Research on development of a prediction system for the onset of severe ocular surface disease by analysis of gene polymorphism interaction

2017 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 16K15738
• Research Institution: Kyoto Prefectural University of Medicine
• Principal Investigator: 木下 茂 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (30116024)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 上田 真由美 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (60398386) ; 岡田 随象 東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 非常勤講師 (70727411)
• Project Period (FY): 2016-04-01 – 2018-03-31
• Keywords: 全ゲノムシークエンス解析 / 次世代シークエンサー / De Novo mutation

Outline of Annual Research Achievements

本研究の最終目的は、難治性眼表面疾患Stevens-Johnson症候群の発症予測システムの開発にある。申請者らは、難治性眼表面疾患Stevens-Johnson症候群について遺伝素因解析を行い多数の疾患関連遺伝子ならびにオッズ比が著明に上昇する遺伝子多型間相互作用を見出している。本研究では難治性眼表面疾患Stevens-Johnson症候群が極めて稀な発症である事から新生変異の可能性に着目して全ゲノムシークエンス解析を用いた新規疾患関連遺伝子の探索を行う。難治性眼表面疾患Stevens-Johnson症候群眼合併症が感冒薬の服用後に発症する事が多いことより、事前のハイリスク予測は発症予防に貢献できる。新たな疾患関連遺伝子の発見は、病態解明を促進し新規治療薬の開発に寄与できる。
平成２８年度は、次世代シークエンサー（Next Generation Sequencer; NGS）を用いた全ゲノムシークエンス解析を行う予定で、現在１家系の３症例の解析を終了した。平成２９年度は、３家系９症例の解析を実施し、結果的に、4家系12症例の解析を終了した。その結果、De Novo mutationと推定されるvariantを多数同定した。・その中からSJSに関連している可能性があるvariantとして、下記の3パターンを考えました。①GWASで報告のあるSJS関連遺伝子上、もしくは近傍にあるもの②複数の家系で共通した領域（遺伝子上、または遺伝子間）に認めたもの　③exonに認めたもの、それにより、より有用なvariantを選択できた。本研究結果は、本研究の最終目的は、難治性眼表面疾患Stevens-Johnson症候群の発症予測システムの開発に大きく貢献するものである。