掛谷秀昭
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会 第 12 回年会
  • [Presentation] ステロールを標的にする抗真菌化合物セオネラミドによる細胞壁異常2017

    • Author(s)
      西村慎一、徳倉将人、掛谷秀昭、松永茂樹、大隅正子、生瀬義久、Vanessa S. D. Carvalho、 Juan C. G. Cortes、Juan. C. Ribas
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム 第50回研究報告会
  • [Presentation] スフィンゴ脂質の機能解明を目指した化学遺伝学的解析:エキノマイシン類の取得とその表現型2017

    • Author(s)
      生田実沙, 伊藤愛理, 西村慎一, 掛谷秀昭
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム 第50回研究報告会
  • [Presentation] 放線菌のクリプティック代謝物5aTHQによる凝集体形成と脂質関連活性2017

    • Author(s)
      西村慎一
    • Organizer
      京都大学 生理化学研究ユニット 第7回シンポジウム
    • Invited

URL: 

Published: 2018-12-17  

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