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2017 Fiscal Year Research-status Report

「希少癌」骨軟部腫瘍のチロシンキナーゼ遺伝子転写変異体の探索

Research Project

Project/Area Number 16K15670
Research InstitutionJuntendo University

Principal Investigator

末原 義之  順天堂大学, 医学部, 准教授 (70509405)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 高阪 真路  東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 特任助教 (00627119)
小林 英介  国立研究開発法人国立がん研究センター, 中央病院, 医員 (40365292)
Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Keywords骨軟部腫瘍 / TK遺伝子転写変異体 / TK遺伝子変異
Outline of Annual Research Achievements

悪性骨軟部腫瘍の治療成績は、5年生存率が約50%以下と依然不良であり、これは「希少癌」であるが故のデータ量不足や消極的な創薬開発が影響している。対してメジャーな癌、特に肺癌ではEGFR変異などの発生・悪性度因子(driver-oncogene)を治療標的としたTKの阻害剤治療が盛んであり、治療成績は良好である。現在も全癌種・横断的に新規分子標的治療標的(特にTK治療標的)と成り得るdriver-oncogeneが探索され、癌治療のbreakthroughと位置づけられている。
本研究では、骨軟部腫瘍において、他癌で成功を収めているTK遺伝子転写変異体及び遺伝子変異を探索を独自のNanoStringシステムによる手法で進め、新規治療標的となりうるdriver-oncogeneとしての遺伝子転写変異体及び遺伝子変異を探索を行った。
(A)NanoStringシステムによるTK遺伝子転写変異体及び遺伝子変異の探索: 全TK遺伝子転写変異体探索のために、約200個のカスタムプローブデザインを作成し、原発の悪性軟部腫瘍50例にNanoStringに行った。
(B)TK遺伝子転写変異体及び遺伝子変異のシークエンスと発現の検証:上記50例のNanoStringに関して、5例のTK遺伝子転写変異体及び遺伝子変異候補を同定し、次世代シークエンサーによる検証実験を行い、現在そのデータ解析を行っている。
その(B)の結果に基づき、(C)新規TK遺伝子転写変異体及び遺伝子変異のq-PCR、ウエスタンブロット及び免疫染色を用いた大規模スクリーニング検証、(D)新規TK遺伝子転写変異体及び遺伝子変異の機能解析の解析を行う。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

(A)のNanoStringシステムによるTK遺伝子転写変異体及び遺伝子変異の探索において、昨年の解析検体の集積遅延により、下記(B)の進行も遅延を生じている。(B)のTK遺伝子転写変異体及び遺伝子変異のシークエンスと発現の検証においては予定通り進んでいるが、5例と多くのTK遺伝子転写変異体及び遺伝子変異候補の同定に成功しており、現在そのデータ量の多さより多少の解析遅延が生じている。

Strategy for Future Research Activity

B)TK遺伝子転写変異体のシークエンスと発現の検証:引き続き上記50例のNanoStringに関して、5例のTK遺伝子転写変異体及び遺伝子変異候補を同定に対して、次世代シークエンサーによる検証実験で得たデータ解析を行う。
C)新規TK遺伝子転写変異体及び遺伝子変異のq-PCR、ウエスタンブロット及び免疫染色を用いた大規模スクリーニング検証:同定された新規TK遺伝子転写変異体については、q-PCR、ウエスタンブロット及び免疫染色を用い検証を行う。
D)新規TK遺伝子転写変異体及び遺伝子変異の機能解析:新規TK遺伝子転写変異体及び遺伝子変異に対して各種腫瘍細胞株を用いて、その新規遺伝子変異遺伝子導入を行い、癌化による細胞増殖やヌードマウスを用いて細胞のin vivo解析を行う。

Causes of Carryover

理由:(A)のNanoStringシステムによるTK遺伝子転写変異体及び遺伝子変異の探索において、昨年の解析検体の集積遅延により、下記(B)の進行も遅延を生じている。(B)のTK遺伝子転写変異体及び遺伝子変異のシークエンスと発現の検証においては予定通り進んでいるが、5例と多くのTK遺伝子転写変異体及び遺伝子変異候補の同定に成功しており、現在そのデータ量の多さより多少の解析遅延が生じている。今後の使用計画:(B)TK遺伝子転写変異体のシークエンスと発現の検証として次世代シークエンサーによる検証、(C)新規TK遺伝子転写変異体及び遺伝子変異のq-PCR、ウエスタンブロット及び免疫染色の解析、(D)新規TK遺伝子転写変異体及び遺伝子変異の機能解析として各種腫瘍細胞株を用いた in vitroとin vivo解析を行う。

  • Research Products

    (15 results)

All 2018 2017 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 6 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] メモリアルスローンケタリングがんセンター(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      メモリアルスローンケタリングがんセンター
  • [Int'l Joint Research]

    • # of Other Countries
      1
  • [Journal Article] IRE1α-XBP1 inhibitors exerted anti-tumor activities in Ewing's sarcomas.2018

    • Author(s)
      Tanabe Y, Suehara Y, Kohsaka S, Hayashi T, Akaike K, Mukaihara K, Kurihara T, Kim Y, Okubo T, Ishii M, Kazuno S, Kaneko K, Saito T.
    • Journal Title

      Oncotarget

      Volume: 9 Pages: 14428-14443

    • DOI

      10.18632/oncotarget.24467.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Non-small cell lung carcinoma with diffuse co-expression of thyroid transcription factor-1 and ΔNp63/p402018

