• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2016 Fiscal Year Research-status Report

小分子シグナル化合物による休眠二次代謝遺伝子の一括発現と有用生物活性物質の探索

Research Project

Project/Area Number 16K14915
Research InstitutionHiroshima University

Principal Investigator

荒川 賢治  広島大学, 先端物質科学研究科, 准教授 (80346527)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2018-03-31
Keywordsシグナル分子 / 二次代謝生合成 / 放線菌 / ゲノムマイニング
Outline of Annual Research Achievements

Streptomyces属放線菌の二次代謝は、ごく微量(nMオーダー)の微生物ホルモン様シグナル分子により誘導制御されている。シグナル分子の構造に注目すると、約60%の放線菌がgamma-ブチロラクトン型分子を持つと推測されており、残り40%の分子構造多様性に興味が持たれた。本研究では、申請者が見出した2,3-二置換ブテノライド型シグナル分子SRBに注目し、菌群における多様性解析および生合成機構・構造活性相関、さらには合成酵素と機能の相関性の解明を目指した。平成28年度は以下の項目を実施した。

[課題1]SRB型シグナル分子の多様性解析
約50株の放線菌について醋酸エチル抽出し、SRB合成欠損株KA20株への添加実験を行ったところ、ランカサイジン(LC)およびランカマイシン(LM)の生産回復は認められなかった。本成果は、放線菌におけるSRB型分子の特異性を示唆している。
[課題2]高機能化を指向したSRBの生合成機構解析
P450モノオキシゲナーゼSrrOは、SRB生合成におけるC-6'メチレン基の酸化反応を司っていることが明らかになった。また、C-1'の水酸基の立体化学に関しては、R体、S体ともにC-6'メチレン酸化反応が同程度の反応効率で進行しており、SrrOの基質認識は比較的寛容であることが分かった。また、リダクターゼSrrG,およびホスファターゼSrrPの、SRB生合成への関与も見出すことができた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

[課題1]において、供試菌50株のシグナル分子はSRB分子でないことが見出せた。本成果は、放線菌におけるSRB型分子の特異性を示唆しており、シグナル分子の多様性解析および新規骨格の発見、さらにそれに伴う二次代謝生産誘導系の構築など、多面的な研究展開の可能性を示すことができた。
[課題2]において、反応部位(C-6'位)から離れた官能基の立体化学(C-1'位)は、反応速度に全く影響を及ぼさないことが分かった。また、リダクターゼSrrG,およびホスファターゼSrrPの、SRB生合成への関与が示唆された。シグナル分子生合成は、その生産量が少ないことから、変換メカニズムの詳細な分子基盤はもちろんのこと、誘導体化などの知見もほとんどない。本成果がシグナル分子生合成の基本システムの理解につながることが大いに期待できる。

Strategy for Future Research Activity

[課題1]において、供試菌のさらなる解析を進める。具体的には、広島大学保存菌株の80株に注目する。また、Kitasatospora, Amycolatopsisなど稀少放線菌のシグナル分子にも注目する。
[課題2]において、リダクターゼSrrG,およびホスファターゼSrrPの機能解析を目指し、破壊株からのシグナル分子の抽出・単離・構造決定を遂行する。また、[課題3]として「休眠二次代謝遺伝子の発現誘導」も手がける。

  • Research Products

    (25 results)

All 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (17 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 6 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Alberta(カナダ)

    • Country Name
      CANADA
    • Counterpart Institution
      University of Alberta
  • [Int'l Joint Research] Weizmann Institute of Science(イスラエル)

    • Country Name
      ISRAEL
    • Counterpart Institution
      Weizmann Institute of Science
  • [Journal Article] Molecular characterization of aspartylglucosaminidase, a lysosomal hydrolase upregulated during strobilation in the moon jellyfish, Aurelia aurita2017

    • Author(s)
      Natsumi Tsujita, Hiroyuki Kuwahara, Hiroki Koyama, Noriyuki Yanaka, Kenji Arakawa, Hisato Kuniyoshi
    • Journal Title

      Biosci. Biotechnol. Biochem.

