2018 Fiscal Year Annual Research Report
網羅的な遺伝子発現のメタ解析による悪性脳腫瘍の分子標的治療薬の探索
Project/Area Number |
16K18466
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Research Institution | National Cancer Center Japan |
Principal Investigator |
喬 志偉 国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 研究員 (80759944)
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Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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Keywords | 悪性脳腫瘍 / Connectivity map / 既存薬の適応拡大 |
Outline of Annual Research Achievements |
Connectivity map と既存薬のスクリーニングで同定された化合物を対象に、薬剤の相乗効果を調べたところ、腫瘍細胞増殖の抑制の相乗効果がなかった。薬剤スクリーニング実験について、既存のプログラムをアップデートし、より効率よいハイスループットのシステムの構築ができた。膠芽腫の以外の悪性脳腫瘍の遺伝子発現データの基盤整備を行った。具体的に、Gene expression omnibus (GEO)とArrayExpressにて悪性脳腫瘍を組織型ごとに遺伝子発現データをダウンロードして整理した。また、サンプルに付随する詳細な臨床病理情報を収集した。悪性脳腫瘍研究に適合する遺伝子発現データをまとめ、カスタム・データベースを構築した。既存薬の適応拡大研究を進むために、Connectivity map解析に使用するデータセットの整備を行った。
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