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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Collective activation of silent biosynthetic pathways for bioactive compounds by small diffusible signaling molecules

Research Project

Project/Area Number 16K14915
Research InstitutionHiroshima University

Principal Investigator

荒川 賢治  広島大学, 先端物質科学研究科, 准教授 (80346527)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2018-03-31
Keywordsシグナル分子 / 二次代謝生合成 / 放線菌 / ゲノムマイニング / P450 / デヒドロゲナーゼ / ブテノライド
Outline of Annual Research Achievements

Streptomyces属放線菌の二次代謝は、ごく微量(nMオーダー)の微生物ホルモン様シグナル分子により誘導制御されている。本研究では、我々が見出した2,3-二置換ブテノライド型シグナル分子SRBに注目し、菌群における多様性解析および生合成機構・構造活性相関、さらには合成酵素と機能の相関性の解明を目指した。平成29年度は以下の項目を実施した。
(1) SRB型シグナル分子の多様性解析:前年度に加えて新たに50株の放線菌について醋酸エチル抽出し、SRB合成欠損株KA20株への添加実験を行ったところ、ランカサイジン(LC)およびランカマイシン(LM)の生産回復は認められなかった。本成果は、放線菌におけるSRB型分子の特異性を示唆している。
(2) SRB型シグナル分子を利用した休眠二次代謝遺伝子の発現誘導:(1)と関連しているが、「シグナル分子は特異的リセプターへの結合を介して二次代謝誘導を引き起こすため、シグナル分子の合成欠損株は、同時に二次代謝非生産の可能性が高い」、と考えられる。そこで、SRB型分子の誘導能を(1)で用いた計80株にて調べることとした。15株において解析したところ、SRB添加により代謝プロファイルが変化した株が5株認められた。
(3) 高機能化を指向したSRBの生合成機構解析:P450モノオキシゲナーゼSrrOの基質特異性解析を行い、C-1'の水酸基の立体化学に関しては、R体、S体ともにC-6'メチレン酸化反応が進行することを明らかにした。また、その変換効率は、若干R体のほうが高い反応効率で進行していることが分かった。以上、ブテノライド骨格近傍のC-1’位水酸基の立体化学に関しては、SrrOの基質認識は寛容であることを見出した。また、デヒドロゲナーゼ遺伝子srrGの変異株はLC, LMを生産せず、SRB生合成への関与が示唆された。

  • Research Products

    (46 results)

All 2018 2017 Other

All Int'l Joint Research (6 results) Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (34 results) (of which Int'l Joint Research: 11 results,  Invited: 7 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Alberta(カナダ)

    • Country Name
      CANADA
    • Counterpart Institution
      University of Alberta
  • [Int'l Joint Research] Heliopolis University(エジプト)

    • Country Name
      EGYPT
    • Counterpart Institution
      Heliopolis University
  • [Int'l Joint Research] Weizmann Institute of Science(イスラエル)

    • Country Name
      ISRAEL
    • Counterpart Institution
      Weizmann Institute of Science
  • [Int'l Joint Research] Oregon State University(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Oregon State University
  • [Int'l Joint Research] Srinakharinwirot University(タイ)

    • Country Name
      THAILAND
    • Counterpart Institution
      Srinakharinwirot University
  • [Int'l Joint Research]

    • # of Other Countries
      1
  • [Journal Article] Quinoprotein dehydrogenase functions at the final oxidation step of lankacidin biosynthesis in Streptomyces rochei 7434AN42018

    • Author(s)
      Yusuke Yamauchi, Yosi Nindita, Keisuke Hara, Asako Umeshiro, Yu Yabuuchi, Toshihiro Suzuki, Haruyasu Kinashi, Kenji Arakawa
    • Journal Title

      J. Biosci. Bioeng.

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2018.03.006

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Manipulation of metabolic pathway controlled by signaling molecules, inducers of antibiotic production, for genome mining in Streptomyces spp.2018

