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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Elucidating wood degradation mechanism of a standing tree pathogen

Research Project

Project/Area Number 16K18727
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

堀 千明  北海道大学, 工学研究院, 助教 (50722948)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2019-03-31
Keywords木材腐朽 / 立木加害 / 植物
Outline of Annual Research Achievements

近年地球規模の環境変動と持続型社会の構築が求められる中、地球所で最大規模の生合成産物である植物バイオマスをエネルギー資源として利用するための多面的な研究が急務である。なかでも植物を効率よく分解出来る腐朽菌の植物分解機構を理解するための研究が進んでいる。本研究では、木材腐朽菌の中でも未解明な立木加害性の白色腐朽菌ベッコウタケに着目して、多面的なオミクス解析手法により本菌の植物分解機構を包括的に理解することを目指す。ベッコウタケは北海道大学構内をはじめ、日本中で甚大な倒木被害を引き起こしている。それら情報を元に植物バイオマスの利用への一助となる知見を得ることを目標としている。

本年度は、本研究において単離したベッコウタケの本菌のゲノム情報を取得した。その情報を元に、他の糸状菌ゲノムと植物成分および抽出成分の分解ポテンシャルを比較した。その結果、糖質関連酵素(CAZy)においてほとんど同じ遺伝子を保有していた。またこの配列情報をデータベースとして、抽出成分を添加した培養系で得られたタンパク質をプロテオーム解析することで、植物成分の分解に関連する酵素を同定した。

  • Research Products

    (14 results)

All 2019 2018 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 8 results) Presentation (5 results)

  • [Int'l Joint Research] Forest Products Laboratory(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Forest Products Laboratory
  • [Journal Article] Protein components of water extracts from fruiting bodies of the Reishi mushroom Ganoderma lucidum contribute to the production of functional molecules.2019

    • Author(s)
      Kumakura K* and Hori C*, Matsuoka H, Igarashi K, Samejima M. *Equal contribution.
    • Journal Title

      J. Sci. Food Agricul.

      Volume: 99 Pages: 529-535

    • DOI

      DOI, https://doi.org/10.1002/jsfa.9211

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] High-cell density culture of poly(lactate-co-3-hydroxybutyrate)-producing Escherichia coli by using glucose/xylose-switching fed-batch jar fermentation.2019

    • Author(s)
      Hori C, Yamazaki T, Ribordy G, Takisawa K, Matsumoto K, Ooi T, Zinn M, Taguchi S.
    • Journal Title

      J. Biosci. Bioeng.

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      DOI: 10.1016/j.jbiosc.2018.11.006.

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxidase (RuBisCO)-mediated de novo synthesis of glycolate-based polyhydroxyalkanoate in Escherichia coli.2019

    • Author(s)
      Matsumoto K, Saito J, Yokoo T, Hori C, Nagata A, Kudoh Y, Ooi T, Taguchi S.
    • Journal Title

      J. Biosci. Bioeng.

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      DOI: 10.1016/j.jbiosc.2019.03.002.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genomes of neutrophilic sulfur-oxidizing chemolithoautotrophs representing 9 proteobacterial species from 8 genera.2019

    • Author(s)
      Watanabe T, Kojima H, Umezawa K, Hori C, Takasuka T, Kato Y, Fukui M.
    • Journal Title

      Frontiers in Microbiol.

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      DOI: 10.3389/fmicb.2019.00316.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The structure of lignin deposited after infection is crucial for Striga hermonthica resistance.2019

    • Author(s)
      Mutuku JM, Cui S, Hori C, Takeda Y, Tobimatsu Y, Nakabayashi R, Mori T, Saito K, Demura T, Umezawa T, Yoshida S, Shirasu K.
    • Journal Title

      Plant Physiol.

      Volume: 179 Pages: 1796-1809

    • DOI

      https://doi.org/10.1104/pp.18.01133

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Multi-omic analyses of extensively decayed Pinus contorta reveal expression of diverse array of lignocellulose degrading enzymes.2018

    • Author(s)
      Hori C, Gaskell J, Cullen D, Sabat G, Stewart PE, Lail K, Peng Y, Barry K, Grigoriev IV, Kohler A, Fauchery L, Martin F, Zeiner CA, Bhatnagar JM.
    • Journal Title

      Appl. Environ. Microbiol.

      Volume: 84 Pages: e01133-18

    • DOI

      10.1128/AEM.01133-18.

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Secretome analysis of the basidiomycete Phanerochaete chrysosporium grown on ammonia-treated lignocellulosic biomass from birch wood.2018

    • Author(s)
      Sakuragi S, Hori C, Igarashi K, Samejima M.
    • Journal Title

      J. Wood Sci.

      Volume: 64 Pages: 845-853

    • DOI

      10.1007/s10086-018-1770-4

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] In vitro analysis of D-lactyl-CoA-polymerizing polyhydroxyalkanoate synthase in polylactate and poly(lactate-co-3 hydroxybutyrate) Syntheses.2018

    • Author(s)
      Matsumoto K, Iijima M, Hori C, Utsunomia C, Ooi T, and Taguchi S.
    • Journal Title

      Biomacromolecules

      Volume: 19 Pages: 2889-2895

    • DOI

      10.1021/acs.biomac.8b00454

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] マルチメタオミクス解析によって明らかになった自然環境下での木材分解の多様性2019

    • Author(s)
      堀千明、ジル・ガスケル、ダニエル・カレン、大井俊彦、松本謙一郎
    • Organizer
      日本農芸化学会2019大会
  • [Presentation] 腐朽された樹木のメタ・オミクス解析 ~環境下で腐朽を担う微生物群と酵素群が明らかに~2019

    • Author(s)
      堀千明、大井俊彦、松本謙一郎、ジル・ガスケル、ダニエル・カレン
    • Organizer
      第69回日本木材学会大会
  • [Presentation] 針葉樹分解性白色腐朽菌Phlebiopsis giganteaにおける抽出成分の分解性解析2019

    • Author(s)
      岩田茉奈、堀千明、大井俊彦、松本謙一郎、佐野雄三
    • Organizer
      第69回日本木材学会大会
  • [Presentation] ハリエンジュが生産する生体防御物質に対する立木加害性木材腐朽菌ベッコウタケの応答2019

    • Author(s)
      松本壘、堀千明、大井俊彦、松本謙一郎、宮本敏澄、重富顕吾、佐野雄三
    • Organizer
      第69回日本木材学会大会
  • [Presentation] 木材腐朽菌ベッコウタケと宿主木ハリエンジュの相互作用解析2018

    • Author(s)
      松本壘、堀千明、宮本敏澄、重富顕吾、佐野雄三、大井俊彦、松本謙一郎
    • Organizer
      日本生物工学会北日本支部札幌シンポジウム

URL: 

Published: 2019-12-27  

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