      Volume: 81 Pages: 938-950

    • DOI

      10.1080/09168451.2017.1285686

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A flavanone derivative from the Asian medicinal herb (Perilla frutescens) potently suppresses IgE-mediated immediate hypersensitivity reactions2017

    • Author(s)
      Rikiya Kamei, Takashi Fujimura, Miki Matsuda, Kotaro Kakihara, Noriko Hirakawa, Kenji Baba, Kazuhisa Ono, Kenji Arakawa, Seiji Kawamoto
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Commun.

      Volume: 483 Pages: 674-679

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2016.12.083

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Antitumor activity of lankacidin antibiotics is due to microtubule stabilization via a paclitaxel-like mechanism2016

    • Author(s)
      Ahmed Taha Ayoub, Rabab Ahmed, Jack Xiao, Cody Wayne Lewis, Tatiana Tilli, Kenji Arakawa, Yosi Nindita, Gordon Chan, Luxin Sun, Mark Glover, Mariusz Klobukowski, Jack Tuszynski
    • Journal Title

      J. Med. Chem.

      Volume: 59 Pages: 9532-9540

    • DOI

      10.1021/acs.jmedchem.6b00597

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] 放線菌のシグナル分子制御系改変による休眠二次代謝の誘導2016

    • Author(s)
      荒川 賢治
    • Journal Title

      バイオサイエンスとインダストリー

      Volume: 74 Pages: 40-42

  • [Journal Article] 放線菌Streptomyces rocheiの抗生物質生産を誘導するシグナル分子SRBの単離・構造決定および生合成2016

    • Author(s)
      波多江 希,津田 直人,木梨 陽康,荒川 賢治
    • Journal Title

      第53回天然有機化合物討論会講演要旨集,

      Volume: 53 Pages: 575-580

    • Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] ミズクラゲのストロビレーションに伴って発現増加するリソソーム加水分解酵素遺伝子群の解析2017

    • Author(s)
      辻田 菜摘, 小山 寛喜, 辻 敏之, 矢中 規之, 荒川 賢治, 国吉 久人
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学
    • Year and Date
      2017-03-20
  • [Presentation] Analysis of secondary metabolites in plasmidless mutants of Streptomyces rochei 7434AN42017

    • Author(s)
      Yosi Nindita, Kuninobu Inada, Haruyasu Kinashi, and Kenji Arakawa
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学
    • Year and Date
      2017-03-18
  • [Presentation] 放線菌Streptomyces rocheiの抗生物質生産誘導シグナル分子SRBの生合成経路の網羅的解析2017

    • Author(s)
      手島 愛子, 波多江 希, 津田 直人, 謝 麗, 河原 弘幸, 木梨 陽康, 荒川 賢治
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学
    • Year and Date
      2017-03-18
  • [Presentation] 放線菌Streptomyces rocheiの多重変異株が生産するアゾキシアルケン化合物 KA57-A の生合成機構2017

    • Author(s)
      岸本 拓也, 國武 博文, Yosi Nindita, 木梨 陽康, 福本 敦, 安齊 洋次郎, 荒川 賢治
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学
    • Year and Date
      2017-03-18
  • [Presentation] Biosynthetic investivation of secondary metabolites induced by genome-wide metabolic engineering2017

    • Author(s)
      Kenji Arakawa
    • Organizer
      2nd US-Japan Seminar on the Biosynthesis of Natural Products for Young Researche
    • Place of Presentation
      東京工業大学
    • Year and Date
      2017-03-04
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 代謝制御系の合理的改変による休眠二次代謝のゲノムマイニング2016

    • Author(s)
      荒川 賢治
    • Organizer
      HiHA第8回Workshop
    • Place of Presentation
      広島大学先端研
    • Year and Date
      2016-12-16
    • Invited
  • [Presentation] 放線菌Streptomyces rochei生合成制御系変異株の二次代謝プロファイル解析2016

    • Author(s)
      岩國 美由季,高橋 譲,鈴木 敏弘,木梨 陽康,荒川 賢治
    • Organizer
      日本生物工学会第68回大会
    • Place of Presentation
      富山国際会議場
    • Year and Date
      2016-09-30
  • [Presentation] 放線菌二次代謝合成・制御系の合理的改変による休眠二次代謝の発掘2016

