2018 Fiscal Year Annual Research Report
Elucidating wood degradation mechanism of a standing tree pathogen
Project/Area Number |
16K18727
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Research Institution | Hokkaido University |
Principal Investigator |
堀 千明 北海道大学, 工学研究院, 助教 (50722948)
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Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2019-03-31
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Keywords | 木材腐朽 / 立木加害 / 植物 |
Outline of Annual Research Achievements |
近年地球規模の環境変動と持続型社会の構築が求められる中、地球所で最大規模の生合成産物である植物バイオマスをエネルギー資源として利用するための多面的な研究が急務である。なかでも植物を効率よく分解出来る腐朽菌の植物分解機構を理解するための研究が進んでいる。本研究では、木材腐朽菌の中でも未解明な立木加害性の白色腐朽菌ベッコウタケに着目して、多面的なオミクス解析手法により本菌の植物分解機構を包括的に理解することを目指す。ベッコウタケは北海道大学構内をはじめ、日本中で甚大な倒木被害を引き起こしている。それら情報を元に植物バイオマスの利用への一助となる知見を得ることを目標としている。
本年度は、本研究において単離したベッコウタケの本菌のゲノム情報を取得した。その情報を元に、他の糸状菌ゲノムと植物成分および抽出成分の分解ポテンシャルを比較した。その結果、糖質関連酵素(CAZy)においてほとんど同じ遺伝子を保有していた。またこの配列情報をデータベースとして、抽出成分を添加した培養系で得られたタンパク質をプロテオーム解析することで、植物成分の分解に関連する酵素を同定した。
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[Journal Article] The structure of lignin deposited after infection is crucial for Striga hermonthica resistance.2019
Author(s)
Mutuku JM, Cui S, Hori C, Takeda Y, Tobimatsu Y, Nakabayashi R, Mori T, Saito K, Demura T, Umezawa T, Yoshida S, Shirasu K.
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Journal Title
Plant Physiol.
Volume: 179
Pages: 1796-1809
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Multi-omic analyses of extensively decayed Pinus contorta reveal expression of diverse array of lignocellulose degrading enzymes.2018
Author(s)
Hori C, Gaskell J, Cullen D, Sabat G, Stewart PE, Lail K, Peng Y, Barry K, Grigoriev IV, Kohler A, Fauchery L, Martin F, Zeiner CA, Bhatnagar JM.
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Journal Title
Appl. Environ. Microbiol.
Volume: 84
Pages: e01133-18
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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