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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Development of Chemical Ligation Reaction of RNA for Chemical Synthesis of mRNA

Research Project

Project/Area Number 16K21091
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

木村 康明  名古屋大学, 理学研究科, 助教 (80769977)

Project Period (FY) 2016-04-01 – 2018-03-31
KeywordsRNA / DNA / ケミカルライゲーション / 核酸連結反応 / ホスホロチオエート / 核酸医薬
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、長鎖核酸の化学合成を可能にする核酸のケミカルライゲーション反応(化学的連結反応)の開発を目標とした。前年度までにホスホロチオエート末端を持つオリゴ鎖とアミノ基末端を持つオリゴ鎖の連結反応の開発に成功した。本反応ではホスホロチオエート基を活性化剤で処理しホスホロチオエステル基に変換し、それに対しもう一方の核酸鎖のアミノ基が求核攻撃をすることで、ホスホロアミデート結合で連結された核酸鎖を与える。今年度は本ライゲーション反応を利用して、ホタルルシフェラーゼに対するsiRNAをコードするベクターの化学合成を行った。このベクターを構成する6断片の核酸(ホスホロチオエート基とアミノ基を含有)を核酸合成機で合成し連結反応を行った。得られた連結体をデュアルルシフェラーゼアッセイで評価を行ったところ、想定する遺伝子発現抑制効果を観測することが出来た。本結果は、開発したライゲーション反応が生理活性を有する機能性核酸の合成に有用であることを示すものである。今後、連結反応の最適化を行い、より高効率な合成法を開発する予定である。
また、上記とは異なる新たな化学的連結反応の開発を行った。この反応はスルホンアミド基を有する核酸鎖とホスホロチオエート基末端を持つ核酸鎖との連結反応で、上記と同様にホスホロアミデート結合で連結された核酸鎖を与える。生成物の構造は上記と同じであるが、核酸鎖の活性化のステップを必要としないこと、およびアミノ基プロトン化による反応性の低下の問題を避けられることなどから、細胞内などの生体環境下での連結反応への応用に適している。反応検討の結果、in vitroにおいて良好な収率で連結体を与える条件を見出すことに成功した。今後は細胞内での連結反応による生理活性核酸の構築などに応用していく予定である。

  • Research Products

    (14 results)

All 2018 2017

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] Chemical Ligation Reactions of Oligonucleotides for Biological and Medicinal Applications2018

    • Author(s)
      Abe Hiroshi、Kimura Yasuaki
    • Journal Title

      Chemical and Pharmaceutical Bulletin

      Volume: 66 Pages: 117~122

    • DOI

      10.1248/cpb.c17-00615

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Chemical ligation of oligonucleotides using an electrophilic phosphorothioester2017

    • Author(s)
      Maruyama Hideto、Oikawa Ryota、Hayakawa Mayu、Takamori Shono、Kimura Yasuaki、Abe Naoko、Tsuji Genichiro、Matsuda Akira、Shuto Satoshi、Ito Yoshihiro、Abe Hiroshi
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 45 Pages: 7042~7048

    • DOI

      10.1093/nar/gkx459

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Chemical ligation reaction for oligonucleotides based on electrophilic phosphorothioester2018

    • Author(s)
      Yasuaki Kimura、Hideto Maruyama、Ryota Oikawa、Mayu Hayakawa、Naoko Abe、Genichiro Tsuji、Akira Matsuda、Satoshi Shuto、Yoshihiro Ito、Hiroshi Abe
    • Organizer
      255th ACS National Meeting
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 高分子核酸医薬の低分子化戦略:細胞内ビルドアップ法の開発2018

    • Author(s)
      木村康明、丸山豪斗、笈川涼太、早川真由、吉永静也、辻厳一郎、阿部奈保子、周東智、松田彰、南川典昭、阿部洋
    • Organizer
      日本薬学会第138年会
  • [Presentation] 高分子核酸医薬の低分子戦略:細胞内ビルドアップ法の開発2017

    • Author(s)
      木村康明、丸山豪斗、笈川涼太、早川真由、吉永静也、辻厳一郎、阿部奈保子、周東智、松田彰、南川典昭、阿部洋
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会 第12回年会
  • [Presentation] 高分子核酸医薬の低分子戦略:細胞内ビルドアップ法の開発2017

    • Author(s)
      木村康明、丸山豪斗、笈川涼太、早川真由、吉永静也、辻厳一郎、阿部奈保子、周東智、松田彰、南川典昭、阿部洋
    • Organizer
      日本核酸医薬学会第3回年会
  • [Presentation] 機能性核酸合成を志向した化学的核酸連結反応2017

    • Author(s)
      笈川涼太、早川真由、丸山豪斗、阿部奈保子、木村康明、周東智、松田彰、南川典昭、阿部洋
    • Organizer
      日本核酸医薬学会第3回年会
  • [Presentation] 高分子核酸医薬の低分子戦略:細胞内ビルドアップ法の開発2017

    • Author(s)
      木村康明、丸山豪斗、笈川涼太、早川真由、吉永静也、辻厳一郎、阿部奈保子、周東智、松田彰、南川典昭、阿部洋
    • Organizer
      第11回バイオ関連化学シンポジウム
  • [Presentation] 高分子核酸医薬の低分子戦略:細胞内ビルドアップ法の開発2017

    • Author(s)
      木村康明、丸山豪斗、笈川涼太、早川真由、吉永静也、辻厳一郎、阿部奈保子、周東智、松田彰、南川典昭、阿部洋
    • Organizer
      第35回メディシナルケミストリーシンポジウム
  • [Presentation] 環境応答性環状オリゴ核酸による遺伝子発現制御2017

    • Author(s)
      吉永静也、阿部奈保子、木村康明、友池史明、阿部洋
    • Organizer
      第48回中化連秋季大会
  • [Presentation] 機能性核酸合成を志向した化学的核酸連結反応2017

    • Author(s)
      笈川涼太、早川真由、丸山豪斗、阿部奈保子、友池史明、木村康明、周東智、松田彰、南川典昭、阿部洋
    • Organizer
      第48回中化連秋季大会
  • [Presentation] RNA Interference by Intracellar Buildup of siRNA2017

    • Author(s)
      Yasuaki Kimura、Hideto Maruyama、Ryota Oikawa、Genichiro Tsuji、Shizuya Yoshinaga、Naoko Abe、Satoshi Shuto、Akira Matsuda、Yoshihiro Ito、Hiroshi Abe
    • Organizer
      The 44th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • Int'l Joint Research
  • [Book] 中分子創薬に資するペプチド・核酸・糖鎖の合成技術 機能性核酸合成を指向した化学的核酸連結反応2018

    • Author(s)
      木村康明、阿部洋
    • Total Pages
      317
    • Publisher
      シーエムシー出版
    • ISBN
      978-4-7813-1320-7
  • [Book] Biophilia 電子版 21 特集: 論理薬科学―創薬の基盤2017

    • Author(s)
      阿部洋、木村康明
    • Total Pages
      99
    • Publisher
      アドスリー

URL: 

Published: 2018-12-17  

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