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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Development of Light-up type G-quadruplex ligand for live cell imaging

Research Project

Project/Area Number 16K13094
Research InstitutionTokyo University of Agriculture and Technology

Principal Investigator

長澤 和夫  東京農工大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (10247223)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Keywordsグアニン4重鎖 / ライトアップ / リガンド / 大環状ポリオキサゾール / 蛍光リガンド
Outline of Annual Research Achievements

グアニン四重鎖(以下G4)は、グアニンが豊富な核酸の1本鎖領域で可逆的に形成される核酸の高次構造である。近年、DNAの複製、遺伝子の転写調節などの生命現象を直接的に制御することが報告されている。また、がんなどの難治生疾患の分子標的としての研究も精力的に行われている。現在、G4を介した生命現象を明らかにするために、生細胞内でのG4形成の直接的な可視化に関して、精力的に研究展開されている。
本研究では生細胞内でのG4形成を、リガンドを用いて直接可視化することを計画した。特に、G4構造を形成したときに相互作用し、同時に蛍光を発するライトアップ型リガンドの創製を目的とした。
これまでに我々は、G4と選択的かつ強力に相互作用する大環状ヘキサオキサゾール化合物(以下6OTD)の創製を報告し、そのG4に対する相互作用様式も明らかにしている。そこでこれらの知見を基に、6OTDの側鎖にG4との会合により蛍光特性が変化する置換基候補としてナフチル基を設計し、これを導入した化合物の合成を行った。その結果、当該リガンドは、G4形成配列と選択的に相互作用し、かつその構造を安定化すること、また相互作用することで蛍光特性が大きく変化することがわかった。この蛍光特性の変化は、核酸との相互作用による疎水場効果によることもわかった。そこで、本結果をもとに、新たにナフチル基に電子求引基、電子供与基を置換したリガンドを系統的に合成した。その結果、その中の一つの化合物に、G4と相互作用することで蛍光を発するライトアップ型の特性を有するリガンドを見出すことができた。

  • Research Products

    (19 results)

All 2019 2018 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (9 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Peer Reviewed: 9 results,  Open Access: 1 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] 浦項工科大学校(韓国)

    • Country Name
      KOREA (REP. OF KOREA)
    • Counterpart Institution
      浦項工科大学校
  • [Journal Article] Model studies for isolation of G-quadruplex-forming DNA sequences through a pull-down strategy with macrocyclic polyoxazole2019

    • Author(s)
      Iida Keisuke、Tsushima Yamato、Ma Yue、Sedghi Masoud Shadi、Sakuma Mai、Yokoyama Tomomi、Yoshida Wataru、Ikebukuro Kazunori、Nagasawa Kazuo
    • Journal Title

      Bioorganic & Medicinal Chemistry

      Volume: 27 Pages: 1742~1746

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2019.02.056

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synthesis and Telomeric G-Quadruplex-Stabilizing Ability of Macrocyclic Hexaoxazoles Bearing Three Side Chains2019

    • Author(s)
      Ma Yue、Iida Keisuke、Sasaki Shogo、Hirokawa Takatsugu、Heddi Brahim、Phan Anh、Nagasawa Kazuo
    • Journal Title

      Molecules

      Volume: 24 Pages: 263~263

    • DOI

      10.3390/molecules24020263

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Synthesis of All Stereoisomers of RK460 and Evaluation of Their Activity and Selectivity as Abscisic Acid Receptor Antagonists2019

    • Author(s)
      Mikame Yu、Yoshida Kazuko、Hashizume Daisuke、Hirai Go、Nagasawa Kazuo、Osada Hiroyuki、Sodeoka Mikiko
    • Journal Title

      Chemistry: A European Journal

      Volume: 25 Pages: 3496~3500

    • DOI

      10.1002/chem.201806056

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Binding of a Telomestatin Derivative Changes the Mechanical Anisotropy of a Human Telomeric G-Quadruplex2018

    • Author(s)
      Jonchhe Sagun、Ghimire Chiran、Cui Yunxi、Sasaki Shogo、McCool Mason、Park Soyoung、Iida Keisuke、Nagasawa Kazuo、Sugiyama Hiroshi、Mao Hanbin
    • Journal Title

      Angewandte Chemie International Edition

      Volume: 58 Pages: 877~881

    • DOI

      10.1002/anie.201811046

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Random Formation of G-Quadruplexes in the Full-Length Human Telomere Overhangs Leads to a Kinetic Folding Pattern with Targetable Vacant G-Tracts2018

    • Author(s)
      Abraham Punnoose Jibin、Ma Yue、Hoque Mohammed Enamul、Cui Yunxi、Sasaki Shogo、Guo Athena Huixin、Nagasawa Kazuo、Mao Hanbin
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 57 Pages: 6946~6955

