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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Dynamism of a proton-driven protein translocation motor.

Research Project

Project/Area Number 16K14713
Research InstitutionNara Institute of Science and Technology

Principal Investigator

塚崎 智也  奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 准教授 (80436716)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2018-03-31
Keywordsタンパク質
Outline of Annual Research Achievements

細胞質で合成されたタンパク質が細胞膜を越えて輸送される過程は,すべての生物に保存されている。真正細菌ではモータータンパク質SecA ATPaseがタンパク質膜透過チャネルSecYEG複合体と相互作用し,SecA がATPの加水分解に伴うダイナミックな構造変化を繰り返すことで,タンパク質の膜透過を駆動する。これまでX線結晶構造解析などによりSecタンパク質の構造解析が達成され,構造情報に基づいた機能解析も進められてきた。しかしながら,Secタンパク質によるタンパク質膜透過の動的な解析の報告はなく,タンパク質膜透過反応については不明な点が多く残っている.動的解析を進めるにあたり,タンパク質膜透過反応の煩雑な系を単純化するため,SecYとSecAをリンカーで繋いだ融合タンパク質を用いて,SecY-A/E/G複合体(SecYAEG)を調製し,その機能の解析を進めた.SecYAEGはタンパク質膜透過活性を持ち,Nanodiscと呼ばれる1ユニット再構成系を用いて,基質タンパク質であるproOmpAと相互作用することを明らかにした.動的構造解析は優れた時空間分解能を持つ高速原子間力顕微鏡(高速AFM)を用いて測定を行った.まずNanodiscに再構成されたSecYEGとSecYAEGをSecAが検出できる細胞質側が上向きで固定化することに成功し,SecAがSecY上に位置し構造変化することを確認した.本研究によりSecタンパク質によるタンパク質膜透過の動的解析が進展し,高速AFMによるNanodiscを用いた膜タンパク質の動的解析の手法が確立できた.

  • Research Products

    (12 results)

All 2018 2017 Other

All Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 5 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 2 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Remote Coupled Drastic β-Barrel to β-Sheet Transition of the Protein Translocation Motor2018

    • Author(s)
      Furukawa Arata、Nakayama Shintaro、Yoshikaie Kunihito、Tanaka Yoshiki、Tsukazaki Tomoya
    • Journal Title

      Structure

      Volume: 26 Pages: 485~489

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.str.2018.01.002

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The TPR domain of BepA is required for productive interaction with substrate proteins and the β-barrel assembly machinery complex2017

    • Author(s)
      Daimon Yasushi、Iwama-Masui Chigusa、Tanaka Yoshiki、Shiota Takuya、Suzuki Takehiro、Miyazaki Ryoji、Sakurada Hiroto、Lithgow Trevor、Dohmae Naoshi、Mori Hiroyuki、Tsukazaki Tomoya、Narita Shin-ichiro、Akiyama Yoshinori
    • Journal Title

      Mol. Microbiol.

      Volume: 106 Pages: 760~776

    • DOI

      https://doi.org/10.1111/mmi.13844

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Crystal Structure of a Plant Multidrug and Toxic Compound Extrusion Family Protein2017

    • Author(s)
      Tanaka Yoshiki、Iwaki Shigehiro、Tsukazaki Tomoya
    • Journal Title

      Structure

      Volume: 25 Pages: 1455~1460

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.str.2017.07.009

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] SecY-SecA fusion protein retains the ability to mediate protein transport2017

    • Author(s)
      Sugano Yasunori、Furukawa Arata、Nureki Osamu、Tanaka Yoshiki、Tsukazaki Tomoya
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 12 Pages: e0183434

    • DOI

      https://doi.org/10.1371/journal.pone.0183434

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Tunnel Formation Inferred from the I -Form Structures of the Proton-Driven Protein Secretion Motor SecDF2017

    • Author(s)
      Furukawa Arata、Yoshikaie Kunihito、Mori Takaharu、Mori Hiroyuki、Morimoto Yusuke V.、Sugano Yasunori、Iwaki Shigehiro、Minamino Tohru、Sugita Yuji、Tanaka Yoshiki、Tsukazaki Tomoya
    • Journal Title

      Cell Rep.

      Volume: 19 Pages: 895~901

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.celrep.2017.04.030

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Structure-based working model of SecDF, a bacterial protein translocation motor2018

    • Author(s)
      Tomoya Tsukazaki
    • Organizer
      Gordon Research Conference: Protein Transport Across Cell Membranes
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Protein Translocation Motor SecDF2017

    • Author(s)
      Tomoya Tsukazaki
    • Organizer
      New trends for Structural Life Science
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Snapshots of the proton-driven protein secretion motor2017

    • Author(s)
      塚崎智也
    • Organizer
      第17回日本蛋白質科学会年会
  • [Presentation] タンパク質膜透過駆動モータータンパク質 SecDF2017

    • Author(s)
      塚崎智也
    • Organizer
      第14回21世紀大腸菌研究会
  • [Presentation] Protein translocation motor SecDF2017

    • Author(s)
      Tomoya Tsukazaki
    • Organizer
      International Symposium on Protein Quality Control
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Book] 生物物理Vol.582018

    • Author(s)
      日本生物物理学会
    • Total Pages
      120(78-82)
    • Publisher
      中西印刷株式会社
  • [Remarks] 細胞膜を越えてタンパク質を輸送するモータータンパク質の詳細な作動原理を解明

    • URL

      http://www.naist.jp/pressrelease/2017/05/003760.html

URL: 

Published: 2018-12-17  

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