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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Adaptive evolution of multi-copy hatching enzyme genes in Oryzias

Research Project

Project/Area Number 16K18593
Research InstitutionSophia University

Principal Investigator

川口 眞理  上智大学, 理工学部, 准教授 (00612095)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Keywordsrecombinant protein / enzyme activity
Outline of Annual Research Achievements

ミナミメダカは、至適塩濃度が異なる2種類のHCEアイソザイムをもつ。至適塩濃度の違いをもたらすアミノ酸残基を同定するために、両者でアミノ酸変異が見られる部位に一方を基に他方のアミノ酸残基に置き換えた変異HCEタンパク質を作製した。両者の間には9ケ所のアミノ酸変異が見られる。アミノ酸の性質が大きく変わる部位を置き換えた種々の変異組換えHCEを作製した。その結果、淡水型のHCEから塩水型のHCEへの変異は2ヶ所のアミノ酸残基の変異によってもたらされることが分かった。ところが、同じ領域を塩水型HCEから淡水型HCEのアミノ酸残基に変異させても至適塩濃度に違いがもたらされなかった。
塩水型HCEを基に部分的に淡水型HCEのアミノ酸変異を導入する方法では原因アミノ酸変異を同定することが困難と判断し、淡水型HCEを基に徐々に塩水型HCEのアミノ酸変異を導入していき、淡水型の活性が維持されるか否かを調べることにした。まず、淡水型HCEの立体構造モデルを作製し、立体構造上変異サイトが近接してる2ヶ所のみを塩水型HCEのアミノ酸残基に変異させた。合計5種類(1つは1ヶ所の変異のみ)の変異HCEを作製すると、4つが塩水型HCEの活性を示すようになった。この結果は、4~7ヵ所の変異が淡水型HCEの活性に重要である可能性を示している。そこで、淡水型HCEの活性に寄与しない2ヵ所の変異に加えて1ヵ所ずつ塩水型HCEの変異を導入した合計7種類の変異組換えHCEを作製した。しかしながら、すべてが淡水型HCEの活性を示した。このことは、すべての変異が単独では至適塩濃度の違いをもたらさず、複数のアミノ酸残基の変異が組み合わさって至適塩濃度の違いをもたらしていることを示している。

  • Research Products

    (20 results)

All 2019 2018

All Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 3 results) Presentation (12 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 1 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] Translocation of promoter-conserved hatching enzyme genes with intron-loss provides a new insight in the role of retrocopy during teleostean evolution.2019

    • Author(s)
      Tatsuki Nagasawa, Mari Kawaguchi, Tohru Yano, Sho Isoyama, Shigeki Yasumasu, and Masataka Okabe.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 9 Pages: 2447

    • DOI

      10.1038/s41598-019-38693-6

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genome sequence of the euryhaline Javafish medaka, Oryzias javanicus: a small aquarium fish model for studies on adaptation to salinity.2019

    • Author(s)
      Yusuke Takehana, Margot Zahm, Cedric Cabau, Christophe Klopp,Celine Roques, Olivier Bouchez, Cecile Donnadieu, Celia Barrachina, Laurent Journot, Mari Kawaguchi, Shigeki Yasumasu,Satoshi Ansai, Kiyoshi Naruse, Koji Inoue, Chuya Shinzato, Manfred Schartl, Yann Guiguen, and Amaury Herpin
    • Journal Title

      BioRxiv

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1101/593673

    • Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Male parental assistance in embryo hatching of barred-chin blenny Rhabdoblennius nitidus2019

    • Author(s)
      Kaori Sano, Risa Yokoyama, Takako Kitano, Takeshi Takegaki, Nobumasa Kitazawa, Toyoji Kaneko, Yoshihide Nishino, Shigeki Yasumasu, and Mari Kawaguchi
    • Journal Title

      Journal of Experimental Zoology Part B: Molecular and Developmental Evolution

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1002/jez.b.22854

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] IFPA meeting 2018 workshop report I: Reproduction and placentationamong ocean-living species; placental imaging; epigenetics and extracellularvesicles in pregnancy.2019

