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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Genetic diagnosis of microcephaly

Research Project

Project/Area Number 16K15526
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

荻 朋男  名古屋大学, 環境医学研究所, 教授 (80508317)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2018-03-31
Keywords遺伝・先天異常学 / 遺伝性小頭症
Outline of Annual Research Achievements

小頭症は様々な要因により発症するため鑑別診断には困難を伴うことが多い。遺伝性小頭症の症例には、DNA損傷応答・DNA修復システムの異常を疾患発症原因とするケースが比較的多く含まれる。そこで、これらの症例を対象として、正確な診断に役立つ技術の開発を目指した。DNA損傷応答・DNA修復システムには様々な経路があり、増悪因子の排除や予後予測には疾患原因となる破綻したDNA修復経路の特定が不可欠である。本研究では特に、DNA二重鎖切断 (DSB)経路の異常を指標とした診断システムの開発を目指した。自動蛍光画像取得装置とマルチウェルプレートを用い、患者由来細胞でDNA損傷処理後のリン酸化H2AX及び53BP1の核内局在 (foci形成)を計測することで、簡便・迅速・正確・客観的・多検体比較可能なシステムを構築した。本システムを用いたスクリーニングでは、放射線感受性を示す症例の抽出が可能であり、有用な評価法と考えられた。また、国内外より遺伝性の小頭症疑い症例を収集し、確立済みのヌクレオチド除去修復 (NER)活性評価法及び上述のDSB修復活性評価法により調査を行った。DNA修復活性の低下が認められた症例では、関連する遺伝子の強制発現により欠損した修復活性が回復するかを指標として、疾患原因変異を持つ遺伝子を特定する相補性試験を実施した。収集症例には、NER欠損性のコケイン症候群が多数含まれており、遺伝子変異特定までを終了した。一方、DSB修復活性の低下が見られたものの疾患原因変異を持つ遺伝子が特定できない症例や、中間的なNER活性の欠損が見られる症例等が抽出された。これらの症例については、次世代ゲノム解析 (全exome解析および全ゲノム解析)により疾患原因変異の同定を試みたところ疾患原因変異の候補が得られ、一部の症例では疾患責任遺伝子変異の特定に至った。

  • Research Products

    (18 results)

All 2018 2017

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results) Presentation (14 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 7 results)

  • [Journal Article] Cerebellar ataxia-dominant phenotype in patients with ERCC4 mutations.2018

    • Author(s)
      Doi H, Koyano S, Miyatake S, Nakajima S, Nakazawa Y, Kunii M, Tomita-Katsumoto A, Oda K, Yamaguchi Y, Fukai R, Ikeda S, Kato R, Ogata K, Kubota S, Hayashi N, Takahashi K, Tada M, Tanaka K, Nakashima M, Tsurusaki Y, Miyake N, Saitsu H, Ogi T, Aihara M, Takeuchi H, Matsumoto N, Tanaka F.
    • Journal Title

      Journal of Human Genetics

      Volume: 63 Pages: 417-423

    • DOI

      10.1038/s10038-017-0408-5

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Functional and clinical relevance of novel mutations in a large cohort of patients with Cockayne syndrome.2017

    • Author(s)
      Calmels N, Botta E, Jia N, Fawcett H, Nardo T, Nakazawa Y, Lanzafame M, Moriwaki S, Sugita K, Kubota M, Obringer C, Spitz MA, Stefanini M, Laugel V, Orioli D, Ogi T§, Lehmann A.
    • Journal Title

      Journal of Medical Genetics

      Volume: 55 Pages: 329-343

    • DOI

      10.1136/jmedgenet-2017-104877

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Common TFIIH recruitment mechanism in global genome and transcription-coupled repair subpathways.2017

    • Author(s)
      Okuda M, Nakazawa Y, Guo C, Ogi T, Nishimura Y.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 45 Pages: 13043-13055

