2016 Fiscal Year Research-status Report
バッレト食道癌の新規バイオマーカー開発を目指したゲノム低メチル化の網羅的解析
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16K19944
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| Research Institution | Kumamoto University |
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Principal Investigator |
原田 和人 熊本大学, 医学部附属病院, 非常勤診療医師 (70608869)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2018-03-31
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| Keywords | 食道癌 / DNAメチル化 / LINE-1 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
正常食道粘膜細胞株（HET-1A）と Barret食道細胞株（CP-A、CP-B）、食道腺癌細胞株（JHESO、OACP、SK-4、BE3、OE33、Flo-1）のLINE-1メチル化レベルを、Bisulfite-Pyrosequencing法により測定した。Barret食道細胞株のLINE-1メチル化レベルは正常細胞株と比較して有意に低下していることを明らかにした。食道癌細胞株のLINE-1メチル化レベルは正常細胞株、Barret食道細胞株と比較して、有意な差は認められなかった。MD Anderson Cancer Centerには治療前の内視鏡検査時に採取された生検組織が凍結保存してある。データベースより、治療前凍結組織を有する食道腺癌患者をピックアップし、臨床病理学的データ、予後データの整理を行った。DNA、RNAの抽出を行う前に凍結組織にがん細胞が含まれていること、壊死細胞組織や線維化組織が少ないことを確認するために、治療前の凍結生検組織をOCTコンパウンドに包埋し、クリオスタットを用いて、凍結状態のままは薄切切片を作製している。組織学的に、食道腺癌が組織に半数以上含まれていることを確認した後にDNA、RNAの抽出を行う予定である。まずは正常部５０例、食道腺癌部１００例、Barret食道組織１００例からDNAを抽出し、LINE-1メチル化レベルを測定する予定である。良好な結果を得ることができれば、症例数を増やす予定である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
すでに臨床検体はピックアップしてあり、現在DNAの抽出を行っている。Bisulfite-Pyrosequencing 法によるLINE-1メチル化レベルの測定方法はすでに確立済みであり、DNAの抽出が終了後、速やかに測定可能である。臨床データもすでに整理されており、LINE-1メチル化レベルと臨床病理学的因子の関係も解析可能である。
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| Strategy for Future Research Activity |
やや予定より遅れてはいれるが、概ね順調に研究は進んでいる。次年度中に食道腺癌のLINEメチル化レベルと臨床病理学的因子の関係が明らかになる。この結果をにより、今後の研究方針が確定すると思われる。現在行っているLINE-1メチル化レベルの測定をこのまま継続していくことが重要であると考える。
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| Causes of Carryover |
医局保管の試薬、消耗品を使用することが出来たため。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
試薬、消耗品の購入費、及び、研究データの管理、資料整理を行ってもらうための事務補佐員の雇用経費に充てたいと考える。
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