    • Author(s)
      Ganesh Acharya, Marisa Bartolomei, Anthony M. Carter, Larry Chamley, Charles F. Cotton, Junichi Hasegawa, Yuri Hasegawa, Satoshi Hayakawa, Mari Kawaguchi, et al.
    • Journal Title

      Placenta

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1016/j.placenta

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] 図書紹介:タツノオトシゴ図鑑2018

    • Author(s)
      川口眞理
    • Journal Title

      魚類学雑誌

      Volume: 65 Pages: 217-217

  • [Journal Article] 究極のイクメン魚―タツノオトシゴ2018

    • Author(s)
      川口眞理
    • Journal Title

      実験医学

      Volume: 36 Pages: 604-608

  • [Presentation] タツノオトシゴの育児嚢の形成に関わる候補遺伝子の発現パターン2019

    • Author(s)
      原田明里・川原玲香・川口眞理
    • Organizer
      第71回日本動物学会関東支部
  • [Presentation] メダカの卵膜硬化に関与するトランスグルタミナーゼ2019

    • Author(s)
      佐藤千優・川口眞理・安増茂樹
    • Organizer
      第71回日本動物学会関東支部
  • [Presentation] キュウリウオ目に存在する3つの孵化酵素の卵膜分解系:タンパク質機能性は、合目的で洗練されたシステムに進化する2019

    • Author(s)
      小島利恵子・松田千紘・高江洲雪子・川口眞理・安増茂樹
    • Organizer
      第71回日本動物学会関東支部
  • [Presentation] ヨウジウオ科魚類の育児嚢の進化2018

    • Author(s)
      川口眞理
    • Organizer
      第51回日本魚類学会
  • [Presentation] Formation of seahorse brood pouch2018

    • Author(s)
      Mari Kawaguchi
    • Organizer
      International Federation of Placenta Associations
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 骨魚類孵化酵素遺伝子のイントロン消失メカニズム―ゲノム構造の進化的制約から解放された遺伝子の分子進化―2018

    • Author(s)
      長澤竜樹・川口眞理・矢野十織・礒山翔・安増茂樹・岡部正隆
    • Organizer
      第89回日本動物学会
  • [Presentation] ニジマス孵化酵素の卵膜分解機能2018

    • Author(s)
      竹野陸央・川口眞理・安増茂樹
    • Organizer
      第89回日本動物学会
  • [Presentation] タツノオトシゴの育児嚢の形成に関わる分化因子の探査2018

    • Author(s)
      原田明里・川原玲香・川口眞理
    • Organizer
      第89回日本動物学会
  • [Presentation] 孵化酵素遺伝子のイントロン消失メカニズム:分子進化におけるレトロコピーの新たな役割の考察2018

    • Author(s)
      長澤竜樹・川口眞理・矢野十織・礒山翔・安増茂樹・岡部正隆
    • Organizer
      第20回日本進化学会
  • [Presentation] Molecular evolution of transglutaminase responsible for egg envelope hardening in fish2018

    • Author(s)
      Shigeki Yasumasu, Miyuki Horie, Tatsuki Nagasawa, Akira Oike, Mari Kawaguchi
    • Organizer
      第24回小型魚類研究会
  • [Presentation] タツノオトシゴの育児嚢の形成のカギを握る遺伝子は何か?2018

    • Author(s)
      川口眞理・原田明里
    • Organizer
      第4回ユニークな少数派実験動物を扱う若手が最先端アプローチを勉強する会
  • [Presentation] Sub-functionalization of hatching enzyme genes during evolution of sticklebacks2018

    • Author(s)
      Mari Kawaguchi, Kaori Sano, and Shigeki Yasumasu
    • Organizer
      9th International Conference on Stickleback Behavior and Evolution
    • Int'l Joint Research
  • [Book] 『魚類学の百科事典』8章「孵化」2018

    • Author(s)
      川口眞理
    • Total Pages
      704
    • Publisher
      丸善
    • ISBN
      4621303171
  • [Book] 『魚類学の百科事典』9章「孵化に関わる遺伝子」2018

    • Author(s)
      川口眞理
    • Total Pages
      704
    • Publisher
      丸善
    • ISBN
      4621303171

URL: 

Published: 2019-12-27  

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