    • DOI

      10.1093/nar/gkx970

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] An XPA gene splicing mutation resulting in trace protein expression in an elderly xeroderma pigmentosum group A patient without neurological abnormalities.2017

    • Author(s)
      Takahashi Y, Endo Y, Kusaka A, Nakamaura S, Nakazawa Y, Ogi T, Uryu M, Tsuji M, Furue M, Moriwaki S.
    • Journal Title

      British Journal of Dermatology

      Volume: 177 Pages: 253-257

    • DOI

      10.1111/bjd.15051

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Very mild Japanese Cockayne syndrome (type-IV) cases with a N-terminal truncation mutation in the ERCC6 / CSB gene.2018

    • Author(s)
      Ogi T.
    • Organizer
      国際シンポジウム「早老症と関連疾患」
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Human genetic disorders associated with TC-NER deficiency.2017

    • Author(s)
      Ogi T.
    • Organizer
      第2回神戸大学バイオシグナル総合研究センター国際シンポジウム
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Very mild CS type-IV cases with mutation in the CSB gene.2017

    • Author(s)
      Ogi T.
    • Organizer
      Cockayne Syndrome Meeting.
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Human genetics disorders associated with DNA repair deficiency.2017

    • Author(s)
      Ogi T.
    • Organizer
      6th US-Japan DNA Repair Meeting
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] DNA損傷依存的なRNAポリメラーゼの修飾とヒト疾患.2017

    • Author(s)
      荻 朋男
    • Organizer
      国立遺伝学研究所・研究集会「染色体構築と安定化を担う分子機構」
    • Invited
  • [Presentation] ゲノム不安定性を示す遺伝性疾患の次世代マルチオミクス解析.2017

    • Author(s)
      荻 朋男
    • Organizer
      第7回名古屋大学医学系研究科・生理学研究所合同シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] ミニレクチャー「ゲノム不安定性疾患群を中心とした希少疾患の次世代マルチオミクス病態解析」2017

    • Author(s)
      荻 朋男
    • Organizer
      第12回東海小児遺伝カンファレンス
    • Invited
  • [Presentation] Molecular pathogenesis underlying Cockayne syndrome and UV-sensitive syndrome.2017

    • Author(s)
      Jia N, Guo C, Oka Y, Nakazawa Y, Shimada M, Miyazaki H, Ogi T.
    • Organizer
      第40回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] Very mild CS type-IV cases with mutations in the CSB gene.2017

    • Author(s)
      Jia N, Guo C, Oka Y, Nakazawa Y, Shimada M, Miyazaki H, Ogi T.
    • Organizer
      第24回DNA複製・組換え・修復ワークショップ
  • [Presentation] DNA修復機構欠損性疾患の病態解明研究.2017

    • Author(s)
      中沢由華、賈楠、嶋田繭子、宮崎仁美、千住千佳子、郭朝万、岡泰由、荻朋男
    • Organizer
      第2回放射線災害・医科学研究拠点カンファランス
  • [Presentation] マルチオミクス解析による希少遺伝性疾患発症責任因子の同定.2017

    • Author(s)
      岡泰由、中沢由華、荻朋男.
    • Organizer
      第40回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] ゲノム不安定性を示す遺伝性疾患群の疾患責任遺伝子変異の探索.2017

    • Author(s)
      中沢由華、千住千佳子、岡泰由、嶋田繭子、宮崎仁美、郭朝万、賈楠、荻朋男.
    • Organizer
      第40回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] A Novel Gene Mutation Of Japanese Xeroderma Pigmentosum Complementation Group F Patients.2017

    • Author(s)
      Senju C, Nakazawa Y, Ogi T.
    • Organizer
      第40回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] Identification of pathogenic mutations in patients with rare diseases using multi-omics analysis.2017

    • Author(s)
      Oka Y, Nakazawa Y, Ogi T.
    • Organizer
      日本プロテオーム学会2017年大会

URL: 

Published: 2018-12-17  

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