魚類の健康コンディション評価のための血液中ノンコーディングRNA網羅的解析

2016 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 16K21208
• Research Institution: Ehime University
• Principal Investigator: 清水 園子 (山口園子) 愛媛大学, 南予水産研究センター, 准教授 (90531369)
• Project Period (FY): 2016-04-01 – 2019-03-31
• Keywords: 魚病 / ノンコーディングRNA

Outline of Annual Research Achievements

我が国の魚類養殖において、魚病の発生は慢性化しており、安定的な養殖生産を行う上で大きな障害となっている。本研究課題では、モデル魚であるマダイ血液中で発現しているノンコーディングRNA（ncRNA）を網羅的に解析し、魚類の免疫や代謝、ストレス耐性などで機能的な働きをもつncRNAを探索する。さらに、魚病感染時や、水温などの環境変化に伴うマーカーncRNAの発現の変動を解析する。本研究成果により、魚類の血液で発現しているncRNAが持つ、免疫系や生理状態における機能が明らかとなれば、簡便かつ定量的に魚病の早期発見や健康状態の把握が可能となり、被害の大幅軽減に繋がると期待される。持続的かつ安全・安心な水産物の供給体制を構築する上で必要不可欠な研究である。本研究では、魚類の免疫系や生理におけるノンコーディングRNA（ncRNA）の機能を解明し、感染症や健康状態把握のマーカーを開発することを目的として、以下について研究を行う。（１）魚類血液中で発現しているncRNAのの網羅的探索およびその機能解析（２）血液中ncRNA 測定方法の開発（３）免疫、代謝、ストレス耐性に関与するncRNAの発現変動の解析。これらの結果から、魚類におけるncRNAの機能が明らかとなるとともに、簡便かつ定量的に魚病の早期発見や健康状態の把握が可能となり、魚病被害の大幅軽減に繋がると期待される。
1年目の今年度は、次世代シーケンサーを用いて、血球中のncRNAの情報を網羅的に取得するために、健康なマダイおよびエドワジエラ症やイリドウイルス症などの感染症に罹患しているマダイから血液を採取、血清、血球（白血球および赤血球）した。

Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

本年度はサンプルの採取を進めたが、研究者が妊娠・出産による産休及び育休を平成28年9月から平成29年5月まで取得したため、研究を中断している。そのため、やや遅れていると評価した。

Strategy for Future Research Activity

研究期間延長の申請をし、研究を再開する予定である。再開後は引き続き、健康なマダイおよびエドワジエラ症やイリドウイルス症などの感染症に罹患しているマダイから血液を採取、血清、血球（白血球および赤血球）よりRNAを抽出し、次世代シーケンサーを用いて、血球中のncRNAの情報を網羅的に取得する。それらの情報を、BLAST解析等のバイオインフォマティクスを用いて、各RNAのストレス応答、代謝、免疫等に関する機能を予測する。それらの情報を基に、魚病の早期検出および健康状態の把握のための血液中ncRNA測定法の開発、および魚類の健康状態に関与する血液中ncRNAの変動の解析を進める予定である。

Causes of Carryover

研究代表者が妊娠・出産に伴う産休・育休を平成28年9月から平成29年5月まで取得し、研究を中断したため、次年度使用額が生じた。

Expenditure Plan for Carryover Budget

研究期間延長の申請をし、既に承認済みである。再開後のH29年度は助成金を請求せず、H28年度助成金を使用する予定であり、引き続き、健康なマダイおよびエドワジエラ症やイリドウイルス症などの感染症に罹患しているマダイから血液を採取、血清、血球（白血球および赤血球）よりRNAを抽出し、次世代シーケンサーを用いて、血球中のncRNAの情報を網羅的に取得する。それらの情報を、BLAST解析等のバイオインフォマティクスを用いて、各RNAのストレス応答、代謝、免疫等に関する機能を予測する予定である。