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2016 Fiscal Year Research-status Report

霊長類におけるゲノム・メタゲノム相関とその進化的意義の解明

Research Project

Project/Area Number 16K18630
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

早川 卓志  京都大学, 霊長類研究所, 特定助教 (00758493)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Keywords霊長類 / 細菌叢 / ゲノム多様性 / 次世代シークエンサー
Outline of Annual Research Achievements

本研究は、霊長類種のゲノム多様性と、霊長類の腸内などに共生する細菌叢の個体差や種差との関係について、次世代シークエンシング手法をもちいて明らかにし、細菌叢の共生を制御する分子メカニズムを明らかにすることを目的としている。今年度は、京都大学熊本サンクチュアリや公益財団法人日本モンキーセンターにおいて、チンパンジーをはじめとするさまざまな非ヒト霊長類の糞便、胃内容物、口腔スワブといった細菌叢サンプルの機会的収集をおこない、それらに由来するDNAライブラリの構築をおこなった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本研究の目的である非ヒト霊長類由来の共生細菌叢の解析について、さまざまな分類群ならびに同種複数個体からの細菌叢のサンプリングを実施することができ、初年度の進捗としてはおおむね順調である。

Strategy for Future Research Activity

現在までに収集した細菌叢DNAライブラリについて、次世代シークエンサーを用いた配列解析を実施し、所期の目的であるホスト種との関連について多変量解析をおこなう。

  • Research Products

    (3 results)

All 2017 2016

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] Functional characterization of the TAS2R38 bitter taste receptor for phenylthiocarbamide in colobine monkeys2017

    • Author(s)
      Laurentia Henrieta Permita Sari Purba, Kanthi Arum Widayati, Kei Tsutsui, Nami Suzuki-Hashido, Takashi Hayakawa, Sarah Nila, Bambang Suryobroto, Hiroo Imai
    • Journal Title

      Biology Letters

      Volume: 13 Pages: 20160834

    • DOI

      10.1098/rsbl.2016.0834

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Variation in ligand responses of the bitter taste receptors TAS2R1 and TAS2R4 among New World monkeys2016

    • Author(s)
      Kei Tsutsui, Masahiro Otoh, Kodama Sakurai, Nami Suzuki-Hashido, Takashi Hayakawa, Takumi Misaka, Yoshiro Ishimaru, Filippo Aureli, Amanda D Melin, Shoji Kawamura, Hiroo Imai
    • Journal Title

      BMC evolutionary biology

      Volume: 16 Pages: 208

    • DOI

      10.1186/s12862-016-0783-0

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 同所的に生息する野生グエノン3種における全遺伝子配列の比較解析2017

    • Author(s)
      早川卓志, 田代靖子, 橋本千絵, 五百部裕, 今井啓雄
    • Organizer
      第61回プリマーテス研究会
    • Place of Presentation
      公益財団法人日本モンキーセンター
    • Year and Date
      2017-01-28 – 2017-01-29

URL: 

Published: 2018-01-16  

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