2018 Fiscal Year Annual Research Report
Identification of molecular target of high risk pediatric AML by comprehensive genetic analysis
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16K20951
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| Research Institution | Yokohama City University |
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Principal Investigator |
柴 徳生 横浜市立大学, 医学部, 講師 (50600615)
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2016-04-01 – 2019-03-31
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| Keywords | 小児 / 急性骨髄性白血病 / DNAメチル化 / 抑制性ポリコーム / 遺伝子発現 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
小児AML64例に対し、網羅的DNAメチル化解析を施行した。網羅的DNAメチル化解析により約21,000遺伝子に配置された850,000プローブによって、遺伝子全体の99％およびCPGアイランドの96％がカバーされ、ゲノムワイドな解析が可能となる。結果として、DNAメチル化パターンより、4群に層別化されることを同定し、各遺伝子異常、遺伝子発現、予後と深い相関が認められ、既知の遺伝子異常それぞれのエピジェネティクスな変化が明らかとなった一方、既知の遺伝子異常では分類不能であった症例をメチル化解析特有の症例群として分類可能であることを同定した。遺伝子異常、DNAメチル化を組み合わせることで、より高精度な予後層別化を可能とした。
具体的には、絶対的予後不良因子とされているFLT3-ITDにおいて、DNAメチル化パターンから予後良好例を抽出することが可能となり、今後、不必要な造血幹細胞移植を回避することが可能になる可能性がある。その結果、移植治療関連死亡や治療関連の後遺症、合併症を減らすことができ、QOL向上に繋がることが期待される。
我々の先行研究において、予後不良群ではPRDM16ないしEVI1遺伝子が高発現を呈していることが明らかとなっており、今回の解析において、これらの群で高度にDNAメチル化が起こっていることを確認した。当初の計画ではプロテオーム解析を行う予定であったが、DNAメチル化解析の結果を受けて、ATACシーケンスによるゲノム全体のアクセシビリティの解析を優先し、小児AML5例で施行し、現在データ解析中である。さらにはCHIPシーケンスやパスウェイ解析を通してAML発症およびAMLの難治性に関わると考えられる経路で何が起きているのかを明らかにし、標的因子の同定および薬剤の開発に繋げていきたいと考えている。
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[Presentation] Clinical significance and prognostic analyses of PTPN11, RAS, and CBL mutations in pediatric AML -the JCCG study, JPLSG AML05-2018
Author(s)
Taeko Kaburagi, Genki Yamato, Norio Shiba, Yusuke Hara, Kentaro Ohki, Manabu Sotomatsu, Hirokazu Arakawa, Nobutaka Kiyokawa, Daisuke Tomizawa, Souichi Adachi, Takashi Taga, Keizo Horibe, Yasuhide Hayashi.
Organizer
日本血液学会
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[Presentation] Prognosis of pediatric AML patient with FLT3-ITD is predicted by DNA methylation pattern; the JCCG study, JPLSG AML052018
Author(s)
Genki Yamato, Tomoko Kawai, Norio Shiba, Kentaro Ohki, Yusuke Hara, Nobutaka Kiyokawa, Daisuke Tomizawa, Akira Shimada, Manabu Sotomatsu, Hirokazu Arakawa, Souichi Adachi, Takashi Taga, Keizo Horibe, Kenichiro Hata, Yasuhide Hayashi.
Organizer
世界小児がん学会
Int'l Joint Research
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[Presentation] 3.Comprehensive Analysis of 343 Genes using Targeted Sequencing Panel by Next-Generation Sequencer In 77 Pediatric AML Patients with Normal and Complex Karyotypes: JCCG Study, JPLSG AML-05.2018
Author(s)
Genki Yamato, Norio Shiba, Kenichi Yoshida, Yusuke Hara, Yuichi Shiraishi, Kentaro Ohki, Manabu Sotomatsu, Hirokazu Arakawa, Hidemasa Matsuo, Akira Shimada, Nobutaka Kiyokawa, Daisuke Tomizawa, Takashi Taga, Keizo Horibe, Satoru Miyano, Seishi Ogawa, Souichi Adachi, Yasuhide Hayashi
Organizer
米国血液学会
Int'l Joint Research
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