    • Author(s)
      Kenji Arakawa
    • Journal Title

      Antonie van Leeuwenhoek

      Volume: 111 Pages: 743-751

    • DOI

      10.1007/s10482-018-1052-6

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular characterization of aspartylglucosaminidase, a lysosomal hydrolase upregulated during strobilation in the moon jellyfish, Aurelia aurita2017

    • Author(s)
      Natsumi Tsujita, Hiroyuki Kuwahara, Hiroki Koyama, Noriyuki Yanaka, Kenji Arakawa, Hisato Kuniyoshi
    • Journal Title

      Biosci. Biotechnol. Biochem.

      Volume: 81 Pages: 938-950

    • DOI

      10.1080/09168451.2017.1285686

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A flavanone derivative from the Asian medicinal herb (Perilla frutescens) potently suppresses IgE-mediated immediate hypersensitivity reactions2017

    • Author(s)
      Rikiya Kamei, Takashi Fujimura, Miki Matsuda, Kotaro Kakihara, Noriko Hirakawa, Kenji Baba, Kazuhisa Ono, Kenji Arakawa, Seiji Kawamoto
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Commun.

      Volume: 483 Pages: 674-679

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2016.12.083

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 二次代謝生合成・制御系の合目的改変により取得したアゾキシアルケン化合物KA57-Aの生合成及び生物活性2017

    • Author(s)
      國武 博文, 岸本 拓也, 達川 綾香, 木梨 陽康, 福本 敦, 安齊 洋次郎, 荒川 賢治
    • Journal Title

      第59回天然有機化合物討論会講演要旨集

      Volume: 59 Pages: 657-662

  • [Presentation] 放線菌Streptomyces rocheiのシグナル分子生合成におけるP450モノオキシゲナーゼの基質認識多様性の解析2018

    • Author(s)
      手島 愛子, 波多江 希, 荒川 賢治
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
  • [Presentation] Maniwamycinの生合成遺伝子クラスターの解析および生物活性2018

    • Author(s)
      達川 綾香,岸本 拓也, 福本 敦, 安齊 洋次郎, 荒川 賢治
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
  • [Presentation] 抗生物質生産を誘導するSRBブテノライド型シグナル分子の分子多様性解析2018

    • Author(s)
      住吉 美保, 手島 愛子, 荒川 賢治
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
  • [Presentation] 放線菌Streptomyces rocheiにおけるキノン補酵素のと構造および生合成の解析2018

    • Author(s)
      原 圭佑,梅代 亜紗子,荒川 賢治
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
  • [Presentation] 放線菌Streptomyces rocheiの二次代謝制御系の解析と物質生産への応用2018

    • Author(s)
      見崎 裕也,岩國 美由季,高橋 譲,鈴木 敏弘,木梨 陽康,荒川 賢治
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
  • [Presentation] ミズクラゲのストロビレーションに伴って発現変動する新規分泌タンパク質遺伝子ファミリーの解析2018

    • Author(s)
      辻田 菜摘, 小山 寛喜, 渡部 彰大, 荒川 賢治, 国吉 久人
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
  • [Presentation] ミズクラゲに対するストロビレーション阻害物質の活性の解析2018

    • Author(s)
      藤井 夏鈴, 黒田 理絵, 辻田 菜摘, 小山 寛喜, 荒川 賢治, 国吉 久人
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
  • [Presentation] Genome mining, biosynthesis, and biological activity of azoxyalkene compound in Streptomyces rochei2018

    • Author(s)
      Kenji ARAKAWA
    • Organizer
      Department of Pharmaceutical Sciences Seminars
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 放線菌Streptomyces rocheiの二次代謝生産を誘導するシグナル分子SRBの生合成解析2018

    • Author(s)
      手島 愛子, 波多江 希, 荒川 賢治
    • Organizer
      日本農芸化学会・中四国支部第50回講演会
  • [Presentation] アゾキシアルケン化合物KA57-Aの生合成解析2018

