2016 Fiscal Year Research-status Report
「身体的特徴推定のためのCNVマルチマーカーシステム」の開発
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16K15400
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| Research Institution | University of Fukui |
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Principal Investigator |
飯田 礼子 福井大学, 学術研究院医学系部門, 准教授 (40139788)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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| Keywords | 法医学 / 個人識別 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
１．身体的特徴との相関が予測されるのコピー数解析法の確立
1）ＰｕｂＭｅｄを利用して、身長との相関が予想される2つのＣＮＶ （ＬＴＢＰ1およびＥＴＶ-6）を過去の文献から選出した。それぞれのＣＮＶについて、①目的配列、 ②単一コピー遺伝子（ＺＮＦ80） および ③目的配列と単一コピー遺伝子のハイブリッド を組み込んだプラスミドベクターを作製し、これらプラスミドベクターの希釈列を用いて定量的ＰＣＲを行った。
2）目的配列および単一コピー遺伝子のそれぞれについて検量線を作成したところ、単一コピー遺伝子ＺＮＦ80と目的ＣＮＶの増幅効率に大きな相違は無く、適切な正規化と正確な判定が可能と考えられた。また、プラスミド混合物を用いて行った模擬分析においても、正確なコピー数を算出することが可能であった。したがって、当初の目的であった簡便なＣＮＶコピー数解析法を確立することができた。
２．ＣＮＶコピー数と身長の相関性の解析
島根大学より供与を受けた日本人119名のＤＮＡを用いて、各遺伝子のＣＮＶ型判定を行った。コピー数と身長の間に逆相関の傾向が男女ともに認められたが、分散分析における有意差は無く、より大きな集団での再検討が必要と思われた。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
当初平成28年度に予定していた計画を概ね達成した。しかし、ＣＮＶコピー数と身長の間に逆相関の傾向が認められたものの、有意差は無かったことから実用化のためにはサンプル数を増やす、他のＣＮＶについて解析するなど、さらなる検討が必要と考えられた。
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| Strategy for Future Research Activity |
１. 今年度に確立した方法を用いて、引き続き身長、体重などとの相関が予測される遺伝子のＣＮＶ解析および相関解析を実施する。
２．同じＤＮＡサンプルを用いて、ヒト用にデザインされたＴａｑＭａｎコピー数分析キットによるＣＮＶ解析を行い、今回開発した定量的ＰＣＲ法との比較・検討を行う。
３. 相関が高いと認められたＣＮＶの組み合わせによるマルチマーカーシステムの構築を試みる。
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| Causes of Carryover |
試薬や器具類をキャンペーンの利用により購入したため差額が生じた。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
Ｈ29年度助成金の物品費と合わせて、試薬等の消耗品の購入に使用する。
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