• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2018 Fiscal Year Annual Research Report

Topology and entropy of polymers

Research Project

Project/Area Number 16K13751
Research InstitutionSaitama University

Principal Investigator

下川 航也  埼玉大学, 理工学研究科, 教授 (60312633)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Keywords格子結び目 / エントロピー / 局所結び目 / 結び目解消操作
Outline of Annual Research Achievements

この研究では、希薄溶液内のDNAやタンパク質などの環状高分子のモデルとして考察される、立方格子に埋め込まれた結び目(格子結び目)について、そのトポロジーに関する研究と統計力学的エントロピーに相当する指数関数的増大度の研究を行った。ここで考える格子結び目は、3次元ユークリッド空間において全ての座標が整数である有限個の点とそれらの点を結ぶ長さが1の辺有限個で構成される結び目、絡み目である。
今年度の研究では、石原海氏、Chris Soteros氏、Nicholas Beaton氏、Jeremy Eng氏とともに、チューブ状領域内の格子結び目の局在化に関する論文をSoft Matterに発表した。この研究は、ナノチャンネルを通過するDNAのモデル化への応用があり、既に関連論文に引用されており、注目を集めている。
また、チューブ領域内の格子結び目の結び目、絡み目解消操作に関する研究と、その研究の格子結び目の統計力学的エントロピーの研究への応用研究に関する結果を、論文にまとめている。ここでは、4-platの位置にある結び目や絡み目についての交差交換とバンド手術に関する特徴付けを行い、その統計力学的応用を考察している。この論文は今後投稿予定である。
これらの研究を行うために、Chris Soteros氏、 Nicholas Beaton氏、Jeremy Eng氏と、カナダと東京において研究打ち合わせを行った。

  • Research Products

    (12 results)

All 2019 2018 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 5 results) Remarks (1 results) Funded Workshop (2 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Saskatchewan(カナダ)

    • Country Name
      CANADA
    • Counterpart Institution
      University of Saskatchewan
  • [Int'l Joint Research] University of Melbourne(オーストラリア)

    • Country Name
      AUSTRALIA
    • Counterpart Institution
      University of Melbourne
  • [Journal Article] Neighborhood equivalence for multibranched surfaces in 3-manifolds2019

    • Author(s)
      Ishihara Kai、Koda Yuya、Ozawa Makoto、Shimokawa Koya
    • Journal Title

      Topology and its Applications

      Volume: 257 Pages: 11~21

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.topol.2019.02.005

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterising knotting properties of polymers in nanochannels2018

    • Author(s)
      Beaton N. R.、Eng J. W.、Ishihara K.、Shimokawa K.、Soteros C. E.
    • Journal Title

      Soft Matter

      Volume: 14 Pages: 5775~5785

    • DOI

      10.1039/c8sm00734a

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] トポロジーと高分子科学2019

    • Author(s)
      下川航也
    • Organizer
      日本数学会 2019年度年会企画特別講演
    • Invited
  • [Presentation] 結び目理論の高分子科学への応用 -- DNA組換え酵素、高分子化学、 材料科学、統計力学的エントロピー--2018

    • Author(s)
      下川航也
    • Organizer
      名古屋大学多元数理科学研究科談話会
    • Invited
  • [Presentation] Knots, links and spatial graphs in the simple cubic lattice2018

    • Author(s)
      Koya Shimokawa
    • Organizer
      2018 Fall AMS Sectional Meeting, San Francisco State University
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Knots, links and spatial graphs in the simple cubic lattice2018

    • Author(s)
      Koya Shimokawa
    • Organizer
      研究集会「トポロジーとコンピュータ2018」
    • Invited
  • [Presentation] Lattice knots and links in tube regions2018

    • Author(s)
      Koya Shimokawa
    • Organizer
      33rd Summer Conference on Topology and its Applications
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] 下川航也ホームページ

    • URL

      http://www.rimath.saitama-u.ac.jp/lab.jp/KoyaShimokawa.html

  • [Funded Workshop] International Symposium “Polymers meet Topology”2019

  • [Funded Workshop] 国際ワークショップ “The Topology of Nucleic Acids: Research at the Interface of Low-Dimensional Topology, Polymer Physics and Molecular Biology” (19w5226)2019

URL: 

Published: 2019-12-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi