2017 Fiscal Year Annual Research Report
Comprehensive analysis of DNA hypo methylation in Barrett's esophageal carcinoma
| Project/Area Number |
16K19944
|
|---|
| Research Institution | Kumamoto University |
|---|
Principal Investigator |
原田 和人 熊本大学, 医学部附属病院, 非常勤診療医師 (70608869)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2018-03-31
|
| Keywords | 食道腺癌部 / 正常部 / Barrett食道 / LINE-1 / DNAメチル化 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
正常食道粘膜細胞株（HET-1A）と Barret食道細胞株（CP-A、CP-B）、食道腺癌細胞株（JHESO、OACP、SK-4、BE3、OE33、Flo-1）のLINE-1メチル化レベルを、Bisulfite-Pyrosequencing法により測定した。Barret食道細胞株のLINE-1メチル化レベルは正常細胞株と比較して有意に低下していることを明らかにした。組織学的に、食道腺癌が組織の半数以上含まれていることを確認した後にDNA、RNAの抽出を治療前生検凍結組織より食道腺癌部178例、正常部52例、Barrett食道77例の症例でおこなった。抽出されたDNA よBisulfite-Pyrosequencing法によりLINE－１メチル化レベルを測定した。癌部のLINE-1メチル化レベルは正常部、Barrett食道と比較して有意に低下していることを明らかにした。更に、LINE-1低メチル化レベルの症例の予後は高メチル化レベルの症例と比較して有意に予後が不良であることがわかった。150例以上の症例数での検討で、当初の仮説であったLINE-1の低メチル化レベルは食道腺癌の悪性度と関係することを証明できた。現在、臨床検体からのDNA抽出を継続しており、検討症例数を増やす予定である。また、並行してLINE-1低メチル化がなぜ食道腺癌の悪性度に寄与するのかに焦点をおいて研究を進めている。良好な結果が得られており、平成30年度内にデータをまとめ、論文を投稿する予定である。
|
-
[Journal Article] Prognostic value of LINE-1 methylation level in 321 patients with primary liver cancer including hepatocellular carcinoma and intrahepatic cholangiocarcinoma.2018
Author(s)
Miyata T, Yamashita Y, Baba Y, Harada K, Yamao T, Umezaki N, Tsukamoto M, Kitano Y, Yamamura K, Arima K, Nakagawa S, Okabe H, Imai K, Hashimoto D, Chikamoto A, Shimokawa M, Baba H
-
Journal Title
Oncotarget
Volume: 9
Pages: 20795-20806
DOI
Peer Reviewed
-
[Journal Article] LINE-1 methylation level and prognosis in pancreas cancer: pyrosequencing technology and literature review.2017
Author(s)
Yamamura K, Kosumi K, Baba Y, Harada K, Gao F, Zhang X, Zhou L, Kitano Y, Arima K, Kaida T, Takeyama H, Higashi T, Imai K, Hashimoto D, Chikamoto A, Tan X, Baba H
-
Journal Title
Surg Today
Volume: 47(12)
Pages: 1450-1459
DOI
Peer Reviewed
