2016 Fiscal Year Research-status Report
合成生物学的手法を利用した人工生合成経路設計技術の開発
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16K14880
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
勝山 陽平 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 准教授 (50646437)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2018-03-31
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| Keywords | バイオセンサー / 指向性進化 / 酵素 / 生合成 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
XylSをlacプロモーターの下流に配置したプラスミドを構築した。また、Pmプロモーター (XylSにより認識され活性化するプロモーター) の下流にアンピシリン耐性遺伝子とtetR遺伝子からなるオペロンを配置、tetRプロモーターの下流にクロラムフェニコール耐性遺伝子を配置したプラスミドを構築した (プラスミド2)。これらふたつのプラスミドをもつ大腸菌はXylSのリガンドであるm-トルイル酸存在かではアンピシリン耐性、クロラムフェニコール感受性となった。また、m-トルイル酸非存在下では逆にアンピシリン感受性、クロラムフェニコール耐性となった。この大腸菌を利用して、偽陽性を排除しつつ、指向性進化によりXylSのリガンド特異性の改変を目指した。まず、モデル実験としてp-トルイル酸を選択的に認識する変異XylSの構築を目指した。6サイクルの変異実験の結果、p-トルイル酸を優位に認識する。変異XylSの取得に成功した。
また、QdoRを用いて同様のスクリーニング系の構築を目指した。しかし、構築したスクリーニング系では大腸菌が期待通りの薬剤耐性を示さず、リガンドのうむでクロラムフェニコール耐性に大きな差が生じなかった。そのため、転写抑制因子であるQdoRはこのスクリーニングに向かないと結論した。
次に、フラボノイドを認識する転写活性化因子であるFdeRを利用して、III型PKSの環化特異性改変系の構築を目指した。fdeRをlacプロモーターの下流に、クロラムフェニコール耐性遺伝子をFdeR認識プロモーターの下流に配置したプラスミドを構築した。このプラスミドと過去に構築したpET-CHS/CHI, pRSF-ACCを保持する大腸菌p-coumaroyl-NACを与えたところ、クロラムフェニコール耐性となった。このプラスミドを用いることでCHSのエンジニアリングが可能と考えられる。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
当初、QdoRを主軸にしたスクリーニング系の開発に取り組んだが、QdoRは転写抑制因子で在り、QdoRを用いた実験を通して、リプレッサーは本実験に適さないことが示された。そのため、新たにフラボノイドを認識する転写活性化因子としてFdeRを導入した。途中、研究対象を変更したため、スクリーニング系の構築に時間がかかった。
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| Strategy for Future Research Activity |
1. XylSのリガンド認識能の改変 引き続き、XylSのリガンド認識能の改変を目指す。すでに、p-トルイル酸を認識するXylSの取得に成功している。しかし、現状はp-トルイル酸、m-トルイル酸の両方を認識するXylSのみが得られている。バイオセンサーのエンジニアリングに当たって、選択制の進化は極めて重要な課題である。そこで、今後は本スクリーニング系を応用することで、野生型のXylSが認識するm-トルイル酸を認識せず、p-トルイル酸のみを認識しるXylSの構築を目指す。また、p-トルイル酸を認識しるXylSの構築に成功したら、得られた変異XylSをさらにテレフタル酸を選択的に認識するXylSへと変換する。
2. STSをCHS認識XylSへと変換 昨年度構築した系を用い、STSにランダム変異導入し、CHS活性をもつよう変化した変異STSを構築する。
3. テレフタル酸生合成経路の構築 上記二つの課題に成功したら、P450とメチルトランスフェラーゼを利用して、テレフタル酸を生合成する経路の構築を目指す。
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| Causes of Carryover |
スクリーニング系の構築に時間がかかったため、変異ライブラリー調製に用いる費用が減少したため。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
変異ライブラリーの構築に用いる。主に、合成DNAを利用した変異ライブラリーの構築、ランダム変異を導入するためのキットの購入に用いる。
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Research Products
(1 results)