    • Author(s)
      荒川 賢治
    • Organizer
      第68回日本生物工学会大会シンポジウム
    • Place of Presentation
      富山国際会議場
    • Year and Date
      2016-09-29
    • Invited
  • [Presentation] 放線菌Streptomyces rocheiの抗生物質生産を誘導するシグナル分子SRBの単離・構造決定および生合成2016

    • Author(s)
      波多江 希,津田 直人,木梨 陽康,荒川 賢治
    • Organizer
      第58回天然有機化合物討論会
    • Place of Presentation
      仙台・東北大学川内北キャンパス
    • Year and Date
      2016-09-15
  • [Presentation] Comparative genome analysis of Streptomyces rochei for morphological differentiation and secondary metabolism2016

    • Author(s)
      Yiwen Zhang, Yosi Nindita, Kuninobu Inada, Haruyasu Kinashi, and Kenji Arakawa
    • Organizer
      第31回日本放線菌学会大会
    • Place of Presentation
      東京大学農学部弥生講堂
    • Year and Date
      2016-09-09
  • [Presentation] アゾキシアルケン化合物KA57-Aの生合成機構および生物活性2016

    • Author(s)
      岸本 拓也, 國武 博文, Yosi Nindita, 木梨 陽康, 福本 敦, 安齊 洋次郎, 荒川 賢治
    • Organizer
      第31回日本放線菌学会大会
    • Place of Presentation
      東京大学農学部弥生講堂
    • Year and Date
      2016-09-09
  • [Presentation] Secondary metabolites of YN-P145, the plasmidless mutants of Streptomyces rochei 7434AN42016

    • Author(s)
      Yosi Nindita, Kuninobu Inada, Haruyasu Kinashi, and Kenji Arakawa
    • Organizer
      第31回日本放線菌学会大会
    • Place of Presentation
      東京大学農学部弥生講堂
    • Year and Date
      2016-09-08
  • [Presentation] 放線菌Streptomyces rochei変異株が高蓄積するポリケチド化合物の生合成遺伝子解析2016

    • Author(s)
      山手 直貴, 片岡 憂祐, Yosi Nindita, 木梨 陽康, 国吉 久人, 荒川 賢治
    • Organizer
      第31回日本放線菌学会大会
    • Place of Presentation
      東京大学農学部弥生講堂
    • Year and Date
      2016-09-08
  • [Presentation] 放線菌Streptomyces rocheiの抗生物質生産を誘導するシグナル分子SRBの生合成経路の解析2016

    • Author(s)
      手島 愛子, 波多江 希, 津田 直人, 謝 麗, 河原 弘幸, 木梨 陽康, 荒川 賢治
    • Organizer
      第31回日本放線菌学会大会
    • Place of Presentation
      東京大学農学部弥生講堂
    • Year and Date
      2016-09-08
  • [Presentation] Biosynthetic investigation of azoxyalkene compound produced by a multiple gene disruptant of Streptomyces rochei2016

    • Author(s)
      Kenji Arakawa
    • Organizer
      第12回(2016年度)生合成勉強会
    • Place of Presentation
      東京大学農学部
    • Year and Date
      2016-07-23
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] くすりを作る微生物「放線菌」の潜在能力を探る2016

    • Author(s)
      荒川 賢治
    • Organizer
      ローズサロン7月例会
    • Place of Presentation
      福山ニューキャッスルホテル
    • Year and Date
      2016-07-11
    • Invited
  • [Presentation] 放線菌の抗生物質生産をナノモルオーダーで誘導するシグナル分子の単離・構造決定・生合成2016

    • Author(s)
      荒川 賢治
    • Organizer
      日本農芸化学会中四国支部創立15周年記念 第23回若手シンポジウム
    • Place of Presentation
      岡山大学
    • Year and Date
      2016-05-21
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] 細胞機能化学研究室・荒川グループホームページ

    • URL

      http://home.hiroshima-u.ac.jp/mbiotech/5lab/Arakawa/intro-J.html

URL: 

Published: 2018-01-16  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi