2018 Fiscal Year Annual Research Report
Elucidation and regulation of gastric carcinogeneis based on the next-generation integrated analysis of DNA integration and stromal cells
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16K15435
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| Research Institution | St. Marianna University School of Medicine |
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Principal Investigator |
山本 博幸 聖マリアンナ医科大学, 医学部, 准教授 (40332910)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
安田 宏 聖マリアンナ医科大学, 医学部, 教授 (80262129)
伊東 文生 聖マリアンナ医科大学, 医学部, 教授 (90223180)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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| Keywords | EBV / DNA組み込み / DNAメチル化 / 胃癌 / 間質細胞 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
リンパ球浸潤に富む間質を伴うEBウイルス（EBV）関連胃癌は、H. pylori菌皆除菌時代において重要である。ウイルスDNAのヒトゲノムへの組み込みは発癌に寄与する。その分子機構の解明は学術的重要性が高いが、網羅的解析法が無く研究が進んでいない。
胃癌を対象に、EBV DNAのヒトゲノムへの全組み込みおよびメチル化同時解析に挑戦し、オミクス解析の結果とともに発癌機構を解明する。また、EBVの組み込みに関連して、間質細胞の異常を腫瘍免疫および癌細胞ニッチの観点から明らかにすることを目的とした。
癌細胞株を対象とし、前年度までに至適化に成功した全ゲノムレベルでのDNA組み込み解析法を用いて、DNA組み込みの詳細を明らかにした。組み込み解析後のメチル化解析に関して、改良パイロシーケンス法を用いて、より広いゲノム領域のメチル化を解析し、DNA組み込みとの関連を明らかにした。さらにロングリードのDNA組み込み・メチル化同時解析の条件の至適化に成功し、ロングリード解析ならではの、詳細なデータを得ることに成功した。また、MBD-captureシークエンス法、MCAシークエンス法による網羅的エピゲノム解析を行い、DNA組み込みとの関連を明らかにした。
EBV関連胃癌の遺伝子異常の次世代統合オミクス解析においては、遺伝子変異（MassARRAYシステム等）、DNAコピー数変化、DNAメチル化（MCA microarray等）、エピゲノム異常（MCAシークエンス法等）、マイクロRNA異常（New-generation sequencing等）解析を進め、オミクス解析の結果とEBV DNA全組み込みおよびメチル化変化との関連を明らかにした。
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[Journal Article] Rebamipide solution: a novel submucosal injection material to promote healing speed and healing quality of ulcers induced by endoscopic submucosal dissection.2018
Author(s)
Fujimoto A, Uraoka T, Nishizawa T, Shimoda M, Goto O, Ochiai Y, Maehata T, Akimoto T, Mitsunaga Y, Sasaki M, Yamamoto H, Yahagi N.
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Journal Title
Gastointest Endosc
Volume: 87
Pages: 1114-1120
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Endoscopic small-capacity forceps increase the pathological diagnosis of gastric indefinite neoplasia.2018
Author(s)
Matsuo Y, Yasuda H, Kato M, Kiyokawa H, Ozawa M, Sato Y, Ikeda Y, Ozawa SI, Yamashita M, Fujino T, Yamamoto H, Takagi M, Itoh F.
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Journal Title
Turk J Gastroenterol
Volume: 29
Pages: 481-487
DOI
Peer Reviewed
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