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2016 Fiscal Year Research-status Report

オオムギの形質転換効率に関わる遺伝子座の特定と機能解析

Research Project

Project/Area Number 16K18634
Research InstitutionOkayama University

Principal Investigator

久野 裕  岡山大学, 資源植物科学研究所, 助教 (70415454)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Keywords形質転換 / オオムギ / QTLマッピング / DNAマーカー
Outline of Annual Research Achievements

オオムギは、安定して形質転換可能な品種が「Golden Promise」(GP)に限られており、この制約が形質遺伝子の効率的な解析を妨げている。形質転換に必要な遺伝子が明らかとなれば、他の品種での形質転換も容易になると考えられる。本研究は、オオムギの形質転換に必要あるいは有利な遺伝子を単離するため、形質転換が困難なオオムギ品種「Haruna Nijo」(HN)と容易な品種GPとの交配に由来する遺伝解析を用いて、(1)オオムギの形質転換に必要なゲノム領域の絞り込みならびに(2)その機能解析を行うことを目的としている。昨年度までに、HN×GPのF2から得られた形質転換体60個体(tHN×GP)を用いて、その染色体分離の歪みを検出することにより、オオムギの形質転換に必要あるいは有利な遺伝子座TFA(Transformation Amenability)を3カ所検出した。本年度は、tHN×GP を用いて、Illumina社インフィニウムシステムによる高密度マーカー解析を行った。その結果、1131の新規SNPsマーカーを得ることが出来た。さらに、上記(1)(2)を遂行するための実験材料として、HNを戻し交雑親またはGPを戻し交雑親としたBC2F1世代をそれぞれ育成し、得られたSNPsマーカーを用いてTFA遺伝子座が分離するような個体を選抜した。今後、この後代を準同質遺伝子系統として展開し、(1)(2)を行う予定である。一方、GPと米国品種「Full Pint」との倍加半数体系統を用いて、TFAが形質転換に必要な遺伝子座であることを証明した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本年度は、Illumina社インフィニウムシステムによる高密度マーカー解析ならびに次年度に使用予定の実験材料の育成を行った。それぞれ研究計画の通りに進んでいる。

Strategy for Future Research Activity

次年度以降、育成した準同質遺伝子系統を用いて、形質転換能のQTL解析を行う。各系統ごとの (i)抗生物質耐性カルスの増殖率、(ii)その緑色シュートの再分化効率ならびに(iii)T-DNA導入効率(GFPによる一過性発現効率)などの項目を厳密に評価することにより、3つのTFAがそれぞれどのような働きをしているのかを明らかにする。同時に、TFAの原因遺伝子の絞り込みを行う。

  • Research Products

    (12 results)

All 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Washington State University/Oregon State University(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Washington State University/Oregon State University
  • [Int'l Joint Research] The Sainsbury Laboratory(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      The Sainsbury Laboratory
  • [Int'l Joint Research] Estacion Experimental de Aula Dei(スペイン)

    • Country Name
      SPAIN
    • Counterpart Institution
      Estacion Experimental de Aula Dei
  • [Journal Article] Selection of transformation-efficient barley genotypes based on TFA (transformation amenability) haplotype and higher resolution mapping of the TFA loci2017

    • Author(s)
      Hisano, H., Meints, B., Moscou, M.J., Cistue, L., Echávarri, B., Sato, K. and Hayes, P.M.
    • Journal Title

      Plant Cell Reports

      Volume: 36 Pages: 611-620

    • DOI

      10.1007/s00299-017-2107-2

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Genomic regions responsible for amenability to Agrobacterium-mediated transformation in barley2016

    • Author(s)
      Hisano, H. and Sato, K.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 6 Pages: 37505

    • DOI

      10.1038/srep37505

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] オオムギの形質転換効率に関わる遺伝子単離に向けたDNAマーカー開発2017

    • Author(s)
      久野 裕・宗森 広美・元井 由加・新海 典夫・瀬々 潤・豊田 敦・佐藤 和広
    • Organizer
      日本育種学会第131回講演会
    • Place of Presentation
      名古屋市
    • Year and Date
      2017-03-29 – 2017-03-30
  • [Presentation] Identification of TFA genomic regions that confer amenability to Agrobacterium-mediated transformation in barley2017

    • Author(s)
      Hiroshi Hisano
    • Organizer
      PAGXXV2017 (Plant and Animal Genome)
    • Place of Presentation
      San Diego, CA, U.S.A.
    • Year and Date
      2017-01-14 – 2017-01-18
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] TFA genomic regions confer amenability to Agrobacterium-mediated transformation in barley2017

    • Author(s)
      Hisano, H. and Sato K.
    • Organizer
      PAGXXV2017 (Plant and Animal Genome)
    • Place of Presentation
      San Diego, CA, U.S.A.
    • Year and Date
      2017-01-14 – 2017-01-18
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 形質転換可能なオオムギ系統を作る方法2016

    • Author(s)
      久野 裕・安東 広美・元井 由加・Patrick M. Hayes・佐藤 和広
    • Organizer
      日本育種学会第130回講演会
    • Place of Presentation
      鳥取市
    • Year and Date
      2016-09-24 – 2016-09-25
  • [Presentation] オオムギの形質転換効率に関わるゲノム領域の特定2016

    • Author(s)
      久野 裕・安東 広美・元井 由加・佐藤 和広
    • Organizer
      第34回日本植物細胞分子生物学会
    • Place of Presentation
      上田市
    • Year and Date
      2016-09-01 – 2016-09-03
  • [Presentation] Identification of the genomic region responding to amenability of Agrobacterium-mediated transformation in barley2016

    • Author(s)
      Hisano, H., Motoi, Y. and Sato K.
    • Organizer
      12th International Barley Genetics Symposium
    • Place of Presentation
      Minneapolis, MN, U.S.A.
    • Year and Date
      2016-06-26 – 2016-06-30
    • Int'l Joint Research
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 形質転換感受性のオオムギの作出方法2016

    • Inventor(s)
      佐藤和広、久野裕
    • Industrial Property Rights Holder
      佐藤和広、久野裕
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2016-124749
    • Filing Date
      2016-06-23

URL: 

Published: 2018-01-16   Modified: 2022-02-21  

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