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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Trials of CRISPR/Cas9 for plant mitochondrial genome editing

Research Project

Project/Area Number 16K14827
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

有村 慎一  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 准教授 (00396938)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2018-03-31
Keywordsミトコンドリアゲノム / 植物ミトコンドリア / ゲノム編集 / ミトコンドリアゲノム編集
Outline of Annual Research Achievements

植物ミトコンドリアゲノムは人為改変が不可能な最後のゲノムである。最近、ゲノム編集技術mitoTALENを用いることで、ミトコンドリアゲノムの任意箇所の切断、修復、ゲノム構造変化を引き起こすことができることが明らかになった。本申請研究では、核ゲノム編集でよく使われる、より作成とDNA切断効率の高いCRISPR/Cas9法をミトコンドリアゲノム編集に適用させるという挑戦である。ミトコンドリア内のDNAを標的切断するために、この人工制限酵素をミトコンドリアへ輸送させる必要があり、Cas9タンパク質にミトコンドリアマトリクス局在シグナル配列(Arabidopsis thaliana ATPase delta prime subunit presequence)を付加した。既にmitoTALENを用いて成功が確認されている遺伝子破壊標的配列について、同じ箇所のDNA切断を試みたが、残念ながらCRISPR/Cas9法では、ミトコンドリアゲノムDNAの切断/変異導入/DNA消失などは認められなかった。ほ乳類細胞では同様のCRISPR/Cas9法で、ゲノムDNA切断/消失が一報報告されているが、これを否定する文献が多数出ている。Cas9タンパク質のミトコンドリアへの局在だけでなく、標的配列認識に必要なguide RNAの局在も必要であると考えられ、これについては未だ有力な方法が見つかっていない。しかし、申請者らが同時並行で進めてきたmitoTALEN法の簡便改良法の技術開発が進み、これによって、簡便で高効率のミトコンドリアゲノム編集が達成できる見通しが得られた。

  • Research Products

    (8 results)

All 2018 2017

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 6 results) Presentation (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Fission and fusion of plant mitochondria, and genome maintenance.2018

    • Author(s)
      Shin-ichi Arimura
    • Journal Title

      Plant Physiology

      Volume: 176 Pages: 152-161

    • DOI

      10.1104/pp.17.01025.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Alterations of membrane lipid content correlated with chloroplasts and mitochondria development in Euglena gracilis.2018

    • Author(s)
      Shibata S., Arimura S, Ishikawa T. and Awai K.
    • Journal Title

      Front. Plant Sci.

      Volume: 該当なし Pages: 該当なし

    • DOI

      10.3389/fpls.2018.00370

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Conserved functional control, but distinct regulation of cell proliferation in rice and Arabidopsis leaves revealed by comparative analysis of GRF-INTERACTING FACTOR 1 orthologs.2018

    • Author(s)
      Shimano S, Hibara KI, Furuya T, Arimura S, Tsukaya H, Itoh JI,
    • Journal Title

      Frontiers in Plant Sciene

      Volume: 該当なし Pages: 該当なし

    • DOI

      10.1242/dev.159624.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] DRP3 and ELM1 are required for mitochondrial fission in the liverwort Marchantia polymorpha.2017

    • Author(s)
      Nagaoka N, Yamashita A, Kurisu R, Watari Y, Ishizuna F, Tsutsumi N, Ishizaki K, Kohchi T, Arimura* S
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 7 Pages: 該当なし

    • DOI

      10.1038/s41598-017-04886-0.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 植物ミトコンドリアゲノムの不思議とその改変の試み,2017

    • Author(s)
      有村慎一 髙梨秀樹
    • Journal Title

      植物の生長調節

      Volume: 52 Pages: 25-30

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Cold Treatment Induces Transient Mitochondrial Fragmentation in Arabidopsis thaliana in a Way that Requires DRP3A but not ELM1 or an ELM1-Like Homologue, ELM22017

    • Author(s)
      Arimura* S, Kurisu R, Sugaya H., Kadoya N. and Tsutsumi N.
    • Journal Title

      Int. J. Mol. Sci.

      Volume: 18 Pages: 該当なし

    • DOI

      10.3390/ijms18102161

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Dynamics of mitochondria and their nucleoids in Arabidopsis and Marchantia.2017

    • Author(s)
      Shin-ichi Arimura
    • Organizer
      TJPB2017, Join meeting of JSPP and Taiwan society for plant biology,
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 植物ミトコンドリアゲノムの編集方法2017

    • Inventor(s)
      有村慎一、風間智彦、片山健太、日高朋美、鳥山欽哉、堤伸浩
    • Industrial Property Rights Holder
      有村慎一、風間智彦、片山健太、日高朋美、鳥山欽哉、堤伸浩
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2017- 24923

URL: 

Published: 2019-12-27  

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