    • Author(s)
      岸本 拓也, 國武 博文, Yosi Nindita, 福本 敦, 安齊 洋次郎, 荒川 賢治
    • Organizer
      日本農芸化学会・中四国支部第50回講演会
  • [Presentation] Streptomyces rochei変異株が高蓄積するポリケチド化合物の生合成解析2018

    • Author(s)
      山手 直貴, 片岡 憂祐, Yosi Nindita, 木梨 陽康, 荒川 賢治
    • Organizer
      日本農芸化学会・中四国支部第50回講演会
  • [Presentation] 刺胞動物ミズクラゲの変態とリソソーム加水分解酵素群の関連2017

    • Author(s)
      辻田 菜摘, 小山 寛喜, 辻 敏之, 矢中 規之, 荒川 賢治, 国吉 久人
    • Organizer
      第40回日本分子生物学会年会・第90回日本生化学会大会 合同大会
  • [Presentation] Biochemistry and biotechnology of Actinobacteria2017

    • Author(s)
      Kenji ARAKAWA
    • Organizer
      平成29年度日本・アジア青少年サイエンス交流事業(さくらサイエンスプラン)
    • Invited
  • [Presentation] Structure, activity and biosynthetic investigation of butenolide-type signaling molecules SRBs that induce antibiotic production in Streptomyces rochei2017

    • Author(s)
      Kenji ARAKAWA
    • Organizer
      1st China-Japan Joint Symposium on Natural Product Biosynthesis
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 発酵学と抗生物質生産2017

    • Author(s)
      荒川 賢治
    • Organizer
      NHK文化センター講座「これまでの発酵学、これからの発酵学」
    • Invited
  • [Presentation] 二次代謝生合成・制御系の合目的改変により取得したアゾキシアルケン化合物KA57-Aの生合成及び生物活性2017

    • Author(s)
      國武 博文, 岸本 拓也, 達川 綾香, 木梨 陽康, 福本 敦1, 安齊 洋次郎1, 荒川 賢治
    • Organizer
      第59回天然有機化合物討論会
  • [Presentation] 放線菌Streptomyces rocheiの二次代謝を誘導するシグナル分子SRBの生合成に関わるP450モノオキシゲナーゼSrrOの生理学的・生化学的解析2017

    • Author(s)
      手島 愛子, 波多江 希, 津田 直人, 荒川 賢治
    • Organizer
      日本生物工学会第69回大会
  • [Presentation] Plasmid-assisted random genome deletion in Streptomyces rochei affects secondary metabolites production2017

    • Author(s)
      Yosi Nindita, Amirudin Akhmad Fauzi, Yiwen Zhang, Haruyasu Kinashi, and Kenji Arakawa
    • Organizer
      日本生物工学会第69回大会
  • [Presentation] Streptomyces rochei のシグナル分子生合成におけるP450モノオキシゲナーゼ遺伝子の機能解析2017

    • Author(s)
      手島 愛子, 波多江 希, 津田 直人, 荒川 賢治
    • Organizer
      第32回日本放線菌学会大会
  • [Presentation] Plasmid loss in Streptomyces rochei 7434AN4 induces silent secondary metabolite production2017

    • Author(s)
      Yosi Nindita, Kuninobu Inada, Amirudin Akhmad Fauzi, Haruyasu Kinashi, and Kenji Arakawa
    • Organizer
      第32回日本放線菌学会大会
  • [Presentation] 特異生合成マシナリーの解明を目指したアゾキシアルケン化合物の構造および生合成遺伝子解析2017

    • Author(s)
      達川 綾香,岸本 拓也, 福本 敦, 安齊 洋次郎, 荒川 賢治
    • Organizer
      第32回日本放線菌学会大会
  • [Presentation] 抗生物質生産を誘導するブテノライド型シグナル分子の分子多様性解析2017

    • Author(s)
      住吉 美保, 手島 愛子, 荒川 賢治
    • Organizer
      第32回日本放線菌学会大会
  • [Presentation] リンの酸化還元状態の変換に関与する微生物の分布と解析2017