    • Author(s)
      Hayashi Takuo、Takamochi Kazuya、Yanai Yuka、Mitani Keiko、Tomita Hisashi、Mogushi Kaoru、Suehara Yoshiyuki、Takahashi Fumiyuki、Suzuki Kenji、Saito Tsuyoshi、Yao Takashi
    • Journal Title

      Human Pathology

      Volume: S0046-8177(18) Pages: 30037-6

    • DOI

      doi:10.1016/j.humpath.2018.01.023

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Pediatric soft tissue tumor of the upper arm with LMNA-NTRK1 fusion2018

    • Author(s)
      Kohsaka Shinji、Saito Tsuyoshi、Akaike Keisuke、Suehara Yoshiyuki、Hayashi Takuo、Takagi Tatsuya、Kaneko Kazuo、Ueno Toshihide、Kojima Shinya、Kohashi Ken-ichi、Mano Hiroyuki、Oda Yoshinao、Yao Takashi
    • Journal Title

      Human Pathology

      Volume: 72 Pages: 167~173

    • DOI

      10.1016/j.humpath.2017.08.017

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A method of high-throughput functional evaluation of EGFR gene variants of unknown significance in cancer2017

    • Author(s)
      Kohsaka Shinji、Nagano Masaaki、Ueno Toshihide、Suehara Yoshiyuki、Hayashi Takuo、Shimada Naoko、Takahashi Kazuhisa、Suzuki Kenji、Takamochi Kazuya、Takahashi Fumiyuki、Mano Hiroyuki
    • Journal Title

      Science Translational Medicine

      Volume: 9 Pages: eaan6566

    • DOI

      doi: 10.1126/scitranslmed.aan6566

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] DNA mismatch repair deficiency in surgically resected lung adenocarcinoma: Microsatellite instability analysis using the Promega panel2017

    • Author(s)
      Takamochi Kazuya、Takahashi Fumiyuki、Suehara Yoshiyuki、Sato Eiichi、Kohsaka Shinji、Hayashi Takuo、Kitano Shigehisa、Uneno Toshihide、Kojima Shinya、Takeuchi Kengo、Mano Hiroyuki、Suzuki Kenji
    • Journal Title

      Lung Cancer

      Volume: 110 Pages: 26~31

    • DOI

      doi: 10.1016/j.lungcan.2017.05.016

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Cabozantinib and dasatinib exert anti-tumor activity in alveolar soft part sarcoma2017

    • Author(s)
      Mukaihara Kenta、Tanabe Yu、Kubota Daisuke、Akaike Keisuke、Hayashi Takuo、Mogushi Kaoru、Hosoya Masaki、Sato Shingo、Kobayashi Eisuke、Okubo Taketo、Kim Youngji、Kohsaka Shinji、Saito Tsuyoshi、Kaneko Kazuo、Suehara Yoshiyuki
    • Journal Title

      PLoS ONE

      Volume: 12 Pages: e0185321

    • DOI

      doi: 10.1371/journal.pone.0185321

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Arterial Thoracic Outlet Syndrome (aTOS) and Cerebellar Infarction Following a Stress Fracture of the First Rib and Extensive Callus2017

    • Author(s)
      7.Suehara Y, Imashimizu K, Miyamoto N, Uehara H, Tanabe Y, Hattori N, Suzuki K, Saito T, Kaneko K.
    • Journal Title

      J Bone Joint Surg. Case Connector

      Volume: 3 Pages: e64

    • DOI

      10.2106/JBJS.CC.17.00001

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Clinical genomic sequencing of 72 pediatric and adult osteosarcomas reveals distinct molecular subsets with potentially targetable alterations.2018

    • Author(s)
      Alex D, Suehara Y, Bowman A, Middha S, Zehir A, Wang L, Jour G, Nafa K, Meyers P, Healey J, Hameed M, Ladanyi M.
    • Organizer
      USCAP, the 2018 Annual Meeting,
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Anti-tumor activity of tyrosine kinase inhibitors and gene expression profiles in alveolar soft part sarcoma.2018

    • Author(s)
      Suehara Y, Tanabe Y, Mukaihara K, Kurihara K, Akaike K, Hayashi T, Mogushi K, Kaneko K, Saito T.
    • Organizer
      the 64th Annual Meeting of the Orthopaedic Research Society
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Anti-tumor activity of tyrosine kinase inhibitors in alveolar soft part sarcoma.2017

    • Author(s)
      Suehara Y, Tanabe Y, Akaike K, Mogushi K, Hayashi T, Kurihara T, Kaneko K, Saito T.
    • Organizer
      European Society For Medical Oncology ASIA
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] A complete responder to pazopanib in high-grade soft tissue sarcomas.2017

    • Author(s)
      Suehara Y, Kohsaka S, Yamaguchi S, Akaike K, Hayashi T, Tanabe Y, Ueno T, Kojima S, Takeda I, Hayashi R, Saito T, Mano H, Kato S.
    • Organizer
      Connective Tissue Oncology Society, 22th Annual Meeting
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Diagnostic strategy for skeletal metastasis of unknown primary origin at the initial visit/ Up-to-date treatment of skeletal metastasis2017

    • Author(s)
      Kim Y, Suehara Y, Kaneko K.
    • Organizer
      27th Korean-Japanese Combined Orthopedic Symposium
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Large skin ulcer due to a subcutaneous orthopedic implant after bevacizumab therapy: A case report.2017

    • Author(s)
      Suehara Y, Kubota D, Kato S, Akaike K, Tanabe Y, Okubo T, Kim Y, Saito T, Kaneko K.
    • Organizer
      19th, International Symposium on Limb Salvage
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2018-12-17  

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