    • DOI

      10.1021/acs.biochem.8b00957

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Molecular architecture of G-quadruplex structures generated on duplex Rif1-binding sequences2018

    • Author(s)
      Masai Hisao、Kakusho Naoko、Fukatsu Rino、Ma Yue、Iida Keisuke、Kanoh Yutaka、Nagasawa Kazuo
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 293 Pages: 17033~17049

    • DOI

      10.1074/jbc.RA118.005240

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A force sensor that converts fluorescence signal into force measurement utilizing short looped DNA2018

    • Author(s)
      Mustafa Golam、Chuang Cho-Ying、Roy William A.、Farhath Mohamed M.、Pokhrel Nilisha、Ma Yue、Nagasawa Kazuo、Antony Edwin、Comstock Matthew J.、Basu Soumitra、Balci Hamza
    • Journal Title

      Biosensors and Bioelectronics

      Volume: 121 Pages: 34~40

    • DOI

      10.1016/j.bios.2018.08.073

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Analysis of Interactions between Telomeric i-Motif DNA and a Cyclic Tetraoxazole Compound2018

    • Author(s)
      Sedghi Masoud Shadi、Yamaoki Yudai、Ma Yue、Marchand Adrien、Winnerdy Fernaldo Richtia、Gabelica Valerie、Phan Anh Tuan、Katahira Masato、Nagasawa Kazuo
    • Journal Title

      ChemBioChem

      Volume: 19 Pages: 2268~2272

    • DOI

      10.1002/cbic.201800425

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Development of G-quadruplex ligands for selective induction of a parallel-type topology2018

    • Author(s)
      Ma Yue、Tsushima Yamato、Sakuma Mai、Sasaki Shogo、Iida Keisuke、Okabe Sachiko、Seimiya Hiroyuki、Hirokawa Takatsugu、Nagasawa Kazuo
    • Journal Title

      Organic & Biomolecular Chemistry

      Volume: 16 Pages: 7375~7382

    • DOI

      10.1039/C8OB01702F

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] テロメアグアニン四重鎖構造をアンチパラレル型に誘起する鎖状型ヘキサオキサゾール化合物の合成および物性評価2019

    • Author(s)
      佐々木捷悟、松田未沙子、馬 悦、長澤和夫
    • Organizer
      日本化学会 第99春季年会
  • [Presentation] グアニン四重鎖を標的としたLight-up型蛍光リガンドの創製研究2019

    • Author(s)
      若林勇樹、馬悦、飯田圭介、齋藤良太、長澤和夫
    • Organizer
      日本化学会 第99春季年会
  • [Presentation] グアニン四重鎖選択的に蛍光特性の変化するリガンドの創製2018

    • Author(s)
      馬悦、飯田圭介、齋藤良太、長澤和夫
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会 第13回年会
  • [Presentation] The interaction analysis of a cyclic tetraoxazole with telomeric i-motif DNA2018

    • Author(s)
      Shadi Sedghi Masoud, Yudai Yamaoki, Yue Ma, Adrian Marchand, Fernaldo Richtia Winnerdy, Valerie Gabelica, Anh Tuan Phan, Masato Katahira, Kazuo Nagasawa
    • Organizer
      ISNAC 2018 (The 45rd International Symposium on Nucleic Acids Chemistry)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Development of linear hexaoxazoles as topology-selective G-quadruplex stabilizing ligands2018

    • Author(s)
      Shogo SASAKI, Yue Ma, Kazuo Nagasawa
    • Organizer
      BIONIC2018
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Design and synthesis of macrocyclic hexaoxazole compounds as G-quadruplex ligands2018

    • Author(s)
      Yue Ma, Shogo Sasaki, Masayuki Tera, Keiko Shimamoto, Kazuo Nagasawa
    • Organizer
      2nd International BMS Symposium 2018 in Kyoto
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 大環状ヘキサオキサゾール誘導体を用いた生細胞内でのグアニン四重鎖構造の可視化2018

    • Author(s)
      安田瑞穂、馬悦、岡部幸子、清宮啓之、Young-Tae Chang、長澤和夫
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会 第13回年会
  • [Presentation] In situ Click反応を基盤とする生細胞中でのG4の可視化2018

    • Author(s)
      安田瑞穂、馬悦、岡部幸子、Young-Tae Chang、清宮啓之、長澤和夫
    • Organizer
      第36回メディシナルケミストリーシンポジウム
  • [Remarks] 生細胞内での核酸高次構造の動態解析

URL: 

Published: 2019-12-27  

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