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2019 Fiscal Year Annual Research Report

Genome instability induced by high-energy phosphate compounds

Research Project

Project/Area Number 16K16195
Research InstitutionChiba University

Principal Investigator

佐々 彰  千葉大学, 大学院理学研究院, 特任助教 (10738347)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2020-03-31
KeywordsDNA損傷 / リボヌクレオチド / DNA修復 / 突然変異 / ゲノム / 酵素
Outline of Annual Research Achievements

細胞内では、DNA複製中にRNA前駆体(リボヌクレオチド)が基質として取り込まれることがある。ゲノムに取り込まれたリボヌクレオチドは、適切に除去されなければ様々な細胞の異常を引き起こし、個体では深刻な神経変性疾患や発がんの引き金になると考えられる。
本研究では、DNA中のリボヌクレオチドが引き起こすゲノム不安定化の分子機構を明らかにすることを目的とした。
本年度は、DNA中のリボヌクレオチドが引き起こす突然変異の抑制に関与する因子として、ヌクレオチド除去修復因子XPAおよび損傷乗り越えDNAポリメラーゼPOLHを同定した。具体的には、XPAおよびPOLHを欠損したヒトBリンパ芽球細胞TK6において、リボヌクレオチドのモデル基質としてリボグアノシン(rG)およびその酸化体8-oxo-rGを部位特異的に含んだシャトルベクターを導入し、ベクター上に誘発された突然変異の頻度とスペクトラムを解析した。その結果、POLHならびにXPA欠損株の双方おいて、野生株と比べて8-oxo-rGが引き起こす突然変異頻度が有意に上昇し、特にPOLH欠損株では大きな欠失(large deletion)を伴う変異の割合が顕著に増加した。一方、どの細胞株においてもrGによる突然変異頻度に差は無かった。
rGはリボヌクレオチド除去修復(RER)によって修復されるが、その損傷体である8-oxo-rGは試験管内でRERによって除去できないことを我々は明らかにしている(Sassa et al., J Biol Chem)。本年度の結果から、RERが修復できないような損傷に対して、ヌクレオチド除去修復ならびにPOLHが代替機構として突然変異の抑制に関与することが示唆された。

  • Research Products

    (13 results)

All 2019 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 1 results) Remarks (3 results)

  • [Int'l Joint Research] NIEHS/NIH(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      NIEHS/NIH
  • [Journal Article] Processing of a single ribonucleotide embedded into DNA by human nucleotide excision repair and DNA polymerase η2019

    • Author(s)
      Sassa Akira、Tada Haruto、Takeishi Ayuna、Harada Kaho、Suzuki Megumi、Tsuda Masataka、Sasanuma Hiroyuki、Takeda Shunichi、Sugasawa Kaoru、Yasui Manabu、Honma Masamitsu、Ura Kiyoe
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 9 Pages: 13910

    • DOI

      10.1038/s41598-019-50421-8

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Comparative study of cytotoxic effects induced by environmental genotoxins using XPC- and CSB-deficient human lymphoblastoid TK6 cells2019

    • Author(s)
      Sassa Akira、Fukuda Takayuki、Ukai Akiko、Nakamura Maki、Takabe Michihito、Takamura-Enya Takeji、Honma Masamitsu、Yasui Manabu
    • Journal Title

      Genes and Environment

      Volume: 41 Pages: 15

    • DOI

      10.1186/s41021-019-0130-y

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Mechanistic basis for genome instability induced by non-canonical nucleotide accumulation in human cells2019

    • Author(s)
      Akira Sassa
    • Organizer
      2019 International Conference for Leading and Young Medical Scientists
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Alternate processing pathways of a single ribonucleotide incorporated into DNA and its consequences in human cells2019

    • Author(s)
      Akira Sassa, Haruto Tada, Ayuna Takeishi, Kaho Harada, Kazuma Nakatani, Masataka Tsuda, Hiroyuki Sasanuma, Shunichi Takeda, Kaoru Sugasawa, Manabu Yasui, Masamitsu Honma, Kiyoe Ura
    • Organizer
      The Joint Meeting of The 6th Asian Congress on Environmental Mutagens and the 48th Annual Meeting of the Japanese Environmental Mutagen Society
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Mechanistic insight of unique mutations caused by a ribonucleotide embedded into DNA2019

    • Author(s)
      Ayuna Takeishi, Manabu Yasui, Hiroyuki Sasanuma, Shunichi Takeda,Kaoru Sugasawa, Masamitsu Honma, Kiyoe Ura, Akira Sassa
    • Organizer
      The Joint Meeting of The 6th Asian Congress on Environmental Mutagens and the 48th Annual Meeting of the Japanese Environmental Mutagen Society
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] FTO's roles in DNA damage response and underlying mechanism2019

    • Author(s)
      Weiying LIU, Manabu YASUI, Akira SASSA, Yiyi CAO, Jing XI, Xinyue YOU, Masamitsu HONMA, Yang LUAN
    • Organizer
      The Joint Meeting of The 6th Asian Congress on Environmental Mutagens and the 48th Annual Meeting of the Japanese Environmental Mutagen Society
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Comparison analysis of backbones between 8-oxoG added DNA and intact DNA enclosed with water molecules by using an accelerated quantum chemical calculation2019

    • Author(s)
      Ai SUZUKI, Akira SASSA, Manabu YASUI, Masamitsu HONMA
    • Organizer
      The Joint Meeting of The 6th Asian Congress on Environmental Mutagens and the 48th Annual Meeting of the Japanese Environmental Mutagen Society
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ヒストンメチル化酵素NSD2 の酵素学的機能解析2019

    • Author(s)
      小池 望実、佐々 彰、安田 武嗣、浦 聖恵
    • Organizer
      第37 回 染色体ワークショップ 第18 回 核ダイナミクス研究会
  • [Presentation] ゲノム恒常性維持におけるヒストンメチル化酵素NSD2の役割2019

    • Author(s)
      浦 聖恵、佐々 彰、東條 あかり、原田 佳歩、安井 学、本間 正充
    • Organizer
      第13回日本エピジェネティクス研究会年会
  • [Remarks] 竹石歩奈さんがACEM/JEMS 2019でベストプレゼンテーション賞を受賞

    • URL

      https://uralab.wordpress.com/2019/11/21/acem-jems-2019

  • [Remarks] DNAに取り込まれたリボヌクレオチドの除去修復を担う新たなメカニズムを解明

    • URL

      http://www.bio.s.chiba-u.ac.jp/research.html#sassa201909

  • [Remarks] ゲノム編集ヒト細胞を用いて環境中化学物質の毒性を評価する方法を開発

    • URL

      http://www.bio.s.chiba-u.ac.jp/research.html#sassa201908

URL: 

Published: 2021-01-27  

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