    • Author(s)
      廣田 隆一, 池田 丈, 荒川 賢治, 黒田 章夫
    • Organizer
      環境微生物系学会合同大会2017
  • [Presentation] 抗生物質生産をナノモルオーダーで誘導する放線菌シグナル分子の分子基盤解析2017

    • Author(s)
      手島 愛子, 波多江 希, 荒川 賢治
    • Organizer
      2017年度生物工学若手研究者の集い(若手会)夏のセミナー
  • [Presentation] Genome mining and biosynthetic investigation of azoxyalkene compound produced by a multiple gene disruptant of Streptomyces rochei2017

    • Author(s)
      Kenji ARAKAWA
    • Organizer
      9th US-Japan Seminar on the Biosynthesis of Natural Products, Enzymology, Structural Biology, and Drug Discovery
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Manipulation of regulatory pathway controlled by signaling molecules SRBs, inducer of antibiotic production in Streptomyces rochei, for genome mining2017

    • Author(s)
      Kenji ARAKAWA
    • Organizer
      18th International Symposium on the Biology of Actinomycetes
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] The tap-tpg gene pair from the linear plasmids of Streptomyces rochei 7434AN4 maintains the linearity of its chromosome2017

    • Author(s)
      Yosi NINDITA, Zhisheng CAO, Yingjie YANG, Yuh SHIWA, Hirofumi YOSHIKAWA, Michihira TAGAMI, Alexander LEZHAVA, Haruyasu KINASHI, Kenji ARAKAWA
    • Organizer
      18th International Symposium on the Biology of Actinomycetes
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] A P450 monooxygenase SrrO is involved in signaling molecyle SRB biosynthesis in Streptomyces rochei2017

    • Author(s)
      Aiko TESHIMA, Nozomi HADAE, Naoto TSUDA, Haruyasu KINASHI, and Kenji ARAKAWA
    • Organizer
      18th International Symposium on the Biology of Actinomycetes
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Wide genome deletions in Streptomyces rochei led to the production of silent secondary metabolites2017

    • Author(s)
      Yosi NINDITA and Kenji ARAKAWA
    • Organizer
      A3 Foresight 2017 International Symposium
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Altering the phenotypes on secondary metabolites and morphological differentiation in plasmidless mutants of Streptomyces rochei2017

    • Author(s)
      Amirudin Akhmad FAUZI, Yosi NINDITA, and Kenji ARAKAWA
    • Organizer
      A3 Foresight 2017 International Symposium
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Overview of Biosynthetic Pathway of SRB Molecules that Induce Antibiotic Production in Streptomyces rochei2017

    • Author(s)
      Aiko TESHIMA and Kenji ARAKAWA
    • Organizer
      A3 Foresight 2017 International Symposium
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Structural diversity of butenolide-type signaling molecules in Streptomyces species2017

    • Author(s)
      Miho SUMIYOSHI, Aiko TESHIMA, and Kenji ARAKAWA
    • Organizer
      A3 Foresight 2017 International Symposium
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Biosynthetic investigation of azoxyalkene compounds2017

    • Author(s)
      Ayaka TATSUKAWA, Takuya KISHIMOTO, Hirofumi KUNITAKE, Atsushi FUKUMOTO Yojiro ANZAI, and Kenji ARAKAWA
    • Organizer
      A3 Foresight 2017 International Symposium
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 抗生物質生産をナノモルオーダーで誘導する放線菌シグナル分子の単離・構造決定・生合成2017

    • Author(s)
      荒川 賢治
    • Organizer
      東京大学薬学部天然物化学教室・第96回セミナー
    • Invited
  • [Remarks] 細胞機能化学研究室・荒川グループのホームページ

    • URL

      http://home.hiroshima-u.ac.jp/mbiotech/5lab/Arakawa/intro-J.html

URL: 

Published: 2018-12-17   Modified: 2022-06-07  

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